************************************************************* **** **** **** Output from PHASE v2.0 **** **** Code by M Stephens, with contributions from N Li **** **** **** ************************************************************* BEGIN COMMAND_LINE /usr/local/genome/lib/phase/PHASE2 -d1 al5ap.phase.inp al5ap.phase.out END COMMAND_LINE BEGIN OUTFILE_LIST al5ap.phase.out_freqs : haplotype frequency estimates al5ap.phase.out_pairs : most likely haplotype pairs for each individual al5ap.phase.out_recom : estimates of recombination parameters al5ap.phase.out_monitor : file for monitoring convergence END OUTFILE_LIST BEGIN INPUT_SUMMARY Number of Individuals: 47 Number of Loci: 142 Positions of loci: 660 2050 2161 2556 2680 2759 2787 2821 2840 2914 3050 3254 3276 3307 3517 3679 4108 4431 4513 4843 4965 5024 5422 6067 6226 6315 6511 6601 6689 6792 7017 7476 7704 7736 7814 9074 9276 9788 10214 10325 10356 10404 10644 10737 11024 11188 11303 11441 11469 11882 11889 12077 12087 12290 12454 12585 12879 13025 13151 13209 13405 13474 13625 13798 14076 14345 15275 15285 15678 16324 16589 16619 16630 16634 16647 17706 17971 17979 18659 18777 19242 19368 19857 19959 20158 20176 20721 20795 21030 21112 21684 22634 22666 22744 23125 23331 23366 23489 23607 23742 23745 24265 24364 24606 24703 24897 25317 25462 25634 25757 25758 25785 25871 25882 25953 26357 26736 26830 26982 27010 27052 27568 28107 28399 28531 28733 29087 29500 29668 29912 29994 30163 30231 30816 31151 31454 31504 31961 32259 32371 32729 32739 END INPUT_SUMMARY List of haplotypes found in best reconstruction, with counts. (See file al5ap.phase.out_freqs for haplotype population frequency estimates) BEGIN LIST_SUMMARY 1 GCAAIGGDAAGGGTATCAACGCDCCAGGGACGTCCGGAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGCGGAGTGCGIAIATGCGGGTGCAT 1 GGGCIAGGCCATAAAGGGCTGGGGGGACGAAGATAGGCGT 1.000000 2 GCAAIGGDAAGGGTATCATCGCDCCAGGGACGTCCGGAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 2 GATCDCAATTACGAAGAACTGGGGGGACGTAAATGGGCGC 2.000000 3 GCAAIGGDAAGGGTATCATCGCDCCAGGGACGTCCGGAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAGGAGCTGAAGAGGTGTAAATGGGCGC 1.000000 4 GCAAIGGDAAGGGTATCATCGCDCCAGGGACGTCCGGAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAGGAGCTGAATAGGTGTAAATGGGCGC 2.000000 5 GCAAIGGDAAGGGTATCATCGCDCCAGGGACGTCCGGAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAGGAGCTGAATAGGTGTAAATGGCCGC 1.000000 6 GCAAIGGDAAGGGTATCATCGCDCCAGGGACGTCCGGAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGTCG 3 AATCDCAATTACGAAAAGCTGAAGAGGCGTAAATGGGCGC 1.000000 7 GCCAIGGDAGGGGTATCATCGCDCCAGGGACGTCCGGAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAGGAGCTGAATAGGTGTAAATGGCCGC 4.000000 8 TCAAIGGDAAGGGTATCAATATDCCAGGGACGTCCGGAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAGGAGCTGAATAGGTGTAAATGGGCGC 1.000000 9 TCAAIGGDAAGGGCACCATCGCICTAGGGACACCCGGGACGTCTCGGGATACTTTCGIGATGTTGTTTGTCGCGGGACGGACTGCGIGDATGCGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAAGAGCTGAATAGGTATAAATGGGCAC 2.000000 10 TCAAIGGDAAGGGCACCATCGCICTAGGGACACCCGGGACGTCTCGGGATACTTTCGIGATGTTGTTTGTCGCGGGACGGACTGCGIGDATGCGAGAGCCG 2 GATCDCAATTACGAAGAGCTGAAGAGGCGTGAGTGGGCGC 2.000000 11 TCAAIGGDAAGGGCACCATCGCICTAGGGACACCCGGGACGTCTCGGGATACTTTCGIGATGTTGTTTGTCGCGGGACGGACTGCGIGDATGCGAGAGCCG 2 GATCDCAATTACGAAGAGCTGAAGAGGCGTGAGGGGGCGC 2.000000 12 TCAAIGGDCAGGGTGTCAATATDCCAGGGACGTCCAGAAGGTCTCAGCCTATATTCGIGATGTTGCCTACTGCTGTGCTGAGTGCGDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAAGAGCTGAAGAAGTGTAAATGAGCGC 2.000000 13 TCAAIGGDCAGGGTGTCAATATDCCAGGGACGTCCGAAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAGGAGCTGAATAGGTGTAAATGGGCGC 1.000000 14 TCAAIGGDCAGAGTATCAACGCDCTAGGGCTACCCGGAAGGTCTCGGGCTATATTCGIGATGTTGCCTACTGCTGTGCGGAGTGCGDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAAGAGCTGAAGAAGTGTAAATGAGCGC 1.000000 15 TCAAIGGDCAGAGTATCAACGCDCTAAGGACACCTAGAGGGTCTCGGGCTACACTCGIGATGTTGCCTACCGCGGTGCGGAGTTCGIGIATGCGGTAGCCG 3 GATCDCAATTACGAAGAGCTGAAGAGGCGTGAATGGGCGC 1.000000 16 TCAAIGGDCAGAGTATCAACGCDCTAAGGACACCTGAAGGATACCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCGDGIACGCGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAAGAGCTGAATAGGTATAAATGGGCAC 2.000000 17 TCAAIGGDCAGAGTATCAATATDCCAGGGACGTCCAGAAGGTCTCGGGCTACATTCGIGGTGTTGCTTACTGCTTTGCGAAGTGCGIAIATGCGGGTGCAT 1 GGGCIAGGCCATAAAGGGCTGGGGGGACGAAGATAGGCGT 3.000000 18 TCAAIGGDCAGAGTATCAATATDCCAGGGACGTCCAGAAGGTCTCGGGCTACATTCGIGGTGTTGCTTACTGCTTTGCGAAGTGCGIAIATGCGGGTGCAT 1 GGGCIAGGCCATAAAGGGCTGGGTGGACGAAGATAGGCGT 1.000000 19 TCAAIGGDCAGAGTATCAATATDCCAGGGACGTCCAGAGGATCTCGGGCTACACTCGIGACGTTGCTTGCCGCGGTGCGGACTGCGIGIACGCGGGAGCCG 3 GATCDCAATTACGAAGAACTGGGGGGACGTAAATGGGCGC 1.000000 20 TCAAIGGDCAGAGTATCATCGCDCCAGGGACGTCCGGAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAGGAGCTGAATAGGTGTAAATGGGCGC 1.000000 21 TCAAIGGDCAGAGTATGAACGCDCTAGGGCCACTCAGAAGGTCTCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTTGCCGCGGTGCGGAGTTCGIAIATGCGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAGGAGCTGAATAGGTGTAAATGGCCGC 1.000000 22 TCAAIGGDCAGAGTATGAACGCDCTAGGGCCACTCAGAAGGTCTCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTTGCCGCGGTGCGGAGTTCGIAIATGCGGGTGCAT 1 GGGCIAGGCCATAAAGGGCTGGGGGGACGAAGATAGGCGT 1.000000 23 TCAAIGGDCAGAGTATGTACGCDCTAGAGCCACTCAAAAGGTCTCGGGCTACATTCGDAATGTTGCTTACTGCTGTGCGGGGCTCGIGIATCCGGTAGCCG 3 GATCDCAATTTCGAAGAGACGAAGAGGCGTGAAGGGGCGC 1.000000 24 TCAAIGGDCAGAGTATGTACGCDCTAAGGACACCTGAAGGATACCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCGDGIACGCGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAAGAGCTGAATAGGTATAAATGGGCAC 2.000000 25 TCAAICGIAAGAGTATCAACGCDCTAGGGCTACCCAGAAGGTCTCGGGCTACATTCGIGGTGTTGCTTACTGCTGTGCGAAGTGCGIAIATGCGGGTGCAT 1 GGGCIAGGCCATAAAGGGCTGGGGGGACGAAGATAGGCGT 1.000000 26 TCAAICGIAAGAGTATCAACGCDCTAGGGCTACCCGGAAGGTCTCGGGCTATATTCGIGATGTTGCCTACTGCTGTGCGGAGTGCGDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAAGAGCTGAAGAAGTGTAAATGAGCGC 2.000000 27 TCAAICGICAGAGTATCAACGCDCTAGGGCTACCCGGAAGGTCTCGGGCTATATTCGIGATGTTGCCTACTGCTGTGCGGAGTGCGDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAAGAGCTGAAGAAGTGTAAATGAGCGC 2.000000 28 TCATDGGDAAGGGTATCAACGCDGTTGGACCACCCAGAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAGGAGCTGAATAGGTGTAAATGGGCGC 1.000000 29 TCATDGGDAAGGGTATCAACGCDGTTGGACCACCCAGAAGATCTCGAGCCTCACCTAIGACCATGCTTGCCGCGGTGCGGACTGCGIGIACGCGGGAGTCG 3 AATCDCAATTACGAAAAGCTGAAGAGGCGTAAATGGGCGC 3.000000 30 TCATDGGDAAGGGTATCAACGCDGTTGGACCACCCAGAAGATCTCGAGCCTCACCTAIGACCATGCTTGCCGCGGTGCGGAGTGCGDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAAGAGCTGAAGAAGTGTAAATGAGCGC 1.000000 31 TCATDGGDAAGGGTATCAACGCDGTTGGACCACCCAGAAGGTCTCAGCCTATATTCGIGATGTTGCCTACTGCTGTGCTGAGTGCGDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAAGAGCTGAAGAAGTGTAAATGAGCGC 1.000000 32 TCATDGGDAAGGGTATCATCGCDGTTGGGCCACCCAGAAGATATCGGGCCTCACCTGIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAGGAGCTGAATAGGTGTAAATGGGCGC 