Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz hz 000103 A 0.00 0.11 0.05 G 0.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.10 000434 C 0.00 0.02 0.01 T 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001568 G 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 002210 + 0.00 0.23 0.32 - 0.00 0.77 0.68 0.00 0.35 0.44 002730 A 0.00 0.09 0.16 G 0.00 0.91 0.84 0.00 0.16 0.27 002815 C 0.00 0.00 0.02 T 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 005343 C 0.00 0.22 0.34 T 0.00 0.78 0.66 0.00 0.34 0.45 005484 T 0.00 0.48 0.24 G 0.00 0.52 0.76 0.00 0.50 0.36 005663 - 0.00 0.00 0.02 + 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 006185 T 0.00 0.11 0.05 G 0.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.10 006198 G 0.00 0.04 0.02 C 0.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 006227 A 0.00 0.22 0.34 G 0.00 0.78 0.66 0.00 0.34 0.45 006909 G 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007065 C 0.00 0.02 0.01 T 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007222 G 0.00 0.00 0.07 A 0.00 1.00 0.93 0.00 0.00 0.13 007388 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 007426 G 0.00 0.00 0.03 A 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.07 007711 G 0.00 0.07 0.16 T 0.00 0.93 0.84 0.00 0.12 0.26 007744 T 0.00 0.04 0.02 C 0.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 007793 G 0.00 0.00 0.02 A 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 007929 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 008899 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 009671 A 0.00 0.07 0.03 G 0.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 013809 T 0.00 0.05 0.02 C 0.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 013960 C 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 014047 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 014229 A 0.00 0.09 0.18 G 0.00 0.91 0.82 0.00 0.17 0.30 014342 A 0.00 0.02 0.01 T 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 014353 T 0.00 0.45 0.23 A 0.00 0.55 0.77 0.00 0.50 0.35 014615 G 0.00 0.00 0.02 T 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.05 014673 C 0.00 0.00 0.02 T 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.05 014683 A 0.00 0.02 0.03 C 0.00 0.98 0.97 0.00 0.04 0.07 014729 - 0.00 0.30 0.43 + 0.00 0.70 0.57 0.00 0.42 0.49 014769 A 0.00 0.19 0.18 G 0.00 0.81 0.82 0.00 0.31 0.29 014938 G 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016132 A 0.00 0.47 0.26 G 0.00 0.53 0.74 0.00 0.50 0.39 016741 A 0.00 0.00 0.02 T 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 016762 G 0.00 0.23 0.31 A 0.00 0.77 0.69 0.00 0.35 0.43 016882 G 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 016910 G 0.00 0.22 0.31 A 0.00 0.78 0.69 0.00 0.34 0.43 016977 - 0.00 0.00 0.01 + 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 017025 - 0.00 0.23 0.32 + 0.00 0.77 0.68 0.00 0.35 0.44 017130 A 0.00 0.24 0.30 T 0.00 0.76 0.70 0.00 0.36 0.42 017232 A 0.00 0.00 0.02 T 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.05 017724 T 0.00 0.00 0.06 C 0.00 1.00 0.94 0.00 0.00 0.11 018068 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.05 018106 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 018270 - 0.00 0.24 0.34 + 0.00 0.76 0.66 0.00 0.36 0.45 018274 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 018317 C 0.00 0.05 0.02 A 0.