Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000138 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 000200 T 0.07 0.14 0.10 C 0.93 0.86 0.90 0.13 0.24 0.19 000527 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000554 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000710 T 0.06 0.17 0.12 C 0.94 0.83 0.88 0.12 0.29 0.21 000874 A 0.15 0.22 0.18 G 0.85 0.78 0.82 0.25 0.34 0.30 001467 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 001634 A 0.32 0.41 0.37 C 0.68 0.59 0.63 0.43 0.48 0.46 001673 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 001771 T 0.07 0.17 0.12 C 0.93 0.83 0.88 0.13 0.29 0.21 001840 A 0.07 0.04 0.06 G 0.93 0.96 0.94 0.13 0.08 0.10 002082 A 0.46 0.35 0.40 G 0.54 0.65 0.60 0.50 0.45 0.48 002648 C 0.14 0.24 0.19 G 0.86 0.76 0.81 0.24 0.36 0.31 002839 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003015 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003239 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 003303 A 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 003348 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003396 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003414 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003439 G 0.15 0.20 0.17 C 0.85 0.80 0.83 0.25 0.31 0.28 003460 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003511 A 0.06 0.04 0.05 G 0.94 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 003875 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003981 T 0.21 0.35 0.28 A 0.79 0.65 0.72 0.33 0.45 0.40 003985 T 0.04 0.15 0.10 G 0.96 0.85 0.90 0.08 0.26 0.17 004251 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 004363 A 0.15 0.09 0.12 G 0.85 0.91 0.88 0.25 0.16 0.21 004462 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 004514 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 004691 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004805 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 006013 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006510 C 0.12 0.02 0.08 T 0.88 0.98 0.92 0.22 0.04 0.14 006830 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006954 T 0.00 0.09 0.04 C 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 007003 A 0.08 0.04 0.06 G 0.92 0.96 0.94 0.15 0.08 0.12 007009 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 007069 T 0.21 0.26 0.23 A 0.79 0.74 0.77 0.33 0.39 0.36 007119 T 0.08 0.04 0.06 G 0.92 0.96 0.94 0.15 0.08 0.12 007135 A 0.08 0.04 0.06 G 0.92 0.96 0.94 0.15 0.08 0.12 007252 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008993 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 009406 T 0.15 0.20 0.17 C 0.85 0.80 0.83 0.25 0.31 0.28 009468 A 0.08 0.02 0.06 G 0.92 0.98 0.94 0.15 0.05 0.10 009612 T 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.07 009644 A 0.13 0.00 0.07 G 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.13 009737 A 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009856 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009888 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009966 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010179 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010632 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010922 T 0.15 0.09 0.12 G 0.85 0.91 0.88 0.26 0.16 0.21 011075 T 0.07 0.11 0.09 C 0.93 0.89 0.91 0.13 0.19 0.16 011327 T 0.00 0.06 0.03 C 1.00 0.94 0.97 0.00 0.10 0.05 011353 T 0.24 0.31 0.27 G 0.76 0.69 0.73 0.36 0.42 0.39 011502 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 011885 - 0.05 0.00 0.02 + 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 011970 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012161 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012257 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012574 C 0.15 0.09 0.12 T 0.85 0.91 0.88 0.26 0.16 0.21 012714 T 0.08 0.13 0.11 C 0.92 0.87 0.89 0.15 0.23 0.19 012813 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 013258 A 0.19 0.34 0.26 G 0.81 0.66 0.74 0.30 0.45 0.39 013795 A 0.08 0.18 0.13 G 0.92 0.82 0.87 0.15 0.30 0.23 014211 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014271 C 0.11 0.21 0.16 G 0.89 0.79 0.84 0.20 0.33 0.27 014305 C 0.12 0.09 0.11 T 0.88 0.91 0.89 0.21 0.16 0.19 014447 C 0.11 0.20 0.16 T 0.89 0.80 0.84 0.20 0.33 0.27 014466 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014548 C 0.04 0.18 0.11 T 0.96 0.82 0.89 0.08 0.30 0.20 014722 A 0.08 0.13 0.11 G 0.92 0.87 0.89 0.15 0.23 0.19 014794 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 014981 T 0.00 0.09 0.04 C 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 015030 C 0.12 0.20 0.16 T 0.88 0.80 0.84 0.22 0.31 0.27 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 011885: A 014211: CTC