Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000834 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 22 43 0.048 0.000 0.023 000836 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 22 43 0.048 0.000 0.023 000963 GG 0 7 7 GT 2 10 12 TT 21 5 26 0.048 0.153 5.543 001014 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 18 22 40 0.220 0.000 0.100 001883 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 22 21 43 0.000 0.012 0.006 001975 CC 20 22 42 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.024 002190 GG 15 22 37 GT 4 0 4 TT 2 0 2 3.070 0.000 8.658 002278 AA 20 22 42 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 002302 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 19 21 40 0.053 0.000 0.025 002313 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 20 21 41 0.012 0.000 0.006 002422 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 20 20 40 0.012 0.000 0.006 002526 GG 2 3 5 GT 9 8 17 TT 9 7 16 0.013 0.076 0.021 002527 GG 9 7 16 GT 9 9 18 TT 2 3 5 0.013 0.001 0.000 002528 AA 9 7 16 AG 9 10 19 GG 2 3 5 0.013 0.035 0.031 002599 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 22 21 43 0.011 0.000 0.006 002933 -- 4 0 4 +- 10 6 16 ++ 10 13 23 0.296 0.668 0.244 002937 CC 4 0 4 CT 10 6 16 TT 10 14 24 0.296 0.623 0.306 002945 CC 0 0 0 CG 5 0 5 GG 19 20 39 0.324 0.000 0.160 002976 AA 2 0 2 AG 4 0 4 GG 18 20 38 3.840 0.000 8.910 003413 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 003646 -- 11 23 34 +- 11 0 11 ++ 1 0 1 0.741 0.000 0.010 003727 CC 0 1 1 CT 3 7 10 TT 20 15 35 0.112 0.025 0.080 003739 AA 0 0 0 AG 8 0 8 GG 14 23 37 1.086 0.000 0.428 004121 AA 14 10 24 AG 10 7 17 GG 0 2 2 1.662 0.207 0.217 004268 CC 19 10 29 CG 3 7 10 GG 0 0 0 0.118 1.143 0.843 004453 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 004577 AA 23 13 36 AC 1 10 11 CC 0 0 0 0.011 1.775 0.826 004613 AA 2 0 2 AG 7 3 10 GG 15 20 35 0.730 0.112 1.214 004721 AA 0 0 0 AG 2 4 6 GG 21 19 40 0.048 0.209 0.224 005815 -- 0 0 0 +- 1 4 5 ++ 20 14 34 0.012 0.281 0.183 006366 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 19 22 41 0.209 0.000 0.097 006379 CC 21 10 31 CT 2 12 14 TT 0 0 0 0.048 3.094 1.527 006462 CC 19 22 41 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.209 0.000 0.097 006572 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 23 44 0.048 0.000 0.023 007048 AA 19 18 37 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.013 0.000 0.007 007071 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 20 18 38 0.050 0.000 0.026 007446 AA 0 0 0 AC 8 3 11 CC 16 19 35 0.960 0.118 0.848 007464 AA 24 21 45 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 008623 CC 23 20 43 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.023 008870 AA 0 0 0 AG 0 6 6 GG 20 15 35 0.000 0.583 0.256 008873 AA 0 0 0 AT 0 6 6 TT 20 15 35 0.000 0.583 0.256 009147 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 009259 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 22 45 0.000 0.011 0.006 009367 AA 1 0 1 AG 7 5 12 GG 15 18 33 0.025 0.342 0.006 009396 CC 22 12 34 CT 0 11 11 TT 0 0 0 0.000 2.272 0.872 009483 CC 16 12 28 CG 3 11 14 GG 0 0 0 0.140 2.272 1.680 010700 CC 