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 018415 T 0.00 0.07 0.09 C 0.00 0.93 0.91 0.00 0.13 0.16 018608 G 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 018760 A 0.00 0.23 0.32 G 0.00 0.77 0.68 0.00 0.35 0.43 019101 + 0.00 0.00 0.08 - 0.00 1.00 0.92 0.00 0.00 0.15 019251 G 0.00 0.15 0.23 C 0.00 0.85 0.77 0.00 0.26 0.36 019633 C 0.00 0.02 0.01 T 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019700 G 0.00 0.04 0.02 A 0.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 020917 - 0.00 0.57 0.38 + 0.00 0.43 0.62 0.00 0.49 0.47 021467 C 0.00 0.16 0.08 T 0.00 0.84 0.92 0.00 0.27 0.14 021550 T 0.00 0.23 0.26 C 0.00 0.77 0.74 0.00 0.35 0.39 021987 G 0.00 0.15 0.08 A 0.00 0.85 0.92 0.00 0.26 0.14 022451 A 0.00 0.54 0.34 C 0.00 0.46 0.66 0.00 0.50 0.45 022520 G 0.00 0.22 0.31 T 0.00 0.78 0.69 0.00 0.34 0.43 022537 A 0.00 0.00 0.06 G 0.00 1.00 0.94 0.00 0.00 0.12 023324 A 0.00 0.20 0.30 G 0.00 0.80 0.70 0.00 0.33 0.42 023583 A 0.00 0.02 0.01 G 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 023657 A 0.00 0.00 0.03 T 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.07 023835 C 0.00 0.00 0.02 A 0.00 0.55 0.37 G 0.00 0.45 0.61 0.00 0.50 0.01 024438 T 0.00 0.07 0.09 C 0.00 0.93 0.91 0.00 0.12 0.16 024603 C 0.00 0.00 0.03 G 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 024754 G 0.00 0.00 0.03 A 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 024822 A 0.00 0.50 0.25 G 0.00 0.50 0.75 0.00 0.50 0.38 024838 T 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 025893 A 0.00 0.20 0.30 G 0.00 0.80 0.70 0.00 0.33 0.42 025920 C 0.00 0.00 0.02 T 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 026064 A 0.00 0.22 0.31 G 0.00 0.78 0.69 0.00 0.34 0.43 026457 T 0.00 0.05 0.02 C 0.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 026891 C 0.00 0.52 0.35 T 0.00 0.48 0.65 0.00 0.50 0.46 026935 T 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 027077 G 0.00 0.00 0.07 A 0.00 1.00 0.93 0.00 0.00 0.14 027366 A 0.00 0.09 0.16 G 0.00 0.91 0.84 0.00 0.16 0.27 027402 T 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 028912 T 0.00 0.24 0.32 C 0.00 0.76 0.68 0.00 0.36 0.43 029879 + 0.00 0.26 0.34 - 0.00 0.74 0.66 0.00 0.39 0.45 029959 A 0.00 0.47 0.23 G 0.00 0.53 0.77 0.00 0.50 0.36 030109 C 0.00 0.14 0.19 A 0.00 0.86 0.81 0.00 0.24 0.31 030150 T 0.00 0.00 0.06 A 0.00 1.00 0.94 0.00 0.00 0.10 030230 T 0.00 0.00 0.05 A 0.00 1.00 0.95 0.00 0.00 0.10 030464 C 0.00 0.23 0.33 T 0.00 0.77 0.67 0.00 0.35 0.44 030523 G 0.00 0.23 0.32 A 0.00 0.77 0.68 0.00 0.35 0.44 031401 A 0.00 0.43 0.49 C 0.00 0.57 0.51 0.00 0.49 0.50 031402 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 031935 T 0.00 0.00 0.02 A 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 032042 G 0.00 0.00 0.08 A 0.00 1.00 0.92 0.00 0.00 0.14 032158 T 0.00 0.15 0.14 C 0.00 0.85 0.86 0.00 0.26 0.24 032179 T 0.00 0.00 0.06 C 0.00 1.00 0.94 0.00 0.00 0.12 032319 G 0.00 0.28 0.34 A 0.00 0.72 0.66 0.00 0.41 0.45 032607 G 0.00 0.00 0.03 A 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 032687 C 0.00 0.43 0.48 T 0.00 0.57 0.52 0.00 0.49 0.50 032694 C 0.00 0.15 0.14 G 0.00 0.85 0.86 0.00 0.26 0.24 032773 G 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 032810 G 0.00 0.15 0.14 T 0.00 0.85 0.86 0.00 0.26 0.24 033022 C 0.00 0.43 0.48 T 0.00 0.57 0.52 0.00 0.49 0.50 033039 + 0.00 0.15 0.14 - 0.00 0.85 0.86 0.00 0.26 0.24 034453 T 0.00 0.50 0.24 C 0.00 0.50 0.76 0.00 0.50 0.36 034556 C 0.00 0.02 0.01 G 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 034677 A 0.00 0.00 0.07 G 0.00 1.00 0.93 0.00 0.00 0.12 035338 A 0.00 0.00 0.07 G 0.00 1.00 0.93 0.00 0.00 0.12 035770 G 0.00 0.16 0.14 T 