Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000088 T 0.02 0.03 0.02 G 0.98 0.97 0.98 0.04 0.05 0.05 000094 G 0.20 0.00 0.10 A 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.19 000275 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000338 T 0.33 0.23 0.28 C 0.67 0.78 0.72 0.44 0.35 0.40 000734 T 0.46 0.25 0.37 C 0.54 0.75 0.63 0.50 0.38 0.46 000747 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000762 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000799 T 0.17 0.24 0.20 C 0.83 0.76 0.80 0.28 0.36 0.32 001225 T 0.13 0.00 0.07 C 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 001354 C 0.63 0.22 0.42 T 0.37 0.78 0.58 0.47 0.34 0.49 001376 T 0.43 0.00 0.22 C 0.57 1.00 0.78 0.49 0.00 0.34 001389 C 0.43 0.00 0.22 G 0.57 1.00 0.78 0.49 0.00 0.34 001440 C 0.61 0.02 0.32 T 0.39 0.98 0.68 0.48 0.04 0.43 001613 G 0.24 0.22 0.23 A 0.76 0.78 0.77 0.36 0.34 0.35 001968 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002015 G 0.17 0.00 0.09 C 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 002142 T 0.15 0.02 0.09 A 0.85 0.98 0.91 0.25 0.04 0.16 002319 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002469 C 0.17 0.02 0.10 T 0.83 0.98 0.90 0.28 0.04 0.17 002692 C 0.00 0.10 0.04 G 1.00 0.90 0.96 0.00 0.17 0.08 002887 C 0.15 0.02 0.09 G 0.85 0.98 0.91 0.25 0.05 0.16 003068 C 0.17 0.02 0.10 G 0.83 0.98 0.90 0.28 0.04 0.18 003169 C 0.19 0.00 0.10 T 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.18 003296 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003639 A 0.00 0.10 0.04 G 1.00 0.90 0.96 0.00 0.17 0.08 003855 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004754 A 0.15 0.02 0.09 G 0.85 0.98 0.91 0.25 0.05 0.16 005091 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005165 C 0.67 0.22 0.45 G 0.33 0.78 0.55 0.44 0.34 0.49 005167 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005509 A 0.40 0.02 0.21 G 0.60 0.98 0.79 0.48 0.04 0.33 005613 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 005617 T 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 005701 G 0.19 0.00 0.10 C 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.19 005921 T 0.25 0.20 0.23 C 0.75 0.80 0.77 0.38 0.32 0.35 006027 G 0.23 0.00 0.12 T 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.22 006079 A 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 006091 + 0.04 0.00 0.02 - 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006174 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006305 C 0.67 0.21 0.47 T 0.33 0.79 0.53 0.44 0.33 0.50 006469 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 006484 T 0.38 0.02 0.20 G 0.62 0.98 0.80 0.47 0.05 0.32 006579 G 0.65 0.24 0.45 A 0.35 0.76 0.55 0.45 0.36 0.50 006665 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006685 G 0.39 0.02 0.21 A 0.61 0.98 0.79 0.47 0.05 0.33 006771 A 0.00 0.10 0.05 C 1.00 0.90 0.95 0.00 0.17 0.09 006812 G 0.39 0.02 0.21 C 0.61 0.98 0.79 0.47 0.05 0.33 006894 C 0.39 0.02 0.21 T 0.61 0.98 0.79 0.47 0.05 0.33 007024 G 0.40 0.03 0.21 C 0.60 0.97 0.79 0.48 0.05 0.33 007249 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 007301 T 0.13 0.20 0.17 C 0.87 0.80 0.83 0.23 0.33 0.28 007347 A 0.26 0.20 0.23 C 0.74 0.80 0.77 0.39 0.33 0.36 007361 G 0.63 0.23 0.43 A 0.37 0.77 0.57 0.47 0.35 0.49 007460 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 007464 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 007498 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 007668 T 0.52 0.22 0.37 A 0.48 0.78 0.63 0.50 0.34 0.47 007969 C 0.17 0.20 0.18 A 0.83 0.80 0.82 0.28 0.31 0.30 008008 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 008104 - 0.52 0.22 0.37 + 0.48 0.78 0.63 0.50 0.34 0.47 008230 C 0.52 0.22 0.37 T 0.48 0.78 0.63 0.50 0.34 0.47 008241 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008448 A 0.52 0.22 0.37 G 0.48 0.78 0.63 0.50 0.34 0.47 008477 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 008617 C 0.67 0.22 0.45 G 0.33 0.78 0.55 0.44 0.34 0.49 008698 G 0.67 0.22 0.45 A 0.33 0.78 0.55 0.44 0.34 0.49 008711 A 0.15 0.00 0.07 T 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 008766 T 0.52 0.22 0.37 C 0.48 0.78 0.63 0.50 0.34 0.47 009027 A 0.08 0.20 0.14 G 0.92 0.80 0.86 0.15 0.32 0.24 009055 A 0.58 0.21 0.42 G 0.42 0.79 0.58 0.49 0.33 0.49 009220 G 0.15 0.00 0.08 C 0.85 1.00 0.92 0.25 0.00 0.15 009221 A 0.17 0.21 0.19 G 0.83 0.79 0.81 0.28 0.33 0.30 009272 A 0.52 0.21 0.38 G 0.48 0.79 0.62 0.50 0.33 0.47 009328 G 0.67 0.21 0.47 A 0.33 0.79 0.53 0.44 0.33 0.50 009333 A 0.52 0.21 0.38 G 0.48 0.79 0.62 0.50 0.33 0.47 009337 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 009498 A 0.17 0.19 0.18 T 0.83 0.81 0.82 0.28 0.31 0.29 009680 + 0.48 0.22 0.35 - 0.52 0.78 0.65 0.50 0.34 0.45 009866 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009894 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009895 + 0.67 0.22 0.45 - 0.33 0.78 0.55 0.44 0.34 0.49 010630 G 0.12 0.00 0.07 A 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.13 010872 T 0.29 0.11 0.21 A 0.71 0.89 0.79 0.41 0.20 0.34 011087 A 0.15 0.00 0.07 G 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 011208 A 0.23 0.24 0.23 G 0.77 0.76 0.77 0.35 0.36 0.36 011266 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011280 T 0.21 0.26 0.23 C 0.79 0.74 0.77 0.33 0.39 0.36 011487 G 0.00 0.04 0.02 A 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 006091: cccctgtccccg 006665: a 008104: t 009680: gtt 009895: ag