1.000000 33 TCATDGGDAAGGGTATCATCGCICTAGGGACACCCGGGACGTCTCGGGATACTTTCGIGATGTTGTTTGTCGCGGGACGGACTGTGIGDATGCGAGAGCCG 2 GATCDCAATTACGAAGAGCTGAAGAGGCGTGAGTGGGCGC 1.000000 34 TCCAIGGDAGGAGTATGTACGCDCTAGAGCCACTCAGAGGGGCTTGGGCTACATTCGIGATGTTTCTTACTATGGTGCGGACTGTGIGITCGCGGTAACCG 3 GATCDCAATTACGCAGAGCTTAAGAGGCGTGAATGGGCGC 6.000000 35 TCCAIGGDAGGAGTATGTACGCDCTAGAGCCACTCAAAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCACGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAGGAGCTGAATAGGTGTAAATGGGCGC 2.000000 36 TCCAIGGDAGGAGTATGTACGCDCTAGAGCCACTCAAAAGGTCTCGGGCTACATTCGDAATGTTGCTTACTGCTGTGCGGGGCTCGIGIATCCGGTAGCCG 3 GATCDCAATTTCGAAGAGACGAAGAGGCGTGAAGGGGCGC 13.000000 37 TCCAIGGDAGGAGTATGTACGCDCTAAGGACACCTGGAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 2 GATCDCAATTACGAAGAACTGGGGGGACGTAAATGGGCGC 1.000000 38 TCCAIGGDAGGAGTATGTACGCDCTAAGGACACCTGAAGGATACCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCGDGIACGCGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAAGAGCTGAATAGGTATAAATGGGCAC 11.000000 39 TCCAIGGDAGGAGTATGTACGCDCTAAGGACACCTGAAGGATACCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCGDGIACGCCGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAAGAGCTGAATAGGTATAAATGGGGGC 3.000000 40 TCCADGGDAGGAGTATGTACGCDCTAGAGCCACTCAAAAGGTCTCGGGCTACATTCGDAATGTTGCTTACTGCTGTGCGGGGCTCGIGIATCCGGTAGCCG 3 GATCDCAATTTCGAAGAGACGAAGAGGCGTGAAGGGGCGC 1.000000 41 TTAAIGADCAAAATGTCAACGCDCTAGGGCTACCCAGAAGGTCTCGGGCTACATTCGIGGTGTTGCTTACTGCTTTGCGGAGTGCGIAIATGCGGGTGCAT 1 GGGCIAGGCCATAAAGGGCTGAAGAGGCGTAAATGGGCGC 1.000000 42 TTAAIGADCAAAATGTCAACGCDCTAGGGCTACCCAGAAGGTCTCGGGCTACATTCGIGGTGTTGCTTACTGCTTTGCGGAGTGCGIAIATGCGGGTGCAT 1 GGGCIAGGCCATAAAGGGCTGGGGGGACGAAGATAGGCGT 1.000000 43 TTAAIGADCAAAATGTCAACGCDCTAGGGCTACCCAGAAGGTCTCGGGCTACATTCGIGGTGTTGCTTACTGCTTTGCGAAGTGCGIAIATGCGGGTGCAT 1 GGGCIAGGCCATAAAGGGCTGGGGGGACGAAGATAGGCGT 2.000000 44 TTAAIGADCAAAATGTCAATATDCCAGGGACGTCCGGAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 3 AATCDCAATTACGAAGAGCTGAAGAGGCGTAAATGGGCGC 1.000000 45 TTAAIGADCAAAATGTCAATATDCCAGGGACGTCCGGAAGATATCGGGCCTCACCTAIGACCATGCTCGCCGCGGTGAGGAGTGCTDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAGGAGCTGAATAGGTGTAAATGGGCGC 1.000000 46 TTAAIGADCAAAATGTCAATATDCCAGGGACGTCCGGAAGGTCTCGGGCTATATTCGIGATGTTGCCTACTGCTGTGCGGAGTGCGDGIACGTGGGAGCCG 3 GATADCAATTACGAAGAGCTGAAGAAGTGTAAATGAGCGC 1.000000 END LIST_SUMMARY Summary of best reconstruction (numbers refer to the list of haplotypes given above) BEGIN BESTPAIRS_SUMMARY D001: (4,29) D002: (3,12) D003: (27,38) D004: (17,36) D005: (22,27) D006: (1,32) D007: (7,43) D008: (29,44) D009: (30,39) D010: (8,41) D011: (6,28) D012: (18,39) D013: (15,25) D014: (24,39) D015: (12,42) D016: (31,43) D033: (2,21) D034: (19,33) D035: (29,46) D036: (20,24) D037: (17,17) D038: (4,45) D039: (26,26) D040: (10,38) E001: (36,38) E002: (5,34) E003: (36,38) E004: (11,36) E005: (7,36) E006: (36,38) E007: (9,38) E008: (7,36) E009: (36,36) E010: (36,40) E011: (14,34) E012: (11,35) E013: (37,38) E014: (2,13) E015: (34,38) E016: (34,36) E017: (16,34) E018: (7,38) E019: (10,16) E020: (9,36) E021: (34,38) E022: (23,36) E023: (35,38) END BESTPAIRS_SUMMARY Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in []: BEGIN BESTPAIRS1 0 D001 G C A A I G G D A A G G G T A T C A T C G C D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A [T] A G G T G T A A A T G G G C G C T C A T D G G D A A G G G T A T C A A C G C D G T T G G A C C A C C C A G A A G A T C T C G A G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T T G C C G C G G T G C G G A C T G C G I G I A C G C G G G A G T C G 3 A A T C D C A A T T A C G A A A A G C T G A A G A G G C G T A A A T G G G C G C 0 D002 G C A A I G G D A A G G G T A T C A T C G C D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A G A G G T G T A A A T G G G C G C T C A A I G G D C A G G G T G T C A A T A T D C C A G G G A C G T C C A G A A G G T C T C A G C C T A T A T T C G I G A T G T T G C C T A C T G C T G T G C T G A G T G C G D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A A G T G T A A A T G A G C G C 0 D003 T C A A I C G I C A G A G T A T C A A C G C D C T A G G G C T A C C C G G A A G G T C T C G G G C T A T A T T C G I G A T G T T G C C T A C T G C T G T G C G G A G T G C G D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A A G T G T A A A T G A G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C 0 D004 T C A A I G G D C A G A G T A T C A A T A T D C C A G G G A C G T C C A G A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G I G G T G T T G C T T A C T G C T T T G C G A A G T G C G I A I A T G C G G G T G C A T 1 G G G C I A G G C C A T A A A G G G C T G G G G G G A C G A A G A T A G G C G T T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C 0 D005 T C A A I G G D C A G A G T A T G A A C G C D C T A G G G C C A C T C A G A A G G T C T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T T G C C G C G G T G C G G A G T T C G I A I A T G C G G G T G C A T 1 G G G C I A G G C C A T A A A G G G C T G G G G G G A C G A A G A T A G G C G T T C A A I C G I C A G A G T A T C A A C G C D C T A G G G C T A C C C G G A A G G T C T C G G G C T A T A T T C G I G A T G T T G C C T A C T G C T G T G C G G A G T G C G D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A A G T G T A A A T G A G C G C 0 D006 (G) C A (A) (I) G G D A A G G G T A T C A A C G C D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G C G G A G T G C G I A I A T G C G G G T G C A T 1 G G G C I A G G C C A T A A A G G G C T G G G G G G A C G A A G A T A G G C G T (T) C A (T) (D) G G D A A G G G T A T C A T C G C D G T T G G G C C A C C C A G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T G I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G G C G C 0 D007 G C C A I G G D A G G G G T A T C A T C G C D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G C C G C T T A A I G A D C A A A A T G T C A A C G C D C T A G G G C T A C C C A G A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G I G G T G T T G C T T A C T G C T T T G C G A A G T G C G I A I A T G C G G G T G C A T 1 G G G C I A G G C C A T A A A G G G C T G G G G G G A C G A A G A T A G G C G T 0 D008 T C A T D G G D A A G G G T A T C A A C G C D G T T G G A C C A C C C A G A A G A T C T C G A G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T T G C C G C G G T G C G G A C T G C G I G I A C G C G G G A G T C G 3 A A T C D C A A T T A C G A A (A) A G C T G A A G A G G C G T A A A T G G G C G C T T A A I G A D C A A A A T G T C A A T A T D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 A A T C D C A A T T A C G A A (G) A G C T G A A G A G G C G T A A A T G G G C G C 0 D009 T C A T D G G D A A G G G T A T C A A C G C D G T T G G A C C A C C C A G A A G A T C T C G A