0.00 0.84 0.86 0.00 0.27 0.25 036310 G 0.00 0.43 0.48 A 0.00 0.57 0.52 0.00 0.49 0.50 036353 G 0.00 0.00 0.02 A 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 037543 C 0.00 0.00 0.05 T 0.00 1.00 0.95 0.00 0.00 0.10 038068 G 0.00 0.15 0.14 C 0.00 0.85 0.86 0.00 0.26 0.24 038411 A 0.00 0.02 0.01 G 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 038451 + 0.00 0.16 0.14 - 0.00 0.84 0.86 0.00 0.27 0.25 038699 C 0.00 0.26 0.34 G 0.00 0.74 0.66 0.00 0.39 0.45 038886 T 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 038946 T 0.00 0.16 0.14 C 0.00 0.84 0.86 0.00 0.27 0.25 038999 G 0.00 0.00 0.02 A 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 039570 G 0.00 0.15 0.07 A 0.00 0.85 0.93 0.00 0.26 0.14 042858 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 042932 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 042966 G 0.00 0.16 0.14 A 0.00 0.84 0.86 0.00 0.27 0.24 043286 A 0.00 0.09 0.17 G 0.00 0.91 0.83 0.00 0.17 0.29 043341 G 0.00 0.11 0.06 A 0.00 0.89 0.94 0.00 0.20 0.11 043457 G 0.00 0.16 0.14 A 0.00 0.84 0.86 0.00 0.27 0.24 044031 T 0.00 0.29 0.38 G 0.00 0.71 0.62 0.00 0.41 0.47 044231 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 044473 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 044625 A 0.00 0.30 0.41 T 0.00 0.70 0.59 0.00 0.42 0.48 045267 A 0.00 0.45 0.23 G 0.00 0.55 0.77 0.00 0.50 0.35 045351 C 0.00 0.00 0.02 T 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 045802 C 0.00 0.02 0.01 T 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 047068 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 047206 - 0.00 0.17 0.20 + 0.00 0.83 0.80 0.00 0.29 0.31 047463 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 047469 C 0.00 0.32 0.42 G 0.00 0.68 0.58 0.00 0.43 0.49 047664 A 0.00 0.32 0.42 G 0.00 0.68 0.58 0.00 0.43 0.49 047679 A 0.00 0.32 0.40 G 0.00 0.68 0.60 0.00 0.43 0.48 053992 T 0.00 0.00 0.06 C 0.00 1.00 0.94 0.00 0.00 0.10 054145 A 0.00 0.50 0.27 G 0.00 0.50 0.73 0.00 0.50 0.39 054295 A 0.00 0.50 0.34 G 0.00 0.50 0.66 0.00 0.50 0.45 054361 G 0.00 0.50 0.27 C 0.00 0.50 0.73 0.00 0.50 0.39 054381 - 0.00 0.50 0.33 + 0.00 0.50 0.67 0.00 0.50 0.44 054636 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 054711 - 0.00 0.02 0.01 + 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 055108 T 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 055216 T 0.00 0.59 0.46 C 0.00 0.41 0.54 0.00 0.48 0.50 055424 T 0.00 0.48 0.34 C 0.00 0.52 0.66 0.00 0.50 0.45 055463 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 055598 A 0.00 0.00 0.06 C 0.00 1.00 0.94 0.00 0.00 0.12 055651 A 0.00 0.00 0.07 G 0.00 1.00 0.93 0.00 0.00 0.14 055836 C 0.00 0.11 0.07 T 0.00 0.89 0.93 0.00 0.19 0.14 055897 T 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 056043 G 0.00 0.45 0.22 A 0.00 0.55 0.78 0.00 0.50 0.34 056117 A 0.00 0.02 0.01 G 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 056269 A 0.00 0.00 0.05 G 0.00 1.00 0.95 0.00 0.00 0.09 056848 G 0.00 0.11 0.05 C 0.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.10 057056 T 0.00 0.59 0.45 C 0.00 0.41 0.55 0.00 0.48 0.49 060254 C 0.00 0.00 0.02 T 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 060624 A 0.00 0.00 0.09 G 0.00 1.00 0.91 0.00 0.00 0.16 060868 A 0.00 0.11 0.06 C 0.00 0.89 0.94 0.00 0.19 0.12 060893 G 0.00 0.00 0.08 A 0.00 1.00 0.92 0.00 0.00 0.14 061192 T 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 061215 G 0.00 0.11 0.10 A 0.00 0.89 0.90 0.00 0.20 0.18 061607 G 0.00 0.00 0.02 A 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 