Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000389 A 0.44 0.48 0.46 G 0.56 0.52 0.54 0.49 0.50 0.50 000744 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000800 T 0.05 0.20 0.13 C 0.95 0.80 0.87 0.10 0.33 0.23 001071 G 0.14 0.39 0.27 A 0.86 0.61 0.73 0.24 0.47 0.39 001263 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001514 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001537 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001661 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002064 T 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 002418 G 0.41 0.15 0.28 C 0.59 0.85 0.72 0.48 0.26 0.41 002557 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003212 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003664 A 0.12 0.00 0.07 G 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 003668 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003743 T 0.17 0.00 0.09 C 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.17 003969 - 0.03 0.00 0.01 + 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 003988 A 0.04 0.11 0.08 G 0.96 0.89 0.92 0.08 0.20 0.14 004072 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004196 C 0.05 0.00 0.03 T 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 004235 + 0.05 0.10 0.07 - 0.95 0.90 0.93 0.09 0.17 0.13 004734 G 0.03 0.12 0.08 A 0.97 0.88 0.92 0.06 0.21 0.15 005122 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005650 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005746 C 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 005859 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007769 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 007818 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 007830 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 008220 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 008515 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008736 G 0.03 0.10 0.06 C 0.97 0.90 0.94 0.05 0.17 0.12 008824 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009092 G 0.04 0.11 0.08 A 0.96 0.89 0.92 0.08 0.19 0.14 009204 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 009245 - 0.00 0.05 0.03 + 1.00 0.95 0.97 0.00 0.09 0.05 010248 C 0.00 0.09 0.05 G 1.00 0.91 0.95 0.00 0.16 0.09 010375 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 011177 - 0.21 0.12 0.17 + 0.79 0.88 0.83 0.34 0.20 0.28 011574 A 0.24 0.09 0.16 G 0.76 0.91 0.84 0.36 0.17 0.27 011772 T 0.24 0.11 0.17 G 0.76 0.89 0.83 0.36 0.19 0.28 011966 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.09 013589 C 0.25 0.11 0.18 T 0.75 0.89 0.82 0.38 0.20 0.30 013610 T 0.32 0.11 0.22 C 0.68 0.89 0.78 0.43 0.20 0.34 013781 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 013807 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 014279 A 0.27 0.46 0.37 G 0.73 0.54 0.63 0.40 0.50 0.46 014408 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014666 T 0.02 0.07 0.04 C 0.98 0.93 0.96 0.04 0.13 0.08 014912 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015203 C 0.27 0.11 0.19 T 0.73 0.89 0.81 0.39 0.19 0.31 015516 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015574 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015782 A 0.00 0.09 0.05 G 1.00 0.91 0.95 0.00 0.17 0.09 016383 G 0.10 0.11 0.11 A 0.90 0.89 0.89 0.19 0.19 0.19 016604 A 0.27 0.11 0.19 G 0.73 0.89 0.81 0.39 0.19 0.31 016898 T 0.05 0.07 0.06 G 0.95 0.93 0.94 0.09 0.13 0.11 017371 A 0.27 0.11 0.19 G 0.73 0.89 0.81 0.39 0.19 0.31 017380 T 0.27 0.11 0.19 G 0.73 0.89 0.81 0.39 0.19 0.31 018451 C 0.03 0.07 0.05 G 0.97 0.93 0.95 0.05 0.13 0.09 018625 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 019300 C 0.00 0.03 0.01 T 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.03 019517 T 0.07 0.00 0.04 C 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.07 020466 A 0.00 0.09 0.04 T 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 020621 T 0.17 0.09 0.13 C 0.83 0.91 0.87 0.28 0.16 0.22 020622 A 0.27 0.11 0.19 G 0.73 0.89 0.81 0.39 0.19 0.31 021111 A 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 021332 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 021377 A 0.07 0.15 0.11 G 0.93 0.85 0.89 0.13 0.26 0.20 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 003969: GCCTCGGT 004235: AACC 008515: GTGGACAGGGTCAGGAATCAGGAGTCTG 009245: A 011177: GTA