Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000834 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000836 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000963 G 0.04 0.55 0.29 T 0.96 0.45 0.71 0.08 0.50 0.41 001014 A 0.09 0.00 0.05 G 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 001883 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001975 G 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 002190 T 0.19 0.00 0.09 G 0.81 1.00 0.91 0.31 0.00 0.17 002278 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002302 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 002313 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002422 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002526 G 0.33 0.39 0.36 T 0.68 0.61 0.64 0.44 0.48 0.46 002527 T 0.33 0.39 0.36 G 0.68 0.61 0.64 0.44 0.48 0.46 002528 G 0.33 0.40 0.36 A 0.68 0.60 0.64 0.44 0.48 0.46 002599 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002933 - 0.38 0.16 0.28 + 0.62 0.84 0.72 0.47 0.27 0.40 002937 C 0.38 0.15 0.27 T 0.62 0.85 0.73 0.47 0.26 0.40 002945 C 0.10 0.00 0.06 G 0.90 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 002976 A 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.17 003413 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003646 + 0.28 0.00 0.14 - 0.72 1.00 0.86 0.41 0.00 0.24 003727 C 0.07 0.20 0.13 T 0.93 0.80 0.87 0.12 0.31 0.23 003739 A 0.18 0.00 0.09 G 0.82 1.00 0.91 0.30 0.00 0.16 004121 G 0.21 0.29 0.24 A 0.79 0.71 0.76 0.33 0.41 0.37 004268 G 0.07 0.21 0.13 C 0.93 0.79 0.87 0.13 0.33 0.22 004453 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 004577 C 0.02 0.22 0.12 A 0.98 0.78 0.88 0.04 0.34 0.21 004613 A 0.23 0.07 0.15 G 0.77 0.93 0.85 0.35 0.12 0.25 004721 A 0.04 0.09 0.07 G 0.96 0.91 0.93 0.08 0.16 0.12 005815 - 0.02 0.11 0.06 + 0.98 0.89 0.94 0.05 0.20 0.12 006366 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 006379 T 0.04 0.27 0.16 C 0.96 0.73 0.84 0.08 0.40 0.26 006462 T 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 006572 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007048 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 007071 - 0.05 0.00 0.03 + 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 007446 A 0.17 0.07 0.12 C 0.83 0.93 0.88 0.28 0.13 0.21 007464 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008623 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 008870 A 0.00 0.14 0.07 G 1.00 0.86 0.93 0.00 0.24 0.14 008873 A 0.00 0.14 0.07 T 1.00 0.86 0.93 0.00 0.24 0.14 009147 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009259 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009367 A 0.20 0.11 0.15 G 0.80 0.89 0.85 0.31 0.19 0.26 009396 T 0.00 0.24 0.12 C 1.00 0.76 0.88 0.00 0.36 0.21 009483 G 0.08 0.24 0.17 C 0.92 0.76 0.83 0.15 0.36 0.28 010700 T 0.33 0.28 0.31 C 0.67 0.72 0.69 0.44 0.41 0.43 010940 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010969 T 0.24 0.15 0.20 A 0.76 0.85 0.80 0.36 0.26 0.31 011164 A 0.00 0.13 0.06 G 1.00 0.87 0.94 0.00 0.23 0.12 011588 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011710 T 0.16 0.00 0.09 C 0.84 1.00 0.91 0.27 0.00 0.16 011876 A 0.02 0.14 0.07 C 0.98 0.86 0.93 0.04 0.24 0.13 011975 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012954 A 0.20 0.04 0.12 G 0.80 0.96 0.88 0.31 0.08 0.21 013199 + 0.30 0.15 0.23 - 0.70 0.85 0.77 0.42 0.26 0.35 013407 A 0.15 0.00 0.07 G 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 013454 A 0.21 0.00 0.11 G 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 013563 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 