061611 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 061672 A 0.00 0.00 0.03 G 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 061827 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 062566 C 0.00 0.00 0.02 T 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 062577 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 062594 A 0.00 0.00 0.04 G 0.00 1.00 0.96 0.00 0.00 0.08 062595 A 0.00 0.00 0.04 C 0.00 1.00 0.96 0.00 0.00 0.08 062668 C 0.00 0.59 0.36 T 0.00 0.41 0.64 0.00 0.48 0.46 062752 A 0.00 0.00 0.04 C 0.00 1.00 0.96 0.00 0.00 0.08 062807 C 0.00 0.11 0.12 T 0.00 0.89 0.88 0.00 0.19 0.21 062820 A 0.00 0.11 0.05 G 0.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.10 063534 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 063546 A 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 063613 G 0.00 0.00 0.05 C 0.00 1.00 0.95 0.00 0.00 0.10 068652 G 0.00 0.10 0.06 A 0.00 0.90 0.94 0.00 0.18 0.11 068778 T 0.00 0.00 0.02 A 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 068852 G 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 069751 G 0.00 0.00 0.03 A 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 069934 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 069971 A 0.00 0.11 0.11 G 0.00 0.89 0.89 0.00 0.19 0.19 070216 C 0.00 0.12 0.06 T 0.00 0.88 0.94 0.00 0.21 0.11 070392 T 0.00 0.03 0.01 A 0.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 070413 T 0.00 0.03 0.01 C 0.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 070547 A 0.00 0.11 0.12 G 0.00 0.89 0.88 0.00 0.19 0.21 070756 A 0.00 0.00 0.04 C 0.00 1.00 0.96 0.00 0.00 0.08 070788 T 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 071062 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 071129 A 0.00 0.05 0.02 G 0.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 071160 G 0.00 0.00 0.03 A 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.07 071432 + 0.00 0.00 0.01 - 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 071450 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 071532 A 0.00 0.14 0.20 G 0.00 0.86 0.80 0.00 0.24 0.32 071606 G 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 071651 C 0.00 0.36 0.38 T 0.00 0.64 0.62 0.00 0.46 0.47 071773 G 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 071853 C 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 072647 A 0.00 0.07 0.03 C 0.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 074476 A 0.00 0.41 0.31 G 0.00 0.59 0.69 0.00 0.48 0.43 074909 A 0.00 0.12 0.06 G 0.00 0.88 0.94 0.00 0.21 0.11 075132 T 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 075661 G 0.00 0.00 0.02 A 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 075874 T 0.00 0.00 0.07 C 0.00 1.00 0.93 0.00 0.00 0.12 076106 A 0.00 0.02 0.01 G 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 076157 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 076274 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 076354 G 0.00 0.14 0.25 A 0.00 0.86 0.75 0.00 0.24 0.38 076367 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 076749 T 0.00 0.13 0.18 C 0.00 0.87 0.82 0.00 0.23 0.30 077324 A 0.00 0.00 0.07 G 0.00 1.00 0.93 0.00 0.00 0.14 077429 G 0.00 0.24 0.44 C 0.00 0.76 0.56 0.00 0.36 0.49 077451 A 0.00 0.13 0.24 G 0.00 0.87 0.76 0.00 0.23 0.37 077732 A 0.00 0.00 0.07 G 0.00 1.00 0.93 0.00 0.00 0.14 078218 + 0.00 0.15 0.26 - 0.00 0.85 0.74 0.00 0.26 0.39 078340 T 0.00 0.00 0.07 C 0.00 1.00 0.93 0.00 0.00 0.12 078385 C 0.00 0.02 0.01 T 0.