Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000152 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 000315 T 0.10 0.13 0.12 A 0.90 0.87 0.88 0.19 0.23 0.21 000501 A 0.12 0.57 0.34 G 0.88 0.43 0.66 0.22 0.49 0.45 000554 C 0.12 0.57 0.34 T 0.88 0.43 0.66 0.22 0.49 0.45 000704 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 000786 G 0.12 0.57 0.34 T 0.88 0.43 0.66 0.22 0.49 0.45 000809 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000951 A 0.04 0.13 0.09 G 0.96 0.87 0.91 0.08 0.23 0.16 001180 C 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 001269 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001355 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001372 G 0.10 0.14 0.12 A 0.90 0.86 0.88 0.19 0.24 0.21 001493 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001588 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001701 T 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 001852 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001866 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 002077 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 002232 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002463 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002487 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002629 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002848 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002859 G 0.09 0.55 0.32 A 0.91 0.45 0.68 0.17 0.50 0.43 002904 T 0.02 0.07 0.05 C 0.98 0.93 0.95 0.04 0.13 0.09 002908 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 002982 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003339 A 0.19 0.54 0.36 G 0.81 0.46 0.64 0.30 0.50 0.46 003872 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004128 G 0.50 0.33 0.41 T 0.50 0.67 0.59 0.50 0.44 0.49 004163 C 0.02 0.04 0.03 T 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 004319 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004391 A 0.31 0.13 0.22 G 0.69 0.87 0.78 0.43 0.23 0.35 004510 G 0.50 0.33 0.41 C 0.50 0.67 0.59 0.50 0.44 0.49 004833 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004982 A 0.18 0.54 0.37 G 0.82 0.46 0.63 0.30 0.50 0.46 005023 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005296 A 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.17 005397 A 0.53 0.36 0.45 G 0.47 0.64 0.55 0.50 0.46 0.50 005614 A 0.55 0.35 0.44 G 0.45 0.65 0.56 0.50 0.45 0.49 005716 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.05 005780 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001269: C