10 10 20 CT 12 13 25 TT 2 0 2 0.375 3.569 2.860 010940 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 010969 AA 12 16 28 AT 11 7 18 TT 0 0 0 2.272 0.741 2.722 011164 AA 0 0 0 AG 0 6 6 GG 24 17 41 0.000 0.517 0.218 011588 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 011710 CC 16 19 35 CT 5 0 5 TT 1 0 1 0.499 0.000 1.967 011876 AA 0 0 0 AC 1 5 6 CC 23 13 36 0.011 0.468 0.249 011975 GG 22 21 43 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.023 012954 AA 1 0 1 AG 7 2 9 GG 15 21 36 0.025 0.048 0.230 013199 -- 11 16 27 +- 10 7 17 ++ 2 0 2 0.017 0.741 0.110 013407 AA 0 0 0 AG 7 0 7 GG 17 23 40 0.700 0.000 0.304 013454 AA 2 0 2 AG 6 0 6 GG 16 23 39 1.407 0.000 5.074 013563 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 013573 AA 1 0 1 AC 8 2 10 CC 15 21 36 0.003 0.048 0.094 013588 AA 0 0 0 AG 1 7 8 GG 23 16 39 0.011 0.741 0.407 013612 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 013842 GG 4 10 14 GT 14 12 26 TT 6 1 7 0.734 1.239 0.813 014342 CC 10 10 20 CT 11 11 22 TT 0 0 0 2.644 2.644 5.288 014989 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 22 44 0.045 0.000 0.023 014991 CC 22 22 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.023 015095 CC 22 22 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.023 015590 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 015740 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 21 23 44 0.012 0.000 0.006 015834 AA 20 23 43 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.023 015845 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 016182 AA 0 2 2 AC 3 2 5 CC 21 12 33 0.107 5.565 5.596 016337 CC 22 20 42 CT 2 1 3 TT 0 0 0 0.045 0.012 0.054 016364 AA 0 1 1 AG 5 6 11 GG 17 9 26 0.362 0.000 0.016 016366 CC 22 21 43 CT 2 1 3 TT 0 0 0 0.045 0.012 0.052 017549 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 18 21 39 0.055 0.000 0.026 017992 AA 20 20 40 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.050 0.025 018377 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 018470 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 1 0 1 9.967 0.000 20.206 018620 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 018819 GG 22 23 45 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 019008 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 18 19 37 0.055 0.000 0.027 019295 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 17 23 40 0.233 0.000 0.100 019473 -- 0 0 0 +- 0 3 3 ++ 20 19 39 0.000 0.118 0.058 019590 CC 0 2 2 CT 5 7 12 TT 16 10 26 0.383 0.207 0.156 019889 CC 18 21 39 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.006 019890 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 15 21 36 0.263 0.000 0.111 019910 CC 0 0 0 CT 1 1 2 TT 18 20 38 0.014 0.012 0.026 020064 CC 0 2 2 CT 5 8 13 TT 14 12 26 0.436 0.153 0.051 020207 CC 17 20 37 CG 6 2 8 GG 0 0 0 0.517 0.050 0.428 020416 AA 1 3 4 AG 7 10 17 GG 14 9 23 0.011 0.007 0.111 020505 CC 14 9 23 CG 8 10 18 GG 2 3 5 0.296 0.007 0.265 020514 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 17 22 39 0.131 0.000 0.058 020620 CC 12 9 21 CT 7 11 18 TT 1 3 4 0.000 0.016 0.003 020640 CC 1 3 4 CG 7 11 18 GG 12 9 21 0.000 0.016 0.003 