013573 A 0.21 0.04 0.13 C 0.79 0.96 0.87 0.33 0.08 0.22 013588 A 0.02 0.15 0.09 G 0.98 0.85 0.91 0.04 0.26 0.16 013612 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013842 T 0.54 0.30 0.43 G 0.46 0.70 0.57 0.50 0.42 0.49 014342 T 0.26 0.26 0.26 C 0.74 0.74 0.74 0.39 0.39 0.39 014989 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 014991 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015095 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015590 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015740 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015834 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 015845 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016182 A 0.06 0.19 0.11 C 0.94 0.81 0.89 0.12 0.30 0.20 016337 T 0.04 0.02 0.03 C 0.96 0.98 0.97 0.08 0.05 0.06 016364 A 0.11 0.25 0.17 G 0.89 0.75 0.83 0.20 0.38 0.28 016366 T 0.04 0.02 0.03 C 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 017549 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 017992 G 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 018377 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 018470 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 018620 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018819 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 019008 C 0.05 0.00 0.03 T 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 019295 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 019473 - 0.00 0.07 0.04 + 1.00 0.93 0.96 0.00 0.13 0.07 019590 C 0.12 0.29 0.20 T 0.88 0.71 0.80 0.21 0.41 0.32 019889 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 019890 A 0.11 0.00 0.05 G 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 019910 C 0.03 0.02 0.03 T 0.97 0.98 0.97 0.05 0.05 0.05 020064 C 0.13 0.27 0.21 T 0.87 0.73 0.79 0.23 0.40 0.33 020207 G 0.13 0.05 0.09 C 0.87 0.95 0.91 0.23 0.09 0.16 020416 A 0.20 0.36 0.28 G 0.80 0.64 0.72 0.33 0.46 0.41 020505 G 0.25 0.36 0.30 C 0.75 0.64 0.70 0.38 0.46 0.42 020514 A 0.07 0.00 0.04 G 0.93 1.00 0.96 0.14 0.00 0.07 020620 T 0.23 0.37 0.30 C 0.78 0.63 0.70 0.35 0.47 0.42 020640 C 0.23 0.37 0.30 G 0.78 0.63 0.70 0.35 0.47 0.42 020772 T 0.25 0.37 0.31 G 0.75 0.63 0.69 0.38 0.47 0.43 020824 C 0.25 0.37 0.31 G 0.75 0.63 0.69 0.38 0.47 0.43 020846 C 0.25 0.37 0.31 T 0.75 0.63 0.69 0.38 0.47 0.43 020874 T 0.25 0.37 0.31 C 0.75 0.63 0.69 0.38 0.47 0.43 020883 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020924 C 0.25 0.37 0.31 T 0.75 0.63 0.69 0.38 0.47 0.43 020937 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020982 G 0.25 0.37 0.31 A 0.75 0.63 0.69 0.38 0.47 0.43 020985 C 0.33 0.37 0.35 T 0.67 0.63 0.65 0.44 0.47 0.46 021027 T 0.25 0.37 0.31 C 0.75 0.63 0.69 0.38 0.47 0.43 021053 A 0.10 0.09 0.10 C 0.90 0.91 0.90 0.19 0.16 0.17 021149 C 0.25 0.37 0.31 T 0.75 0.63 0.69 0.38 0.47 0.43 023669 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 023703 C 0.15 0.28 0.22 G 0.85 0.72 0.78 0.26 0.41 0.34 024189 G 0.07 0.00 0.04 C 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.07 024208 T 0.07 0.10 0.08 C 0.93 0.90 0.92 0.13 0.18 0.15 024235 A 0.05 0.11 0.07 T 0.95 0.89 0.93 0.09 0.19 0.14 024525 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.06 0.03 024833 C 0.21 0.37 0.29 A 0.79 0.63 0.71 0.33 0.47 0.41 025072 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 025099 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025226 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 025256 T 0.12 0.28 0.20 C 0.88 0.72 0.80 0.22 0.41 0.32 025447 + 0.23 0.37 0.30 - 0.77 0.63 0.70 0.35 0.47 0.42 025722 