G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T T G C C G C G G T G C G G A G T G C G D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A A G T G T A A A T G A G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C C G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G G G C 0 D010 T (C) A A I G (G) D (A) A (G) [G] [G] [T] [A] [T] C A A T A T D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G G C G C T (T) A A I G (A) D (C) A (A) [A] [A] [T] [G] [T] C A A C G C D C T A G G G C T A C C C A G A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G I G G T G T T G C T T A C T G C T T T G C G G A G T G C G I A I A T G C G G G T G C A T 1 G G G C I A G G C C A T A A A G G G C T G A A G A G G C G T A A A T G G G C G C 0 D011 G C A A I G G D A A G G G T A T C A T C G C D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G (T) C G 3 (A) A T (C) D C A A T T A C G A (A) (A) A G C T G A A (G) A G G (C) G T A A A T G G G C G C T C A T D G G D A A G G G T A T C A A C G C D G T T G G A C C A C C C A G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G (C) C G 3 (G) A T (A) D C A A T T A C G A (G) (G) A G C T G A A (T) A G G (T) G T A A A T G G G C G C 0 D012 T C A A I G G D C A G A G T A T C A A T A T D C C A G G G A C G T C C A G A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G I G G T G T T G C T T A C T G C T T T G C G A A G T G C G I A I A T G C G G G T G C A T 1 G G G C I A G G C C A T A A A G G G C T G G G T G G A C G A A G A T A G G C G T T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C C G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G G G C 0 D013 T C A A I G G D C A G A G T A T C A A C G C D C T A A G G A C A C C T A G A G G G T C T C G G G C T A C A C T C G I G A [T] G T T G C C T A C C G C G G T G C G G A G T T C G I G I A T G C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A G G C G T G A A T G G G C G C T C A A I C G I A A G A G T A T C A A C G C D C T A G G G C T A C C C A G A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G I G G T G T T G C T T A C T G C T G T G C G A A G T G C G I A I A T G C G G G T G C A T 1 G G G C I A G G C C A T A A A G G G C T G G G G G G A C G A A G A T A G G C G T 0 D014 T C A A I G G D C A G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C C G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G G G C 0 D015 T C A A I G G D C A G G G T G T C A A T A T D C C A G G G A C G T C C A G A A G G T C T C A G C C T A T A T T C G I G A T G T T G C C T A C T G C T G T G C T G A G T G C G D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A A G T G T A A A T G A G C G C T T A A I G A D C A A A A T G T C A A C G C D C T A G G G C T A C C C A G A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G I G G T G T T G C T T A C T G C T T T G C G G A G T G C G I A I A T G C G G G T G C A T 1 G G G C I A G G C C A T A A A G G G C T G G G G G G A C G A A G A T A G G C G T 0 D016 T C A T D G G D A A G G G T A T C A A C G C D G T T G G A C C A C C C A G A A G G T C T C A G C C T A T A T T C G I G A T G T T G C C T A C T G C T G T G C T G A G T G C G D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A A G T G T A A A T G A G C G C T T A A I G A D C A A A A T G T C A A C G C D C T A G G G C T A C C C A G A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G I G G T G T T G C T T A C T G C T T T G C G A A G T G C G I A I A T G C G G G T G C A T 1 G G G C I A G G C C A T A A A G G G C T G G G G G G A C G A A G A T A G G C G T 0 D033 G C A A I G G D A A G G G T A T C A T C G C D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 2 G A T C D C A A T T A C G A A G A A C T G G G G G G A C G T A A A T G G G C G C T C A A I G G D C A G A G T A T G A A C G C D C T A G G G C C A C T C A G A A G G T C T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T T G C C G C G G T G C G G A G T T C G I A I A T G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G C C G C 0 D034 T C A A I G G D C A G A G T A T C A A T A T D C C A G G G A C G T C C A G A G G (A) T C T C G G G C T A C A C T C G I G A (C) G T T G C T T G C C G C G G T G C G G A C T G (C) G I G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T C D C A A T T A C G A A G A A C T G G G G G G A C G T A A A T G G G C G C T C A T D G G D A A G G G T A T C A T C G C I C T A G G G A C A C C C G G G A C (G) T C T C G G G A T A C T T T C G I G A (T) G T T G T T T G T C G C G G G A C G G A C T G (T) G I G D A T G C G A G A G C C G 2 G A T C D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A G G C G T G A G T G G G C G C 0 D035 T C A T D G G D A A G G G T A T C A A C G C D G T T G G A C C A C C C A G A A G A T C T C G A G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T T G C C G C G G T G C G G A C T G C G I G I A C G C G G G A G T C G 3 A A T C D C A A T T A C G A A A A G C T G A A G A G G C G T A A A T G G G C G C T T A A I G A D C A A A A T G T C A A T A T D C C A G G G A C G T C C G G A A G G T C T C G G G C T A T A T T C G I G A T G T T G C C T A C T G C T G T G C G G A G T G C G D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A A G T G T A A A T G A G C G C 0 D036 T C A A I G G D C A G A G T A T C A T C G C D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G G C G C T C A A I G G D C A G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C 0 D037 T C A A I G G D C A G A G T A T C A A T A T D C C A G G G A C G T C C A G A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G I G G T G T T G C T T A C T G C T T T G C G A A G T G C G I A I A T G C G G G T G C A T 1 G G G C I A G G C C A T A A A G G G C T G G G G G G A C G A A G A T A G G C G T T C A A I G G D C A G A G T A T C A A T A T D C C A G G G A C G T C C A G A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G I G G T G T T G C T T A C T G C T T T G C G A A G T G C G I A I A T G C G G G T G C A T 1 G G G C I A G G C C A T A A A G G G C T G G G G G G A C G A A G A T A G G C G T 0 D038 G C A A I G G D A A G G G T A T C A T C G C D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G G C G C T T A A I G A D C A A A A T G T C A A T A T D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G G C G C 0 D039 T C A A I C G I A A G A G T A T C A A C G C D C T A G G G C T A C C C G G A A G G T C T C G G G C T A T A T T C G I G A T G T T G C C T A C T G C T G T G C G G A G T G C G D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A A G T G T A A A T G A G C G C T C A A I C G I A A G A G T A T C A A C G C D C T A G G G C T A C C C [G] G A A G G T C T C G G G C T A T A T T C G I G A T G T T G C C T A C T G C T G T G C G G A G T G C G D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A A G T G T A A A T G A G C G C 0 D040 T C A A I G G D A A G G G C A C C A T C G C I C T A G G G A C A C C C G G G A C G T C T C G G G A T A C T T T C G I G A T G T T G T T T G T C G C G G G A C G G A C T G C G