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 078402 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 078767 G 0.00 0.00 0.03 C 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 078915 A 0.00 0.00 0.06 T 0.00 1.00 0.94 0.00 0.00 0.12 080151 C 0.00 0.00 0.02 T 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 080179 - 0.00 0.11 0.36 + 0.00 0.89 0.64 0.00 0.20 0.46 080466 A 0.00 0.00 0.04 G 0.00 1.00 0.96 0.00 0.00 0.07 080629 T 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 080691 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 080830 G 0.00 0.05 0.02 A 0.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 080840 A 0.00 0.11 0.05 G 0.00 0.89 0.95 0.00 0.20 0.10 081045 A 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 081163 C 0.00 0.11 0.17 T 0.00 0.89 0.83 0.00 0.20 0.29 081299 G 0.00 0.11 0.17 A 0.00 0.89 0.83 0.00 0.20 0.29 081337 G 0.00 0.25 0.42 T 0.00 0.75 0.58 0.00 0.38 0.49 081918 C 0.00 0.00 0.04 T 0.00 1.00 0.96 0.00 0.00 0.08 082642 - 0.00 0.00 0.01 + 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 082886 + 0.00 0.10 0.15 - 0.00 0.90 0.85 0.00 0.17 0.26 083092 T 0.00 0.10 0.34 C 0.00 0.90 0.66 0.00 0.18 0.45 083262 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 083313 T 0.00 0.00 0.09 G 0.00 1.00 0.91 0.00 0.00 0.16 083755 - 0.00 0.00 0.03 + 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.07 083811 A 0.00 0.05 0.10 G 0.00 0.95 0.90 0.00 0.09 0.18 083866 A 0.00 0.00 0.05 G 0.00 1.00 0.95 0.00 0.00 0.09 083932 G 0.00 0.00 0.10 A 0.00 1.00 0.90 0.00 0.00 0.18 083946 C 0.00 0.14 0.33 T 0.00 0.86 0.67 0.00 0.24 0.44 087747 + 0.00 0.07 0.03 - 0.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 087775 A 0.00 0.00 0.06 G 0.00 1.00 0.94 0.00 0.00 0.12 087824 T 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 087843 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 087916 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 088355 G 0.00 0.04 0.10 A 0.00 0.96 0.90 0.00 0.08 0.17 088471 C 0.00 0.09 0.10 T 0.00 0.91 0.90 0.00 0.17 0.18 088529 A 0.00 0.05 0.08 G 0.00 0.95 0.92 0.00 0.09 0.15 088574 C 0.00 0.09 0.05 A 0.00 0.91 0.95 0.00 0.17 0.09 088724 A 0.00 0.09 0.09 G 0.00 0.91 0.91 0.00 0.17 0.16 088872 + 0.00 0.00 0.11 - 0.00 1.00 0.89 0.00 0.00 0.20 088962 G 0.00 0.00 0.11 A 0.00 1.00 0.89 0.00 0.00 0.20 088977 T 0.00 0.09 0.21 C 0.00 0.91 0.79 0.00 0.17 0.33 089993 C 0.00 0.13 0.34 T 0.00 0.87 0.66 0.00 0.23 0.45 090122 G 0.00 0.00 0.03 A 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 090263 T 0.00 0.00 0.04 C 0.00 1.00 0.96 0.00 0.00 0.08 090487 - 0.00 0.00 0.02 + 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 090890 C 0.00 0.00 0.13 G 0.00 1.00 0.87 0.00 0.00 0.23 090967 T 0.00 0.09 0.10 C 0.00 0.91 0.90 0.00 0.17 0.18 091022 G 0.00 0.00 0.02 T 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 091091 T 0.00 0.09 0.22 C 0.00 0.91 0.78 0.00 0.16 0.35 091111 T 0.00 0.13 0.34 G 0.00 0.87 0.66 0.00 0.23 0.45 091150 G 0.00 0.52 0.26 A 0.00 0.48 0.74 0.00 0.50 0.38 091389 G 0.00 0.00 0.09 A 0.00 1.00 0.91 0.00 0.00 0.16 091451 A 0.00 0.09 0.04 G 0.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 091489 C 0.00 0.00 0.09 G 0.00 1.00 0.91 0.00 0.00 0.16 091720 - 0.00 0.00 0.02 + 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 092073 - 0.00 0.00 0.01 + 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 092142 + 0.00 0.13 0.34 - 0.00 0.87 0.66 0.00 0.23 0.45 092307 C 0.00 0.09 0.04 T 0.