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025751 A 0.20 0.43 0.32 C 0.80 0.57 0.68 0.31 0.49 0.43 025752 G 0.26 0.43 0.35 A 0.74 0.57 0.65 0.39 0.49 0.45 025838 C 0.23 0.43 0.33 T 0.77 0.57 0.67 0.35 0.49 0.44 025879 G 0.10 0.09 0.10 A 0.90 0.91 0.90 0.19 0.16 0.17 025884 C 0.23 0.45 0.34 T 0.77 0.55 0.66 0.35 0.50 0.45 025974 C 0.23 0.37 0.30 T 0.77 0.63 0.70 0.35 0.47 0.42 025982 C 0.23 0.36 0.29 A 0.77 0.64 0.71 0.35 0.46 0.41 026076 C 0.23 0.36 0.29 T 0.77 0.64 0.71 0.35 0.46 0.41 026116 G 0.19 0.36 0.28 C 0.81 0.64 0.72 0.31 0.46 0.40 026177 A 0.13 0.27 0.20 G 0.87 0.73 0.80 0.23 0.40 0.32 026331 T 0.20 0.36 0.28 C 0.80 0.64 0.72 0.31 0.46 0.40 026495 T 0.28 0.38 0.33 C 0.72 0.62 0.67 0.41 0.47 0.44 026520 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 026578 C 0.41 0.60 0.50 G 0.59 0.40 0.50 0.48 0.48 0.50 026629 T 0.11 0.05 0.08 G 0.89 0.95 0.92 0.19 0.09 0.14 027159 T 0.27 0.48 0.37 C 0.73 0.52 0.63 0.39 0.50 0.47 027196 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 027678 G 0.43 0.52 0.48 C 0.57 0.48 0.52 0.49 0.50 0.50 027800 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 028281 T 0.08 0.04 0.06 C 0.92 0.96 0.94 0.15 0.08 0.12 028417 T 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 028423 C 0.04 0.06 0.05 A 0.96 0.94 0.95 0.08 0.10 0.09 028433 T 0.26 0.50 0.37 C 0.74 0.50 0.63 0.39 0.50 0.46 028473 T 0.21 0.19 0.21 C 0.79 0.81 0.79 0.34 0.31 0.33 028483 T 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 028521 C 0.05 0.06 0.05 A 0.95 0.94 0.95 0.09 0.10 0.10 028537 - 0.14 0.08 0.11 + 0.86 0.92 0.89 0.24 0.15 0.20 028609 T 0.14 0.06 0.10 C 0.86 0.94 0.90 0.24 0.10 0.18 028697 C 0.32 0.11 0.23 T 0.68 0.89 0.78 0.43 0.20 0.35 028735 C 0.19 0.00 0.10 A 0.81 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 028795 G 0.27 0.50 0.38 A 0.73 0.50 0.62 0.40 0.50 0.47 028859 T 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 028997 C 0.27 0.03 0.17 T 0.73 0.97 0.83 0.40 0.06 0.28 029026 G 0.05 0.06 0.05 C 0.95 0.94 0.95 0.09 0.10 0.10 029044 C 0.27 0.06 0.17 T 0.73 0.94 0.82 0.40 0.10 0.29 029109 A 0.40 0.41 0.40 G 0.60 0.59 0.60 0.48 0.48 0.48 029293 T 0.24 0.07 0.15 C 0.76 0.93 0.85 0.36 0.12 0.26 029363 T 0.11 0.07 0.09 C 0.89 0.93 0.91 0.19 0.12 0.16 029407 T 0.11 0.07 0.09 C 0.89 0.93 0.91 0.19 0.12 0.16 029440 T 0.11 0.07 0.09 C 0.89 0.93 0.91 0.19 0.12 0.16 029517 T 0.12 0.02 0.07 C 0.88 0.98 0.93 0.22 0.04 0.14 029868 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 029885 G 0.25 0.07 0.16 C 0.75 0.93 0.84 0.38 0.12 0.27 029891 A 0.25 0.07 0.16 T 0.75 0.93 0.84 0.38 0.12 0.27 030169 G 0.07 0.07 0.07 A 0.93 0.93 0.93 0.14 0.14 0.14 030238 C 0.10 0.07 0.09 T 0.90 0.93 0.91 0.18 0.14 0.16 030360 A 0.10 0.05 0.08 G 0.90 0.95 0.92 0.18 0.10 0.14 030415 T 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 030728 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 030729 A 0.10 0.07 0.09 G 0.90 0.93 0.91 0.19 0.12 0.16 030756 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 030887 C 0.05 0.07 0.06 T 0.95 0.93 0.94 0.09 0.12 0.11 031050 T 0.10 0.07 0.09 C 0.90 0.93 0.91 0.19 0.14 0.17 031147 T 0.10 0.07 0.09 C 0.90 0.93 0.91 0.19 0.13 0.16 031257 C 0.25 0.07 0.17 A 0.75 0.93 0.83 0.38 0.14 0.28 031260 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 031320 T 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 031531 A 0.02 0.05 0.03 G 0.98 0.95 0.97 0.04 0.10 0.07 031547 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031555 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031556 A 0.11 0.08 0.10 G 0.89 0.92 0.90 0.19 0.15 0.18 031699 C 0.10 