020772 GG 14 9 23 GT 8 11 19 TT 2 3 5 0.296 0.016 0.130 020824 CC 2 3 5 CG 8 11 19 GG 14 9 23 0.296 0.016 0.130 020846 CC 2 3 5 CT 8 11 19 TT 14 9 23 0.296 0.016 0.130 020874 CC 14 9 23 CT 8 11 19 TT 2 3 5 0.296 0.016 0.130 020883 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 020924 CC 2 3 5 CT 8 11 19 TT 14 9 23 0.296 0.016 0.130 020937 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 020982 AA 14 9 23 AG 8 11 19 GG 2 3 5 0.296 0.016 0.130 020985 CC 2 3 5 CT 12 11 23 TT 10 9 19 0.375 0.016 0.258 021027 CC 14 9 23 CT 8 11 19 TT 2 3 5 0.296 0.016 0.130 021053 AA 0 0 0 AC 5 4 9 CC 19 19 38 0.324 0.209 0.527 021149 CC 2 3 5 CT 8 11 19 TT 14 9 23 0.296 0.016 0.130 023669 CC 20 23 43 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.023 023703 CC 0 2 2 CG 7 9 16 GG 16 12 28 0.741 0.028 0.023 024189 CC 19 20 39 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.118 0.000 0.058 024208 CC 19 17 36 CT 3 2 5 TT 0 1 1 0.118 3.951 2.047 024235 AA 0 2 2 AT 2 0 2 TT 20 17 37 0.050 19.000 16.812 024525 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 22 16 38 0.000 0.016 0.007 024833 AA 16 9 25 AC 6 11 17 CC 2 3 5 1.407 0.016 0.639 025072 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 025099 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 025226 CC 19 23 42 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 025256 CC 18 12 30 CT 6 9 15 TT 0 2 2 0.490 0.028 0.005 025447 -- 15 9 24 +- 7 11 18 ++ 2 3 5 0.730 0.016 0.335 025722 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 22 23 45 0.011 0.000 0.006 025751 AA 2 6 8 AC 5 8 13 CC 16 9 25 2.200 1.965 5.487 025752 AA 14 9 23 AG 6 8 14 GG 3 6 9 2.407 1.965 4.984 025838 CC 2 6 8 CT 7 8 15 TT 15 9 24 0.730 1.965 3.633 025879 AA 19 19 38 AG 5 4 9 GG 0 0 0 0.324 0.209 0.527 025884 CC 2 6 8 CT 7 8 15 TT 15 8 23 0.730 1.564 3.359 025974 CC 2 3 5 CT 7 11 18 TT 15 9 24 0.730 0.016 0.335 025982 AA 15 9 24 AC 7 10 17 CC 2 3 5 0.730 0.007 0.545 026076 CC 2 3 5 CT 7 10 17 TT 15 9 24 0.730 0.007 0.545 026116 CC 14 9 23 CG 6 10 16 GG 1 3 4 0.114 0.007 0.244 026177 AA 0 2 2 AG 6 8 14 GG 17 12 29 0.517 0.153 0.035 026331 CC 16 9 25 CT 5 10 15 TT 2 3 5 2.200 0.007 1.289 026495 CC 11 8 19 CT 11 9 20 TT 1 3 4 0.741 0.032 0.150 026520 CC 21 20 41 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.024 026578 CC 4 7 11 CG 11 10 21 GG 8 3 11 0.004 0.035 0.023 026629 GG 18 20 38 GT 5 2 7 TT 0 0 0 0.342 0.050 0.320 027159 CC 12 5 17 CT 11 13 24 TT 1 4 5 0.618 0.747 0.659 027196 -- 23 22 45 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.006 027678 CC 7 4 11 CG 12 12 24 GG 4 5 9 0.087 0.444 0.382 027800 -- 23 23 46 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.005 028281 CC 20 21 41 CT 4 2 6 TT 0 0 0 0.198 0.048 0.218 028417 CC 19 18 37 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.053 0.000 0.027 028423 AA 21 16 37 AC 2 2 4 CC 0 0 0 0.048 0.062 0.108 028433 CC 12 4 16 CT 10 10 20 TT 1 4 5 0.374 0.222 0.108 028473 CC 12 12 24 CT 9 5 14 TT 0 1 1 1.562 0.231 0.396 028483 CC 22 17 39 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.015 0.006 028521 AA 20 16 36 AC 2 2 4 CC 0 0 0 0.050 0.062 0.111 028537 -- 0 0 0 +- 6 3 9 ++ 16 15 