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 092354 C 0.00 0.27 0.20 T 0.00 0.73 0.80 0.00 0.40 0.33 092775 T 0.00 0.05 0.08 C 0.00 0.95 0.92 0.00 0.09 0.15 092853 T 0.00 0.09 0.05 C 0.00 0.91 0.95 0.00 0.17 0.09 092932 - 0.00 0.14 0.32 + 0.00 0.86 0.68 0.00 0.24 0.44 093614 A 0.00 0.13 0.34 T 0.00 0.87 0.66 0.00 0.23 0.45 093657 + 0.00 0.00 0.13 - 0.00 1.00 0.87 0.00 0.00 0.22 093963 T 0.00 0.00 0.13 A 0.00 1.00 0.87 0.00 0.00 0.22 094020 G 0.00 0.00 0.09 A 0.00 1.00 0.91 0.00 0.00 0.17 094188 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 094245 T 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 094666 A 0.00 0.00 0.03 G 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 095168 T 0.00 0.13 0.34 C 0.00 0.87 0.66 0.00 0.23 0.45 095180 G 0.00 0.00 0.02 A 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 095489 T 0.00 0.09 0.23 G 0.00 0.91 0.77 0.00 0.17 0.35 095920 T 0.00 0.00 0.12 A 0.00 1.00 0.88 0.00 0.00 0.22 095932 C 0.00 0.00 0.12 G 0.00 1.00 0.88 0.00 0.00 0.22 095940 A 0.00 0.09 0.10 G 0.00 0.91 0.90 0.00 0.16 0.18 096332 T 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 096663 T 0.00 0.13 0.43 G 0.00 0.87 0.57 0.00 0.23 0.49 097114 T 0.00 0.13 0.42 G 0.00 0.87 0.58 0.00 0.23 0.49 097220 - 0.00 0.00 0.01 + 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 097663 G 0.00 0.14 0.33 A 0.00 0.86 0.67 0.00 0.24 0.44 097762 T 0.00 0.00 0.07 A 0.00 1.00 0.93 0.00 0.00 0.13 097822 G 0.00 0.13 0.34 A 0.00 0.87 0.66 0.00 0.23 0.45 097954 T 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 098280 T 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 098346 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 098400 G 0.00 0.09 0.10 A 0.00 0.91 0.90 0.00 0.16 0.18 098552 G 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 098597 C 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 098799 G 0.00 0.00 0.03 T 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 099007 A 0.00 0.50 0.23 G 0.00 0.50 0.77 0.00 0.50 0.36 099016 A 0.00 0.00 0.13 G 0.00 1.00 0.87 0.00 0.00 0.23 099065 T 0.00 0.00 0.03 C 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 099167 T 0.00 0.00 0.06 C 0.00 1.00 0.94 0.00 0.00 0.12 099213 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.03 099216 G 0.00 0.06 0.42 A 0.00 0.94 0.58 0.00 0.11 0.49 099293 + 0.00 0.10 0.10 - 0.00 0.90 0.90 0.00 0.17 0.18 099337 G 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 100024 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 100064 A 0.00 0.02 0.01 G 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 100109 C 0.00 0.00 0.11 T 0.00 1.00 0.89 0.00 0.00 0.20 100507 T 0.00 0.07 0.23 C 0.00 0.93 0.77 0.00 0.13 0.35 101022 + 0.00 0.04 0.02 - 0.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 101173 G 0.00 0.00 0.13 C 0.00 1.00 0.87 0.00 0.00 0.22 101324 C 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 101344 G 0.00 0.05 0.08 C 0.00 0.95 0.92 0.00 0.09 0.15 101596 - 0.00 0.00 0.02 + 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 101622 A 0.00 0.00 0.03 G 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.07 Note: ED : European Descent AD : African Descent pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002210: T 005663: C 014729: AGCTAC 016977: TGTT 017025: A 018270: GGAA 019101: GT 020917: GTAA 029879: AT 033039: T 038451: A 047206: T 054381: A 054711: G 071432: A 078218: T 080179: GTTT 082642: CCT 082886: TAATTATTTAAGTTAATTATTTAAAGACTT 083755: G 087747: TTTG 088872: T 090487: G 091720: A 092073: A 092142: T 092932: C 093657: A 097220: CT 099293: A 101022: G 101596: T