0.07 0.09 G 0.90 0.93 0.91 0.19 0.12 0.16 031707 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031715 A 0.10 0.07 0.09 G 0.90 0.93 0.91 0.19 0.12 0.16 031876 G 0.10 0.07 0.08 A 0.90 0.93 0.92 0.18 0.12 0.15 031910 A 0.09 0.07 0.08 G 0.91 0.93 0.92 0.17 0.12 0.14 031935 C 0.09 0.07 0.08 T 0.91 0.93 0.92 0.17 0.12 0.14 031937 C 0.09 0.07 0.08 T 0.91 0.93 0.92 0.17 0.12 0.14 031939 C 0.09 0.07 0.08 T 0.91 0.93 0.92 0.17 0.12 0.14 032068 C 0.07 0.13 0.10 A 0.93 0.87 0.90 0.13 0.23 0.18 032110 A 0.09 0.07 0.08 G 0.91 0.93 0.92 0.17 0.12 0.14 032188 G 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 032220 T 0.41 0.41 0.41 C 0.59 0.59 0.59 0.48 0.48 0.48 032221 C 0.09 0.07 0.08 G 0.91 0.93 0.92 0.17 0.12 0.14 032266 C 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 032405 T 0.10 0.07 0.09 A 0.90 0.93 0.91 0.19 0.12 0.16 032437 C 0.10 0.07 0.09 A 0.90 0.93 0.91 0.19 0.12 0.16 032546 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 032682 G 0.11 0.07 0.09 A 0.89 0.93 0.91 0.19 0.12 0.16 032701 T 0.13 0.00 0.07 C 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 032756 C 0.11 0.07 0.09 T 0.89 0.93 0.91 0.19 0.12 0.16 032819 T 0.09 0.00 0.05 C 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 032827 C 0.11 0.07 0.09 T 0.89 0.93 0.91 0.20 0.13 0.17 033174 C 0.07 0.07 0.07 T 0.93 0.93 0.93 0.12 0.14 0.13 033194 * 033279 A 0.12 0.00 0.07 G 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 033374 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 033524 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 033616 G 0.38 0.43 0.40 A 0.62 0.57 0.60 0.47 0.49 0.48 033639 A 0.15 0.02 0.09 G 0.85 0.98 0.91 0.26 0.05 0.17 033821 T 0.36 0.43 0.39 G 0.64 0.57 0.61 0.46 0.49 0.48 033918 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034281 G 0.57 0.41 0.49 A 0.43 0.59 0.51 0.49 0.48 0.50 034390 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 034413 A 0.57 0.41 0.49 G 0.43 0.59 0.51 0.49 0.48 0.50 034480 G 0.11 0.00 0.05 C 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 034483 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 034535 A 0.24 0.35 0.29 G 0.76 0.65 0.71 0.36 0.45 0.41 034667 A 0.42 0.59 0.50 G 0.58 0.41 0.50 0.49 0.48 0.50 034769 C 0.58 0.41 0.50 G 0.42 0.59 0.50 0.49 0.48 0.50 034885 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 034913 T 0.57 0.41 0.49 C 0.43 0.59 0.51 0.49 0.48 0.50 035086 T 0.43 0.57 0.50 C 0.57 0.42 0.50 0.49 0.49 0.50 035164 C 0.57 0.40 0.49 T 0.43 0.60 0.51 0.49 0.48 0.50 035267 C 0.58 0.41 0.50 G 0.42 0.59 0.50 0.49 0.48 0.50 035347 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035532 T 0.06 0.11 0.09 G 0.94 0.89 0.91 0.12 0.20 0.16 035538 T 0.58 0.41 0.50 C 0.42 0.59 0.50 0.49 0.48 0.50 035548 T 0.58 0.41 0.50 C 0.42 0.59 0.50 0.49 0.48 0.50 036021 A 0.11 0.11 0.11 G 0.89 0.89 0.89 0.19 0.19 0.19 036176 A 0.11 0.00 0.06 G 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.11 036406 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036488 A 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 036591 T 0.05 0.07 0.06 C 0.95 0.93 0.94 0.09 0.12 0.10 036697 G 0.41 0.39 0.40 C 0.59 0.61 0.60 0.48 0.47 0.48 036735 A 0.42 0.45 0.43 G 0.58 0.55 0.57 0.49 0.50 0.49 036750 A 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 036863 C 0.27 0.14 0.21 G 0.73 0.86 0.79 0.39 0.24 0.33 036947 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 036957 C 0.17 0.07 0.12 G 0.83 0.93 0.88 0.29 0.13 0.21 037287 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 037376 G 0.30 0.33 0.32 C 0.70 0.67 0.68 0.42 0.44 0.43 037450 G 0.07 0.07 0.07 C 0.93 