I G D A T G C G A G A G C C G 2 G A T C D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A G G C G T G A G T G G G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C 0 E001 T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C 0 E002 G C A A I G G D A A G G G T A T C A T C G C D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G C C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A G A G G G G C T T G G G C T A C A T T C G I G A T G T T T C T T A C T A T G G T G C G G A C T G T G I G I T C G C G G T A A C C G 3 G A T C D C A A T T A C G C A G A G C T T A A G A G G C G T G A A T G G G C G C 0 E003 T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C 0 E004 T C A A I G G D A A G G G C A C C A T C G C I C T A G G G A C A C C C G G G A C G T C T C G G G A T A C T T T C G I G A T G T T G T T T G T C G C G G G A C G G A C T G C G I G D A T G C G A G A G C C G 2 G A T C D C A A T T A C G A A G A [G] C T G A A G A G G C G T G A G G G G G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C 0 E005 G C C A I G G D A G G G G T A T C A T C G C D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G C C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C 0 E006 T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C 0 E007 T C A A I G G D A A G G G C A C C A T C G C I C T A G G G A C A C C C G G G A C G T C T C G G G A T A C T T T C G I G A T G T T G T T T G T C G C G G G A C G G A C T G C G I G D A T G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C 0 E008 G C C A I G G D A G G G G T A T C A T C G C D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G C C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C 0 E009 T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C 0 E010 T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C T C C A D G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C 0 E011 T C A A I G G D C A G A G T A T C A A C G C D C T A G G G C T A C C C G G A A G G T C T C G G G C T A T A T T C G I G A T G T T G C C T A C T G C T G T G C G G A G T G C G D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A A G T G T A A A T G A G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A G A G G G G C T T G G G C T A C A T T C G I G A T G T T T C T T A C T A T G G T G C G G A C T G T G I G I T C G C G G T A A C C G 3 G A T C D C A A T T A C G C A G A G C T T A A G A G G C G T G A A T G G G C G C 0 E012 T C A A I G G D A A G G G C A C C A T C G C I C T A G G G A C A C C C G G G A C G T C T C G G G A T A C T T T C G I G A T G T T G T T T G T C G C G G G A C G G A C T G C G I G D A T G C G A G A G C C G 2 G A T C D C A A T T A C G A A G A [G] C T G A A G A G G C G T G A G G G G G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A C G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G G C G C 0 E013 T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 2 G A T C D C A A T T A C G A A G A A C T G G G G G G A C G T A A A T G G G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C 0 E014 G C A A I G G D A A G G G T A T C A T C G C D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 2 G A T C D C A A T T A C G A A G A A C T G G G G G G A C G T A A A T G G G C G C T C A A I G G D C A G G G T G T C A A T A T D C C A G G G A C G T C C G A A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A [T] G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G G C G C 0 E015 T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A G A G G G G C T T G G G C T A C A T T C G I G A T G T T T C T T A C T A T G G T G C G G A C T G T G I G I T C G C G G T A A C C G 3 G A T C D C A A T T A C G C A G A G C T T A A G A G G C G T G A A T G G G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C 0 E016 T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A G A G G G G C T T G G G C T A C A T T C G I G A T G T T T C T T A C T A T G G T G C G G A C T G T G I G I T C G C G G T A A C C G 3 G A T C D C A A T T A C G C A G A G C T T A A G A G G C G T G A A T G G G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C 0 E017 T C A A I G G D C A G A G T A T C A A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A G A G G G G C T T G G G C T A C A T T C G I G A T G T T T C T T A C T A T G G T G C G G A C T G T G I G I T C G C G G T A A C C G 3 G A T C D C A A T T A C G C A G A G C T T A A G A G G C G T G A A T G G G C G C 0 E018 G C C A I G G D A G G G G T A T C A T C G C D C C A G G G A C G T C C G G A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G C C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C 0 E019 T C A A I G G D A A G G G C A C C A T C G C I C T A G G G A C A C C C G G G A C G T C T C G G G A T A C T T T C G I G A T G T T G T T T G T C G C G G G A C G G A C T G C G I G D A T G C G A G A G C C G 2 G A T C D C A A T T A C G A A G A G C T G A A G A G G C G T G A G T G G G C G C T C A A I G G D C A G A G T A T C A A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C 0 E020 T C A A I G G D A A G G G C A C C A T C G C I C T A G G G A C A C C C G G G A C G T C T C G G G A T A C T T T C G I G A T G T T G T T T G T C G C G G G A C G G A C T G C G I G D A T G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C 0 E021 T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A G A G G G G C T T G G G C T A C A T T C G I G A T G T T T C T T A C T A T G G T G C G G A C T G T G I G I T C G C G G T A A C C G 3 G A T C D C A A T T A C G C A G A G C T T A A G A G G C G T G A A T G G G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C 0 E022 T C A A I G G D C A G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G G T C T C G G G C T A C A T T C G D A A T G T T G C T T A C T G C T G T G C G G G G C T C G I G I A T C C G G T A G C C G 3 G A T C D C A A T T T C G A A G A G A C G A A G A G G C G T G A A G G G G C G C 0 E023 T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A G A G C C A C T C A A A A G A T A T C G G G C C T C A C C T A I G A C C A C G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C T D G I A C G T G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A G G A G C T G A A T A G G T G T A A A T G G G C G C T C C A I G G D A G G A G T A T G T A C G C D C T A A G G A C A C C T G A A G G A T A C C G G G C C T C A C C T A I G A C C A T G C T C G C C G C G G T G A G G A G T G C G D G I A C G C G G G A G C C G 3 G A T A D C A A T T A C G A A G A G C T G A A T A G G T A T A A A T G G G C A C END BESTPAIRS1 Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in [] with phase known positions indicated by = BEGIN BESTPAIRS2 0 D001 G = = A I = = = = = = = = = = = = = T = = = = C C ? = = G A = G T = = G = = = = = = A = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = A = = = G = = = T D = = = = = T = = = ? = C = = = G = = A = = = = = = = = = = G G = = = = = = = ? = ? ? T = = = = = = = = = = = = T = = T D = = = = = = = = = = = = = A = = = = G T ? = = A C = A C = = A = = = = = = C = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = C = = = C = = = G I = = = = = C = = = ? = T = = = A = = C = = = = = = = = = = A A = = = = = = = ? = ? ? C = = = = = = = = = = = = 0 D002 G = = = = = = = A = = = = = A = = = T C G C = = = = = = = = = = = = = G = = = = A = A = = G = G = C T C = C C T A = = = C C A = = = T C G = C = = G = = = A G = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = G = = = = T = = = = = = = C = = = = = G = = = A T A T = = = = = = = = = = = = = A = = = = G = C = = A = C = T A T = T T C G = = = T G T = = = C T A = T = = T = = = C T = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = A = = = = 0 D003 = = A = = C = I C A = = = = = = C A = = = = = = = = G = = C T = = = C = G = A = G = C T = = = = = T A T = T T C G = = = T G T = = = C T A = T = = T = = = C = = = = = = = = = = = = = = T = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = A = = G = = = = = = A = = G = = = C = = G = D A G = = = = = = G T = = = = = = = = A = = A C = = = T = A = G = A = A C = = = = = C T C = C C T A = = = C C A = = = T C G = C = = G = = = A = = = = = = = = = = = = = = C = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = G = = A = = = = = = G = = A = 0 D004 = = A = = = = = C A = ? ? ? ? ? C A = T A T = = C = = G = A = G T C = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = I G G = = = = = = = = = = = = = = T = = = = A A = T G = = = A = = = G = = = G T = = A T 1 = G G = I A G G C C A T A = ? ? ? ? ? T = G G = G = A = = A A G = T A = = = = T = = C = = = = = A G = ? ? ? ? ? G T = C G C = = T = = A = C = A C T = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D A A = = = = = = = = = = = = = = G = = = = G G = C T = = = G = = = C = = = T A = = C G 3 = A T = D C A A T T T C G = ? ? ? ? ? C = A A = A = G = = T G A = G G = = = = C 0 D005 = = = = = ? ? D = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = C = = T = A = = = = = = = = = = = = = C T C = C C T A = = = C C A = = = T = G = C = = G = = = = = = = = = T = = I A = = T = C = = = T = = A T 1 = G G C I A G G C C = T A = = = G = = = = G G = G G A C = A = G = = A G = = = T = = = = = ? ? I = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = T = = C = G = = = = = = = = = = = = = T A T = T T C G = = = T G T = = = C = A = T = = T = = = = = = = = = G = = D G = = C = T = = = A = = C G 3 = A T A D C A A T T = C G = = = A = = = = A A = A A G T = T = A = = G A = = = C 0 D006 (G) = = (A) (I) = = = = = = = = = = = = = A = = = = C C ? = = = A = G T = = G = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = A = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = G I A = = T = C ? ? ? ? ? ? A T 1 = G G C I A G G C C = T A = A = G = = = = G G G G = A C = A = G = = A = = = = T (T) = = (T) (D) = = = = = = = = = = = = = T = = = = G T ? = = = C = A C = = A = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = G = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = T D G = = C = T ? ? ? ? ? ? C G 3 = A T A D C A A T T = C G = G = A = = = = A A T A = G T = T = A = = G = = = = C 0 D007 G C C = = = G = A G G G G = A = = = T = = = = = C = = = = A C G T = = G = = = = A = A = = = = = = C T = = C C T A = = A C C A = = = = C G = C = = G G = = A = G = = = = = T D G = = C = T = = = ? = = C G 3 = A T A D C A A T T = C G = G = A = = = = A A T A = G T = T = A = = G = C = = C T T A = = = A = C A A A A = G = = = A = = = = = T = = = = C T A C = = A = = = = G = C = = = = = = T A = = T T C G = = G T G T = = = = T A = T = = T T = = C = A = = = = = G I A = = T = C = = = ? = = A T 1 = G G C I A G G C C = T A = A = G = = = = G G G G = A C = A = G = = A = G = = T 0 D008 = C = T D = G = A = G G G = A = = = = C G C = G ? ? = = A C = A C = = ? = = = = = = C = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = C = = = C = = = G I = = = = = C = = = ? = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = (A) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = A I = A = C = A A A = G = = = = T A T = C ? ? = = G A = G T = = ? = = = = = = A = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = A = = = G = = = T D = = = = = T = = = ? = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = (G) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 D009 = = A T D = = = = A ? G = = = = C A = = = = = G = T G = A C = = = = C A G = A = = = C T = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = T G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = A ? = G = = = = = = A = C = = = = C A I = = = = G ? A = = = = G T = = = = = C = A A = G A = = = = T G A = G = = = A C = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = C C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = G ? = A = = = = = = G = G = = 0 D010 = (C) = = ? = (G) = (A) = (G) ? ? ? ? ? = = = T A T = ? ? = = = = A C G T = = G = = = = A = A = = = = = = C T = = C C T A = = A C C A = = = = C G = C = = G G = = A = = = = = = = T D G = = C = T = ? ? ? ? ? C G 3 = A T A D C A A T T = C G = G = A = = = = = = T = = = T = = = = = = = = = = = = = (T) = = ? = (A) = (C) = (A) ? ? ? ? ? = = = C G C = ? ? = = = = C T A C = = A = = = = G = C = = = = = = T A = = T T C G = = G T G T = = = = T A = T = = T T = = C = = = = = = = G I A = = T = C = ? ? ? ? ? A T 1 = G G C I A G G C C = T A = A = G = = = = = = G = = = C = = = = = = = = = = = = 0 D011 G = = A I = = = = = = = = = = = = = T = = = = C C A = = G ? = ? T = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = (T) = = = (A) = = (C) = = = = = = = = = = (A) (A) = = = = = = = (G) = = = (C) = = = = = = = = = = = = T = = T D = = = = = = = = = = = = = A = = = = G T T = = A ? = ? C = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = (C) = = = (G) = = (A) = = = = = = = = = = (G) (G) = = = = = = = (T) = = = (T) = = = = = = = = = = = = 0 D012 = = A = = = = = C A = = = = = = C A = T A T = = C = G = = = = G T = C A G = A = G = C T = = = = = T A = = T T C G = = G T G T = = = = T A = T = = T T = = C = A = = = = = = I A = = T = = G = = T = = A T 1 = G G C I A G G C C = T A = ? ? ? ? ? = = G G = G = A C G A = G = = A = = C = T = = C = = = = = A G = = = = = = G T = C G C = = T = A = = = = A C = T G A = G = A = A C = = = = = C T = = C C T A = = A C C A = = = = C G = C = = G G = = A = G = = = = = = D G = = C = = C = = A = = C G 3 = A T A D C A A T T = C G = ? ? ? ? ? = = A A = A = G T A T = A = = G = = G = C 0 D013 = = = = = G = D C = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = A C = = = T ? = = G = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = ? ? ? ? ? = = C = = = C = = G = = = = = G = = = T = = = G = = = = = = = T A = = C G 3 = A T = D C A A T T = C G = = = A = = = = A A = A = G = = T G A = = G = ? ? ? ? = = = = = C = I A = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = C T = = = C ? = = A = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = ? ? ? ? ? = = T = = = T = = T = = = = = A = = = G = = = A = = = = = = = G T = = A T 1 = G G = I A G G C C = T A = = = G = = = = G G = G = A = = A A G = = A = ? ? ? ? 