Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000190 T 0.07 0.20 0.14 C 0.93 0.80 0.86 0.13 0.33 0.24 000247 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 000260 A 0.05 0.02 0.03 G 0.95 0.98 0.97 0.09 0.04 0.07 000337 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 000916 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001054 G 0.43 0.26 0.35 A 0.57 0.74 0.65 0.49 0.39 0.45 001062 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 001175 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001178 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001262 A 0.17 0.03 0.11 G 0.83 0.97 0.89 0.29 0.05 0.20 001277 + 0.11 0.00 0.06 - 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 001399 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 001419 T 0.17 0.31 0.23 G 0.83 0.69 0.77 0.29 0.42 0.36 001449 T 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 001474 C 0.17 0.28 0.22 G 0.83 0.72 0.78 0.29 0.40 0.34 001505 C 0.11 0.31 0.20 G 0.89 0.69 0.80 0.19 0.42 0.31 001661 A 0.17 0.00 0.10 T 0.83 1.00 0.90 0.29 0.00 0.18 001999 T 0.08 0.11 0.10 C 0.92 0.89 0.90 0.15 0.19 0.17 002120 C 0.20 0.04 0.12 T 0.80 0.96 0.88 0.31 0.08 0.21 002174 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 002192 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 002221 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 002252 - 0.11 0.02 0.07 + 0.89 0.98 0.93 0.19 0.04 0.12 002307 T 0.42 0.54 0.49 C 0.58 0.46 0.51 0.49 0.50 0.50 002342 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 002397 G 0.00 0.09 0.04 C 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 002567 T 0.30 0.02 0.16 C 0.70 0.98 0.84 0.42 0.04 0.27 002646 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 002690 G 0.37 0.35 0.36 A 0.63 0.65 0.64 0.47 0.45 0.46 002704 G 0.28 0.37 0.33 A 0.72 0.63 0.67 0.41 0.47 0.44 002711 - 0.33 0.52 0.42 + 0.67 0.48 0.58 0.44 0.50 0.49 002780 T 0.24 0.11 0.18 C 0.76 0.89 0.82 0.36 0.20 0.29 002838 C 0.24 0.00 0.12 G 0.76 1.00 0.88 0.36 0.00 0.21 002853 T 0.24 0.00 0.12 C 0.76 1.00 0.88 0.36 0.00 0.21 002873 A 0.04 0.02 0.03 G 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 002895 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002922 C 0.26 0.35 0.30 T 0.74 0.65 0.70 0.39 0.45 0.42 002941 C 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 003045 A 0.04 0.09 0.07 G 0.96 0.91 0.93 0.08 0.16 0.12 003051 G 0.11 0.00 0.05 T 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 003190 A 0.28 0.35 0.32 C 0.72 0.65 0.68 0.41 0.45 0.43 003223 A 0.26 0.02 0.14 G 0.74 0.98 0.86 0.39 0.04 0.24 003357 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003367 A 0.35 0.37 0.36 G 0.65 0.63 0.64 0.45 0.47 0.46 003396 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003403 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003408 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003503 C 0.48 0.50 0.49 T 0.52 0.50 0.51 0.50 0.50 0.50 003534 T 0.02 0.05 0.03 C 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.06 003678 A 0.00 0.09 0.04 G 1.00 0.91 0.96 0.00 0.17 0.08 003847 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003888 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003924 T 0.19 0.24 0.21 C 0.81 0.76 0.79 0.30 0.36 0.33 004093 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004312 A 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004733 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 004897 A 0.31 0.00 0.16 G 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 004898 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004962 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005081 T 0.35 0.24 0.29 C 0.65 0.76 0.71 0.45 0.36 0.41 005280 T 0.65 0.26 0.46 C 0.35 0.74 0.54 0.45 0.39 0.50 005331 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005358 G 0.65 0.26 0.46 A 0.35 0.74 0.54 0.45 0.39 0.50 005408 C 0.11 0.00 0.05 T 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 005424 A 0.48 0.24 0.36 G 0.52 0.76 0.64 0.50 0.36 0.46 005436 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005598 G 0.26 0.64 0.44 A 0.74 0.36 0.56 0.39 0.46 0.49 005599 C 0.26 0.67 0.45 A 0.74 0.33 0.55 0.39 0.44 0.50 005641 G 0.26 0.66 0.46 A 0.74 0.34 0.54 0.39 0.45 0.50 005994 T 0.07 0.13 0.10 C 0.93 0.87 0.90 0.12 0.23 0.17 006286 T 0.04 0.03 0.04 C 0.96 0.97 0.96 0.08 0.05 0.07 006364 A 0.37 0.63 0.49 G 0.63 0.37 0.51 0.47 0.47 0.50 006373 G 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.10 0.05 006686 T 0.25 0.61 0.43 C 0.75 0.39 0.57 0.38 0.48 0.49 006968 A 0.04 0.02 0.03 G 0.96 0.98 0.97 0.08 0.05 0.07 007249 A 0.30 0.62 0.45 G 0.70 0.38 0.55 0.42 0.47 0.50 007270 A 0.13 0.00 0.07 G 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.13 007283 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007470 A 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 007682 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007718 G 0.14 0.00 0.07 A 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.14 007784 A 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.12 007785 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.06 0.03 008084 G 0.30 0.00 0.16 A 0.70 1.00 0.84 0.42 0.00 0.27 008141 A 0.05 0.00 0.03 G 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 008436 C 0.00 0.03 0.01 T 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.03 008476 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.03 008498 C 0.00 0.03 0.01 T 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 008942 A 0.13 0.00 0.07 C 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.13 009002 C 0.33 0.60 0.45 G 0.67 0.40 0.55 0.44 0.48 0.50 009057 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009080 C 0.02 0.02 0.02 A 0.98 0.98 0.98 0.04 0.05 0.04 009420 A 0.11 0.12 0.12 T 0.89 0.88 0.88 0.20 0.22 0.21 009429 G 0.11 0.13 0.12 C 0.89 0.87 0.88 0.20 0.23 0.21 009461 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 009485 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009809 T 0.14 0.00 0.07 C 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.13 010209 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010400 G 0.00 0.22 0.11 A 1.00 0.78 0.89 0.00 0.34 0.19 010893 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 011228 A 0.37 0.40 0.38 G 0.63 0.60 0.62 0.47 0.48 0.47 011238 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011256 T 0.37 0.40 0.38 C 0.63 0.60 0.62 0.47 0.48 0.47 011340 T 0.09 0.00 0.05 C 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 011507 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011807 C 0.22 0.30 0.26 T 0.78 0.70 0.74 0.34 0.42 0.38 012033 T 0.04 0.13 0.09 C 0.96 0.87 0.91 0.08 0.23 0.16 012056 + 0.04 0.00 0.02 - 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012114 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012286 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 012530 T 0.07 0.00 0.04 A 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.07 012632 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 012756 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 012799 T 0.16 0.03 0.10 A 0.84 0.97 0.90 0.27 0.05 0.18 013266 T 0.18 0.12 0.15 C 0.82 0.88 0.85 0.30 0.21 0.26 013394 T 0.09 0.00 0.05 C 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.10 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000337: AAAG 001277: TG 002252: AA 002711: ga 012056: GG 012114: gtt