Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000386 + 0.52 0.37 0.44 - 0.48 0.63 0.56 0.50 0.47 0.49 000864 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001138 + 0.21 0.00 0.11 - 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 001158 C 0.56 0.33 0.42 G 0.44 0.67 0.58 0.49 0.44 0.49 001440 A 0.04 0.22 0.13 G 0.96 0.78 0.87 0.08 0.34 0.22 001586 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001649 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001661 T 0.43 0.41 0.42 C 0.57 0.59 0.58 0.49 0.48 0.49 001764 A 0.18 0.39 0.29 G 0.82 0.61 0.71 0.30 0.48 0.41 002102 C 0.15 0.00 0.07 G 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 002172 C 0.50 0.37 0.44 T 0.50 0.63 0.56 0.50 0.47 0.49 002180 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002274 T 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 002619 A 0.04 0.24 0.14 G 0.96 0.76 0.86 0.08 0.36 0.24 002902 T 0.03 0.06 0.04 C 0.97 0.94 0.96 0.05 0.10 0.08 002905 C 0.31 0.31 0.31 T 0.69 0.69 0.69 0.43 0.42 0.43 002926 T 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.21 0.00 0.12 002987 T 0.31 0.31 0.31 G 0.69 0.69 0.69 0.43 0.42 0.43 003388 C 0.39 0.39 0.39 T 0.61 0.61 0.61 0.47 0.47 0.47 003480 T 0.15 0.00 0.09 C 0.85 1.00 0.91 0.26 0.00 0.16 003604 + 0.02 0.18 0.10 - 0.98 0.82 0.90 0.04 0.30 0.18 003665 C 0.38 0.39 0.38 T 0.62 0.61 0.62 0.47 0.47 0.47 003896 G 0.04 0.00 0.03 A 0.96 1.00 0.97 0.08 0.00 0.05 004216 A 0.06 0.32 0.18 G 0.94 0.68 0.82 0.12 0.43 0.30 005003 C 0.02 0.18 0.10 T 0.98 0.82 0.90 0.04 0.30 0.18 005158 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005287 G 0.32 0.39 0.35 A 0.68 0.61 0.65 0.43 0.47 0.46 005304 A 0.32 0.39 0.35 G 0.68 0.61 0.65 0.43 0.47 0.46 005354 T 0.02 0.16 0.09 A 0.98 0.84 0.91 0.04 0.27 0.17 005431 A 0.33 0.39 0.36 G 0.67 0.61 0.64 0.44 0.47 0.46 006036 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006081 G 0.36 0.36 0.36 A 0.64 0.64 0.64 0.46 0.46 0.46 006336 G 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 006488 A 0.43 0.43 0.43 G 0.57 0.57 0.57 0.49 0.49 0.49 006542 C 0.15 0.00 0.08 T 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 006807 C 0.35 0.37 0.36 T 0.65 0.63 0.64 0.45 0.47 0.46 007090 G 0.22 0.43 0.32 A 0.78 0.57 0.68 0.34 0.49 0.44 007092 C 0.20 0.36 0.28 G 0.80 0.64 0.72 0.31 0.46 0.40 007244 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007478 G 0.20 0.37 0.28 A 0.80 0.63 0.72 0.31 0.47 0.41 007605 T 0.39 0.37 0.38 G 0.61 0.63 0.62 0.47 0.47 0.47 007746 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 007902 T 0.07 0.10 0.09 C 0.93 0.90 0.91 0.14 0.17 0.16 008168 T 0.35 0.34 0.35 C 0.65 0.66 0.65 0.46 0.45 0.45 008187 T 0.35 0.34 0.35 C 0.65 0.66 0.65 0.46 0.45 0.45 008328 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008429 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008630 - 0.35 0.34 0.35 + 0.65 0.66 0.65 0.46 0.45 0.45 009013 G 0.17 0.00 0.09 T 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 009115 G 0.02 0.11 0.07 A 0.98 0.89 0.93 0.04 0.19 0.12 009116 C 0.30 0.26 0.28 G 0.70 0.74 0.72 0.42 0.39 0.41 009489 A 0.33 0.24 0.28 G 0.68 0.76 0.72 0.44 0.36 0.40 009546 T 0.20 0.00 0.09 C 0.80 1.00 0.91 0.32 0.00 0.17 009615 A 0.29 0.26 0.28 G 0.71 0.74 0.72 0.41 0.39 0.40 010764 G 0.23 0.20 0.21 A 0.78 0.80 0.79 0.35 0.31 0.33 010901 + 0.20 0.20 0.20 - 0.80 0.80 0.80 0.31 0.31 0.31 011027 C 0.05 0.03 0.04 A 0.95 0.97 0.96 0.09 0.06 0.08 011449 A 0.04 0.20 0.12 G 0.96 0.80 0.88 0.08 0.31 0.21 011763 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011924 * 011925 C 0.21 0.00 0.11 G 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 012384 G 0.04 0.19 0.11 A 0.96 0.81 0.89 0.08 0.31 0.20 012516 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012619 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 012754 G 0.15 0.00 0.07 A 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 012757 G 0.21 0.20 0.20 T 0.79 0.80 0.80 0.33 0.31 0.32 012764 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013137 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 013534 G 0.50 0.46 0.48 C 0.50 0.54 0.52 0.50 0.50 0.50 013759 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014237 A 0.00 0.09 0.04 G 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 015098 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015114 C 0.50 0.46 0.48 G 0.50 0.54 0.52 0.50 0.50 0.50 015166 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015513 T 0.05 0.03 0.04 C 0.95 0.97 0.96 0.10 0.05 0.08 015592 A 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.15 016198 A 0.08 0.11 0.10 G 0.92 0.89 0.90 0.15 0.19 0.17 016401 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 016886 T 0.19 0.20 0.19 C 0.81 0.80 0.81 0.30 0.31 0.31 017079 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 017316 T 0.19 0.21 0.20 C 0.81 0.79 0.80 0.30 0.34 0.32 017594 G 0.06 0.34 0.20 A 0.94 0.66 0.80 0.12 0.45 0.31 017628 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017947 C 0.50 0.45 0.48 G 0.50 0.55 0.52 0.50 0.50 0.50 017965 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017979 G 0.04 0.18 0.11 A 0.96 0.82 0.89 0.08 0.30 0.19 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000386: C 001138: T 003604: T 008630: T 010901: A Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 011924 G 0.17 0.11 0.14 C 0.27 0.15 0.21 T 0.56 0.74 0.65