0 D014 = = A = = = = = C A = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = ? = C A = = = C = = = = = A G = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = ? = G G = 0 D015 = C = = = = G = = = G G G = = = = = = T A T = = C = = = = A C G T = = = = = = = = = = = = A = C = = = T = = = = = = = A = = = = = = C = = = = = = = G = = = T = = = = = = = D G = = C = T = ? ? ? ? ? C G 3 = A T A D C A A T T = C G = = = A = = = = A A = A ? G T = T = A = = G A = = = C = T = = = = A = = = A A A = = = = = = C G C = = T = = = = C T A C = = = = = = = = = = = = G = G = = = C = = = = = = = G = = = = = = T = = = = = = = T = = = G = = = = = = = I A = = T = C = ? ? ? ? ? A T 1 = G G C I A G G C C = T A = = = G = = = = G G = G ? A C = A = G = = A G = = = T 0 D016 = C = T D = G = A = G G G = A = = = = = = = = G = T = = A = C = = = = = = = = = = = = = = A = C = = = T = = = = = = = A = = = = = = C = = = = = = = G = = = T G = = = = = = D G = = C = T = = = A = = C G 3 = A T A D C A A T T = C G = = = A = = = = A A = A A G T = T = A = = G A = = = C = T = A I = A = C = A A A = G = = = = = = = = C = A = = G = T = = = = = = = = = = = = = = G = G = = = C = = = = = = = G = = = = = = T = = = = = = = T = = = G A = = = = = = I A = = T = C = = = T = = A T 1 = G G C I A G G C C = T A = = = G = = = = G G = G G A C = A = G = = A G = = = T 0 D033 G = = = = = = = A = = G = = = = C = T = = = ? = C = = = = A = G T C = G = = = = A = A ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = A = = = = = G = T D G = = C ? T = = = = = = = = 2 = = = C = = = = = = = = = = A = = A = = = G G G G = A ? = = = = = = = = G = = = T = = = = = = = C = = A = = = = G = A = = = ? = T = = = = C = A C T = A = = = = G = C ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = C = = = = = T = G I A = = T ? C = = = = = = = = 3 = = = A = = = = = = = = = = G = = G = = = A A T A = G ? = = = = = = = = C = = = 0 D034 = = = A ? = = = C = = A = = = = = = A T A T D = C = = = = = = G T = = ? = A G G (A) = = = = = = = C = = = A C = = = = = = (C) = = = = C = = = C = = = = = T G = = = = = = = (C) = = = I = C = = = G = = = = = = 3 = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = G G = G = A = = = A = A = = = = = = = = = = T ? = = = A = = G = = = = = = T C G C I = T = = = = = = A C = = ? = G A C (G) = = = = = = = A = = = T T = = = = = = (T) = = = = T = = = T = = = = = G A = = = = = = = (T) = = = D = T = = = A = = = = = = 2 = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = A A = A = G = = = G = G = = = = = = = 0 D035 = C = T D = G = A = G G G = A = = = = C G C = G T T = = A C = A C = = A = = = = A = = = = = A = = C T C = C C T A = = = C C A = = = T = G = C = = G = = = = = = = C = = = = I = = = = = C = = = = = T = = = A = = C = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = G = C = = = = = = = G = = = = = T = A I = A = C = A A A = G = = = = T A T = C C A = = G A = G T = = G = = = = G = = = = = G = = T A T = T T C G = = = T G T = = = C = A = T = = T = = = = = = = G = = = = D = = = = = T = = = = = C = = = G = = A = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = A = T = = = = = = = A = = = = 0 D036 = = = = ? = = = = = = = = = = = C A T = = = = = C = G = = = = G T = C = G = A = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = G = = = = = = = = = G = = = = = ? = = = = = = = = = = = G T A = = = = = T = A = = = = A C = T = A = G = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = A = = = = = = = = = A = 0 D037 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 D038 G C = = = = G = A = G G G = A = = = T C G C = = = ? = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = T T = = = = A = C = A A A = G = = = A T A T = = = ? = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = 0 D039 ? = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = ? ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = ? ? = = = = = = = = = = = = = 0 D040 = = A = = = = = = A = G = C = C ? ? ? = = = I = = = G = = = = = = = C = G G A C G = C T = = = = A T A = T T T C G = = = T G T = = T = T = T = = = = = G A C = = = C = = = = I ? D = T = = = A = = = = = = 2 = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = ? ? C G = G = G = = = = = G = = = C = = = = = = G = A = T = T ? ? ? = = = D = = = A = = = = = = = T = A A G G A = A C = = = = C C T = A C C T A = = = C C A = = C = C = C = = = = = T G A = = = G = = = = D ? I = C = = = G = = = = = = 3 = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = ? ? T A = A = A = = = = = A = 0 E001 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G A = C = = = T C A = = A = G = C T = = = = = T A = = T T C G D A = T G T = = = = T A = T = = T = = = C = = G = C T = = I = = = T C = = = T ? = = = = = = = = C = = = = = = T = = = = = = = A C = = = G = = = C G = G = = G = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A G = A = = = C T G = = G = A = A C = = = = = C T = = C C T A I G = C C A = = = = C G = C = = G = = = A = = A = T G = = D = = = C G = = = G ? = = = = = = = = A = = = = = = A = = = = = = = C T = = = T = = = T A = A = = T = = = = A = 0 E002 G = A = = = = = = A = G = = = = C A T = = = = = C = = G = A = G T C = G = = A = A T A = C = = = = C T = = C C T A = = = C C A = G = = C ? = C G C = = = = A = = = G = = C T D = = A = = T = = G = G = = = = = = = A = ? = = = = = = = A G = = = = = G = = T = = = T = = A = = = = = C = = = T = C = = = = = = G = A = = = = G T A = = = = = T = = A = C = A C T = A = = G = G G C = T = = = = T A = = T T C G = = = T G T = T = = T ? = T A T = = = = C = = = C = = T G I = = T = = C = = T = A = = = = = = = C = ? = = = = = = = C A = = = = = T = = G = = = C = = G = = = = = G = = = 0 E003 = ? ? = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = G A = C = = = T C A = = A = G = C T = = = = = T A = = T T C G D A = T G T = = = = T A = T = = T = = = C = = G = C T = = I = = = T C = = = T = = = = = = = = = C = = = = = = T = = = = = = = A C = = = G = = = C G = G = = G = = = = G = = ? ? = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = A G = A = = = C T G = = G = A = A C = = = = = C T = = C C T A I G = C C A = = = = C G = C = = G = = = A = = A = T G = = D = = = C G = = = G = = = = = = = = = A = = = = = = A = = = = = = = C T = = = T = = = T A = A = = T = = = = A = 0 E004 = = A = = = = = = A = G = C = C C A T = = = I = = = = G = A = = = C = G G G = C = = = = = = = = A = = = T = = = = I G = ? ? ? ? = T = = G T C = = G = G A = = = A C T G = = = = D = = G = = A G = = = = = 2 = = = = = = = = = = A = = = ? ? ? ? ? T = ? ? = = = = = = = = = G = = = = = = = = = C = = = = = = G = A = T = T G T A = = = D = = = = A = C = = = T = A A A = G = = = = = = = = C = = = A = = = = D A = ? ? ? ? = C = = A C T = = T = T G = = = G G C T = = = = I = = C = = G T = = = = = 3 = = = = = = = = = = T = = = ? ? ? ? ? C = ? ? = = = = = = = = = A = = = = = = = 0 E005 G = = = = = = = = = = G = = = = C A T = = = = = C = = G = A = G T C = G G = = = A = A = = = = = = C T = = C C T A I G = C C A = = = = C G = C = = G = = ? ? = = A = T G = T D = = = C G T = = G = = = = = = = = = A = = = = = = A = = = G = = = C T = = = T = = = T = = A = = T = = C = = = T = = = = = = = = = = A = = = = G T A = = = = = T = = A = C = A C T = A A = = = G = C = = = = = = T A = = T T C G D A = T G T = = = = T A = T = = T = = ? ? = = G = C T = G I = = = T C C = = T = = = = = = = = = C = = = = = = T = = = A = = = A C = = = G = = = C = = G = = G = = G = = = 0 E006 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G A = C = = = T C A = = A = G = C T ? ? ? ? ? T A = = T T C G D A = T G T = = = = T A = T = = T = = = C = = G = C T = = I = = = T C = = = T = = = = = = = = = C = = = = = = T = = = = = = = A C = = = G = = = C G = G = = G = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A G = A = = = C T G = = G = A = A C ? ? ? ? ? C T = = C C T A I G = C C A = = = = C G = C = = G = = = A = = A = T G = = D = = = C G = = = G = = = = = = = = = A = = = = = = A = = = = = = = C T = = = T = = = T A = A = = T = = = = A = 0 E007 = = ? = = = = = = A = G = C = C C A T = = = I = = = G = = = = = = = C = G G A C G = C T = = = = A T A = T T ? ? ? ? = = T G T = = T = T = T = = = = = G A C = = = C = = = = I ? D = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = G = A = T = T G T A = = = D = = = A = = = = = = = T = A A G G A = A C = = = = C C T = A C ? ? ? ? = = C C A = = C = C = C = = = = = T G A = = = G = = = = D ? I = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = 0 E008 G = = = = = = = = = = G = = = = C A T = = = = = C = = G = A = G T C = G G = = = A = A = = = = = = C T = = C C T A I G = C C A = = = = C G = C = = G = = = A = = A = T G = T D = = = C G T = = G = = = = = = = = = A = = = = = = A = = = G = = = C T = = = T = = ? T = = A = = T = = C = = = T = = = = = = = = = = A = = = = G T A = = = = = T = = A = C = A C T = A A = = = G = C = = = = = = T A = = T T C G D A = T G T = = = = T A = T = = T = = = C = = G = C T = G I = = = T C C = = T = = = = = = = = = C = = = = = = T = = = A = = = A C = = = G = = ? C = = G = = G = = G = = = 0 E009 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E010 = = = = I = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E011 = = A = = = = = C A = = = = = = C A = = = = = = = = = G = = T = = C = ? = = A = = T = = C = = = = = = T = = = = = = = = = = = = G = C = = = = G C T = = = = = = = G = = C = D = = A = = T = = G = G = = = = = = = A = = = = = = = = = A = = = = = = G = = = = A = T = = A = = = = A = = = = = = C = = = = = A G = = = = = = G T = = = = = = = = = A = = C = = T = ? = = G = = G = = T = = = = = = C = = = = = = = = = = = = T = T = = = = A T G = = = = = = = C = = T = I = = T = = C = = T = A = = = = = = = C = = = = = = = = = C = = = = = = T = = = = G = C = = G = = = = G = = = = 0 E012 = = A = = = = = = A = G = C = C C A T = = = I = = = = G = A = = = C = G ? ? = C G = C = = = = = A T A = T T T C G = = = T G T T = T = T = T = = = = = G A C = = = C = = = G I ? D = T = C = A = = = = = = 2 = ? ? C = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? ? = = = G = = = C = = G = G G = = = = = = = = C = = = = = = G = A = T = T G T A = = = D = = = = A = C = = = T = A ? ? = G A = A = = = = = C C T = A C C T A = = = C C A C = C = C = C = = = = = T G A = = = G = = = T D ? I = C = T = G = = = = = = 3 = ? ? A = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? ? = = = T = = = T = = A = A T = = = = = = 0 E013 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = A = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = T = = = = = = = = 2 = = = C = = = = = = = = = = = = = A = = = G G G G = A C G = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = G = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = C = = = = = = = = 3 = = = A = = = = = = = = = = = = = G = = = A A T A = G T A = = = = = = = = = A = 0 E014 G = = = = = = = A = = = = = A = = = T C G C = = = ? = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 2 = = = C = = = = = = = = = = A = = A = = = G G G G = A C = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = C = = = = = G = = = A T A T = = = ? = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 3 = = = A = = = = = = = = = = G = = G = = = A A T A = G T = = = = = = = = = = = = 0 E015 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G A = C = = = T C A G = = = G G C T T = = = = T A = = T ? ? ? ? = = T G T = T = = T A = T A T = = = = C = = = C = ? ? ? I = = T = = = = = T = A = = = = = = = C = = = = = = = = = C = = = = = = T = = G = = = C G = G = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A G = A = = = C T G A = = = A T A C C = = = = C T = = C ? ? ? ? = = C C A = G = = C G = C G C = = = = A = = = G = ? ? ? D = = A = = = = = G = G = = = = = = = A = = = = = = = = = A = = = = = = G = = T = = = T A = A = = = = = = = A = 0 E016 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = G = = G = = T = = = = = = = = = = = = I G = = = = = T = = = = = = A T G = = = = = = A C T G T = = = = T C G = = = = = A = = = = = = = = = ? = ? = = A = = C = = = = C T T = = = = = ? ? ? ? ? = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = A = = T = = C = = = = = = = = = = = = D A = = = = = G = = = = = = G C T = = = = = = G G C T C = = = = A T C = = = = = G = = = = = = = = = ? = ? = = T = = A = = = = A C G = = = = = ? ? ? ? ? = = G = = = = = = 0 E017 = = A = = = = = C A = = = = = = C A ? = = = = = = = A G = A = = = C T ? A = = = A T A C C = = = = C T = = C C T A = = = C C A = G = = C G = C G C = = = = A = = = G = = C = D = = A = = = = = G = G = = = = = = = A = = = = = = = = = A = = = = = ? G = = T = = = T A = A = = = = = = = A = = = C = = = = = A G = = = = = = G T ? = = = = = = = G A = C = = = T C ? G = = = G G C T T = = = = T A = = T T C G = = = T G T = T = = T A = T A T = = = = C = = = C = = T = I = = T = = = = = T = A = = = = = = = C = = = = = = = = = C = = = = = ? T = = G = = = C G = G = = = = = = = G = 0 E018 G = = = = = = = = = = G = = = ? C A T = = = = = C = G = = = = G T = C = G = A = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = C = G = T = = = = = = = = = = A = = = ? G T A = = = = = T = A = = = = A C = T = A = G = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = G = A = 0 E019 = = = = = = = = A = = G = C = ? = = T = = = I = = = G = = = = = = = C = G G A C G = C T = = = = A T A = T T T C G = = = T G T = = T ? ? = T = = = = = G A ? ? = = C = = = = I ? D = T = = = A = = = = = = 2 = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = C G = G = G = = = = = G = = = = = = = = = C = = A = T = ? = = A = = = D = = = A = = = = = = = T = A A G G A = A C = = = = C C T = A C C T A = = = C C A = = C ? ? = C = = = = = T G ? ? = = G = = = = D ? I = C = = = G = = = = = = 3 = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = T A = A = A = = = = = A = 0 E020 = = A = = = = = = A = G = C = C C A T = = = I = = = = G = A = = = C = G G G = C = = = = = = = = A = = = T = = = = I G = = = = ? = T = = G T C = = G = G A = = = A C T G = = = = D = = G = = = G = = = = = = = = = A = = = = = = A = = = ? ? ? ? ? T = = = ? = = = T A = A = = T = = = = A = = = C = = = = = = G = A = T = T G T A = = = D = = = = A = C = = = T = A A A = G = = = = = = = = C = = = A = = = = D A = = = = ? = C = = A C T = = T = T G = = = G G C T = = = = I = = C = = = T = = = = = = = = = C = = = = = = T = = = ? ? ? ? ? C = = = ? = = = C G = G = = G = = = = G = 0 E021 = = = ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = = ? ? ? = = = = ? ? = G A = C = = = T C A G = = = G ? C T ? ? ? ? ? T A = = T ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? T = ? ? A = T A T = = = = C = = = C = = T = I = = T = = = = = T = A = = = = = = = C = = = = = = = = = C = = = = = ? T = = G = = = C G = G = = = = = = = G = = = = ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = = ? ? ? = = = = ? ? = A G = A = = = C T G A = = = A ? A C ? ? ? ? ? C T = = C ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? G = ? ? G = C G C = = = = A = = = G = = C = D = = A = = = = = G = G = = = = = = = A = = = = = = = = = A = = = = = ? G = = T = = = T A = A = = = = = = = A = 0 E022 = = A = = = = = C A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = C = = = = = A G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? 0 E023 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G A = C = = = T C A = = A = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A G = A = = = C T G = = G = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = A = END BESTPAIRS2 Phase probabilities at each site with phase known positions indicated by = and missing data positions indicated by ? BEGIN PHASEPROBS 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 ? = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = ? = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = ? = ? ? 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = ? ? ? ? ? 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = ? ? ? ? ? 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = = ? ? 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 0.79 = = 0.79 0.79 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 ? = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = 1.00 = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 ? ? ? ? ? ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = ? = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? ? = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = ? = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = ? = 0.98 = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.54 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 ? 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 ? = 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = 0.50 = = ? = 0.50 = 0.50 = 0.50 ? ? ? ? ? = = = 1.00 1.00 1.00 = ? ? = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = ? ? ? ? ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 ? = ? 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.52 = = = 0.52 = = 0.52 = = = = = = = = = = 0.52 0.52 = = = = = = = 0.52 = = = 0.52 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = ? ? ? ? ? = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 ? = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = ? ? ? ? ? = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = ? ? ? ? = = 0.90 = = = = = 0.90 0.90 = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = ? = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = ? ? ? ? ? 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 ? 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = ? = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 ? 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 ? = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 ? = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = ? = 1.00 1.00 1.00 0.52 = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = 0.66 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = 0.65 = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = ? = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 ? ? ? = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 ? 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = ? ? 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 ? = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = 0.97 = = = = = = 0.97 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 ? = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = ? = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = ? ? ? ? = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = = ? ? ? ? ? 1.00 = ? ? = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = ? ? = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 ? ? ? ? ? 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = ? = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 ? ? ? ? = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 ? 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = ? 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = ? = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 ? ? = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 ? 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = ? ? 1.00 = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? ? = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = ? = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 ? ? ? ? = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = ? ? ? 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = ? = ? = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = ? ? ? ? ? = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 ? = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 ? 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = ? 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = = ? 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = ? = = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 ? ? = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 ? ? = = 1.00 = = = = 1.00 ? 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = = ? = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = ? ? ? ? ? 1.00 = = = ? = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = = ? ? ? = = = = ? ? = 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 ? 1.00 1.00 ? ? ? ? ? 1.00 1.00 = = 1.00 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.00 = ? ? 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = ? 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = END PHASEPROBS