0.93 0.93 0.12 0.13 0.13 037827 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 038089 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038161 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038383 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038483 T 0.09 0.11 0.10 C 0.91 0.89 0.90 0.16 0.19 0.17 038538 C 0.13 0.11 0.12 T 0.87 0.89 0.88 0.23 0.19 0.21 038834 A 0.48 0.33 0.40 G 0.52 0.67 0.60 0.50 0.44 0.48 038908 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038926 C 0.13 0.09 0.11 T 0.87 0.91 0.89 0.23 0.16 0.19 038931 T 0.11 0.09 0.10 C 0.89 0.91 0.90 0.19 0.16 0.18 039058 A 0.04 0.07 0.05 G 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 039069 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039536 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 039654 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 039727 G 0.43 0.31 0.37 C 0.57 0.69 0.63 0.49 0.43 0.47 039807 T 0.02 0.07 0.04 C 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 040019 - 0.02 0.07 0.04 + 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 040124 C 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 040147 - 0.46 0.33 0.39 + 0.54 0.67 0.61 0.50 0.44 0.48 040310 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 040690 T 0.09 0.10 0.09 C 0.91 0.90 0.91 0.17 0.17 0.17 041130 G 0.10 0.09 0.10 A 0.90 0.91 0.90 0.19 0.16 0.17 041251 T 0.12 0.11 0.12 C 0.88 0.89 0.88 0.22 0.19 0.21 041744 G 0.41 0.57 0.49 A 0.59 0.43 0.51 0.48 0.49 0.50 041753 A 0.43 0.34 0.38 C 0.57 0.66 0.62 0.49 0.45 0.47 042171 A 0.02 0.07 0.04 G 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 042908 A 0.02 0.07 0.04 G 0.98 0.93 0.96 0.04 0.13 0.08 043078 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 043103 T 0.02 0.07 0.04 C 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 043118 A 0.53 0.47 0.50 G 0.47 0.53 0.50 0.50 0.50 0.50 043169 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 043170 A 0.42 0.53 0.47 G 0.57 0.47 0.53 0.49 0.50 0.50 043321 A 0.15 0.21 0.18 G 0.85 0.79 0.82 0.26 0.33 0.29 043810 T 0.06 0.26 0.16 G 0.94 0.74 0.84 0.12 0.39 0.27 043928 C 0.43 0.52 0.48 T 0.57 0.48 0.52 0.49 0.50 0.50 044059 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 044186 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 044207 T 0.13 0.10 0.12 C 0.87 0.90 0.88 0.23 0.18 0.21 044566 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 044692 C 0.43 0.45 0.44 T 0.57 0.55 0.56 0.49 0.50 0.49 044882 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 044949 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 045206 A 0.17 0.00 0.10 G 0.83 1.00 0.90 0.29 0.00 0.18 045444 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 045522 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 045796 T 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 045850 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 046001 G 0.07 0.11 0.09 C 0.93 0.89 0.91 0.13 0.19 0.16 046239 G 0.21 0.25 0.23 T 0.79 0.75 0.77 0.34 0.38 0.36 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002933: c 003646: CCTTCCCTGAGACCCCACCCCTTCtgaGAcTCCTCCCCTTCTGAGTCCCTC 005815: cc 007071: g 013199: GTTT 015740: a 019473: G 025447: A 027196: CAAAAA 027800: A 028537: GCTCTTCATGAGACCCCGCCTCTCCTCAAGGCCATGCCCATCCCCTGAGGGCCCCCCACCTCTTCTCAAGGCCACGCCCTCTGAGGCCCTGACTCCTCCCAGGCCAGGCTCTTCATGAGACCCCGCCTCTCCTCAAGGCCATGCCCATCCCCTGAGGGCCTCCCACCTCTTCTCAAGGCCACGCCCTCTGAGGCCCTGACTCCTCCCAGGCCAG 029868: g 033524: at 037287: G 040019: c 040147: T Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 033194 A 0.07 0.00 0.03 G 0.11 0.07 0.09 C 0.83 0.93 0.87