31 0.548 0.149 0.643 028609 CC 16 16 32 CT 6 2 8 TT 0 0 0 0.548 0.062 0.494 028697 CC 2 0 2 CT 10 4 14 TT 10 14 24 0.050 0.281 0.001 028735 AA 15 18 33 AC 4 0 4 CC 2 0 2 3.070 0.000 7.649 028795 AA 11 4 15 AG 10 10 20 GG 1 4 5 0.468 0.222 0.178 028859 CC 20 18 38 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.026 028997 CC 2 0 2 CT 8 1 9 TT 12 16 28 0.153 0.016 1.117 029026 CC 20 16 36 CG 2 2 4 GG 0 0 0 0.050 0.062 0.111 029044 CC 2 0 2 CT 8 2 10 TT 12 16 28 0.153 0.062 0.720 029109 AA 4 3 7 AG 11 13 24 GG 9 7 16 0.042 0.631 0.170 029293 CC 14 20 34 CT 7 3 10 TT 2 0 2 0.616 0.112 1.141 029363 CC 18 20 38 CT 5 3 8 TT 0 0 0 0.342 0.112 0.417 029407 CC 18 20 38 CT 5 3 8 TT 0 0 0 0.342 0.112 0.417 029440 CC 18 20 38 CT 5 3 8 TT 0 0 0 0.342 0.112 0.417 029517 CC 18 22 40 CT 6 1 7 TT 0 0 0 0.490 0.011 0.304 029868 -- 23 23 46 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.005 029885 CC 14 20 34 CG 8 3 11 GG 2 0 2 0.296 0.112 0.763 029891 AA 2 0 2 AT 8 3 11 TT 14 20 34 0.296 0.112 0.763 030169 AA 17 17 34 AG 3 3 6 GG 0 0 0 0.131 0.131 0.263 030238 CC 0 0 0 CT 4 3 7 TT 16 17 33 0.247 0.131 0.368 030360 AA 0 0 0 AG 4 2 6 GG 16 17 33 0.247 0.059 0.271 030415 CC 18 19 37 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.055 0.000 0.027 030728 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 030729 AA 0 0 0 AG 5 3 8 GG 19 20 39 0.324 0.112 0.407 030756 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 030887 CC 0 0 0 CT 2 3 5 TT 19 20 39 0.053 0.112 0.160 031050 CC 19 17 36 CT 5 3 8 TT 0 0 0 0.324 0.131 0.440 031147 CC 19 18 37 CT 5 3 8 TT 0 0 0 0.324 0.124 0.428 031257 AA 14 17 31 AC 8 3 11 CC 2 0 2 0.296 0.131 0.592 031260 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 20 42 0.045 0.000 0.024 031320 CC 24 19 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.013 0.006 031531 AA 0 0 0 AG 1 2 3 GG 23 18 41 0.011 0.055 0.055 031547 CC 22 20 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 031555 CC 22 18 40 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 031556 AA 0 0 0 AG 5 3 8 GG 18 15 33 0.342 0.149 0.479 031699 CC 0 0 0 CG 5 3 8 GG 19 20 39 0.324 0.112 0.407 031707 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 031715 AA 0 0 0 AG 5 3 8 GG 19 20 39 0.324 0.112 0.407 031876 AA 16 20 36 AG 4 3 7 GG 0 0 0 0.247 0.112 0.338 031910 AA 0 0 0 AG 4 3 7 GG 18 20 38 0.220 0.112 0.320 031935 CC 0 0 0 CT 4 3 7 TT 18 20 38 0.220 0.112 0.320 031937 CC 0 0 0 CT 4 3 7 TT 18 20 38 0.220 0.112 0.320 031939 CC 0 0 0 CT 4 3 7 TT 18 20 38 0.220 0.112 0.320 032068 AA 19 17 36 AC 3 6 9 CC 0 0 0 0.118 0.517 0.556 032110 AA 0 0 0 AG 4 3 7 GG 18 20 38 0.220 0.112 0.320 032188 CC 20 23 43 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.023 032220 CC 8 7 15 CT 10 13 23 TT 4 3 7 0.079 0.631 0.139 032221 CC 0 0 0 CG 4 3 7 GG 18 20 38 0.220 0.112 0.320 032266 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 20 23 43 0.050 0.000 0.023 032405 AA 19 20 39 AT 5 3 8 TT 0 0 0 0.324 0.112 0.407 032437 AA 19 20 39 AC 5 3 8 CC 0 0 0 0.324 0.112 0.407 032546 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 032682 AA 18 20 38 AG 5 3 8 GG 0 0 0 0.342 0.112 0.417 032701 CC 19 23 42 CT 2 0 2 TT 2 0 2 8.746 0.000 19.043 032756 CC 0 0 0 CT 5 3 8 TT 18 20 38 0.342 0.112 0.417 032819 CC 19 22 41 CT 2 0 2 TT 1 0 1 4.455 0.000 9.977 032827 CC 0 0 0 CT 5 3 8 TT 17 19 36 0.362 0.118 0.440 033174 CC 0 0 0 CT 3 3 6 TT 20 17 37 0.112 0.131 0.242 033194 * 033279 AA 2 0 2 AG 2 0 2 GG 20 22 42 9.197 0.000 19.043 033374 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 19 17 36 0.013 0.000 0.007 033524 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 24 21 45 0.000 0.012 0.006 033616 AA 10 7 17 AG 10 10 20 GG 4 4 8 0.296 0.016 0.247 033639 AA 0 0 0 AG 7 1 8 GG 16 20 36 0.741 0.012 0.440 033821 GG 9 7 16 GT 9 10 19 TT 3 4 7 0.093 0.016 0.112 033918 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 19 40 0.012 0.000 0.006 034281 AA 4 9 13 AG 12 9 21 GG 7 5 12 0.087 0.857 0.344 034390 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 20 23 43 0.112 0.000 0.052 034413 AA 7 5 12 AG 12 9 21 GG 4 9 13 0.087 0.857 0.344 034480 CC 19 23 42 CG 3 0 3 GG 1 0 1 2.457 0.000 6.146 034483 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 23 22 45 0.000 0.011 0.006 034535 AA 0 2 2 AG 11 12 23 GG 12 9 21 2.272 0.517 1.946 034667 AA 4 9 13 AG 12 8 20 GG 8 5 13 0.020 1.352 0.783 034769 CC 8 5 13 CG 12 8 20 GG 4 9 13 0.020 1.352 0.783 034885 CC 20 23 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 034913 CC 4 9 13 CT 10 9 19 TT 7 5 12 0.016 0.857 0.813 035086 CC 7 5 12 CT 10 7 17 TT 4 8 12 0.016 1.612 1.195 035164 CC 7 5 12 CT 10 7 17 TT 4 9 13 0.016 1.995 1.516 035267 CC 8 5 13 CG 12 8 20 GG 4 9 13 0.020 1.352 0.783 035347 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 035532 GG 21 18 39 GT 3 3 6 TT 0 1 1 0.107 2.296 1.467 035538 CC 4 9 13 CT 12 8 20 TT 8 5 13 0.020 1.352 0.783 035548 CC 4 9 13 CT 12 8 20 TT 8 5 13 0.020 1.352 0.783 036021 AA 0 0 0 AG 5 5 10 GG 18 18 36 0.342 0.342 0.684 036176 AA 1 0 1 AG 3 0 3 GG 18 22 40 2.296 0.000 5.825 036406 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 22 43 0.012 0.000 0.006 036488 AA 0 0 0 AC 3 0 3 CC 19 23 42 0.118 0.000 0.054 036591 CC 20 20 40 CT 2 3 5 TT 0 0 0 0.050 0.112 0.156 036697 CC 7 9 16 CG 12 9 21 GG 3 4 7 0.362 0.414 0.001 036735 AA 4 4 8 AG 12 11 23 GG 8 6 14 0.020 0.069 0.075 036750 AA 0 0 0 AT 0 3 3 TT 24 19 43 0.000 0.118 0.052 036863 CC 3 1 4 CG 7 4 11 GG 14 16 30 1.642 1.037 3.187 036947 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 20 22 42 0.112 0.000 0.054 036957 CC 2 0 2 CG 4 3 7 GG 17 19 36 3.584 0.118 3.404 037287 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 15 38 0.011 0.000 0.007 037376 CC 13 9 22 CG 6 10 16 GG 4 2 6 3.390 0.107 1.153 037450 CC 20 18 38 CG 3 3 6 GG 0 0 0 0.112 0.124 0.236 037827 CC 20 21 41 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.024 038089 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 038161 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 19 40 0.012 0.000 0.006 038383 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 19 41 0.011 0.000 0.006 038483 CC 19 16 35 CT 4 2 6 TT 0 1 1 0.209 3.698 1.229 038538 CC 0 1 1 CT 6 2 8 TT 17 16 33 0.517 3.698 0.355 038834 AA 7 2 9 AG 9 11 20 GG 8 10 18 1.484 0.179 0.638 038908 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 038926 CC 0 1 1 CT 6 2 8 TT 17 20 37 0.517 4.707 0.483 038931 CC 18 20 38 CT 5 2 7 TT 0 1 1 0.342 4.707 0.875 039058 AA 0 0 0 AG 2 3 5 GG 22 20 42 0.045 0.112 0.148 039069 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 039536 CC 20 20 40 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 039654 CC 20 21 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 039727 CC 8 9 17 CG 8 11 19 GG 5 1 6 1.037 1.068 0.034 039807 CC 23 21 44 CT 1 1 2 TT 0 1 1 0.011 9.521 10.729 040019 -- 0 1 1 +- 1 1 2 ++ 22 21 43 0.011 9.521 10.478 040124 AA 22 21 43 AC 0 0 0 CC 0 1 1 0.000 22.000 44.000 040147 -- 6 2 8 +- 10 11 21 ++ 8 10 18 0.621 0.179 0.193 040310 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 18 41 0.011 0.000 0.006 040690 CC 18 18 36 CT 4 2 6 TT 0 1 1 0.220 4.203 1.288 041130 AA 19 20 39 AG 5 2 7 GG 0 1 1 0.324 4.707 0.919 041251 CC 18 19 37 CT 6 3 9 TT 0 1 1 0.490 2.457 0.253 041744 AA 9 5 14 AG 8 8 16 GG 5 8 13 1.352 1.037 2.805 041753 AA 7 6 13 AC 4 3 7 CC 10 13 23 7.843 10.674 18.493 042171 AA 0 1 1 AG 1 1 2 GG 21 21 42 0.012 9.521 10.228 042908 AA 0 1 1 AG 1 1 2 GG 22 20 42 0.011 9.075 10.228 043078 GG 22 23 45 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 043103 CC 22 21 43 CT 1 1 2 TT 0 1 1 0.011 9.521 10.478 043118 AA 5 5 10 AG 8 8 16 GG 4 6 10 0.052 0.460 0.444 043169 CC 19 19 38 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.013 0.000 0.007 043170 AA 4 6 10 AG 9 8 17 GG 7 5 12 0.126 0.460 0.618 043321 AA 0 0 0 AG 6 8 14 GG 14 11 25 0.623 1.351 1.866 043810 GG 21 14 35 GT 3 6 9 TT 0 3 3 0.107 2.407 3.846 043928 CC 5 7 12 CT 10 9 19 TT 8 6 14 0.306 0.714 1.066 044059 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 044186 CC 20 20 40 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 044207 CC 17 17 34 CT 6 2 8 TT 0 1 1 0.517 3.951 0.386 044566 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 044692 CC 4 5 9 CT 12 10 22 TT 7 7 14 0.087 0.153 0.004 044882 CC 22 20 42 CT 0 0 0 TT 0 1 1 0.000 21.000 43.000 044949 CC 20 21 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 045206 AA 1 0 1 AG 6 0 6 GG 16 17 33 0.195 0.000 1.111 045444 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 21 43 0.011 0.000 0.006 045522 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 20 44 0.000 0.012 0.006 045796 GG 22 21 43 GT 0 1 1 TT 0 1 1 0.000 9.521 19.316 045850 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 046001 CC 19 19 38 CG 3 3 6 GG 0 1 1 0.118 2.457 1.407 046239 GG 0 2 2 GT 9 6 15 TT 12 12 24 1.562 0.800 0.031 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002933: c 003646: CCTTCCCTGAGACCCCACCCCTTCtgaGAcTCCTCCCCTTCTGAGTCCCTC 005815: cc 007071: g 013199: GTTT 015740: a 019473: G 025447: A 027196: CAAAAA 027800: A 028537: GCTCTTCATGAGACCCCGCCTCTCCTCAAGGCCATGCCCATCCCCTGAGGGCCCCCCACCTCTTCTCAAGGCCACGCCCTCTGAGGCCCTGACTCCTCCCAGGCCAGGCTCTTCATGAGACCCCGCCTCTCCTCAAGGCCATGCCCATCCCCTGAGGGCCTCCCACCTCTTCTCAAGGCCACGCCCTCTGAGGCCCTGACTCCTCCCAGGCCAG 029868: g 033524: at 037287: G 040019: c 040147: T Tri-allelic sites: Site Genotype AD-pop ED-pop Total-pop 033194 AA 1 0 1 033194 AC 1 0 1 033194 AG 0 0 0 033194 CC 16 17 33 033194 CG 5 3 8 033194 GG 0 0 0