Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000209 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 000258 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 000657 CC 18 5 23 CG 5 8 13 GG 0 1 1 0.342 0.837 0.280 000780 AA 0 0 0 AG 0 4 4 GG 23 10 33 0.000 0.389 0.121 000800 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 21 14 35 0.012 0.000 0.007 001009 AA 20 19 39 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.026 001431 AA 24 18 42 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.014 0.006 001472 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 19 42 0.011 0.000 0.006 001581 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 19 42 0.011 0.000 0.006 001842 CC 22 23 45 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 002142 CC 22 21 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 002287 -- 21 22 43 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.012 0.000 0.006 003040 -- 0 0 0 +- 3 7 10 ++ 20 16 36 0.112 0.741 0.684 003041 CC 0 0 0 CT 5 9 14 TT 18 14 32 0.342 1.361 1.482 003128 GG 4 10 14 GT 15 11 26 TT 4 2 6 2.130 0.179 1.263 003134 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 18 23 41 0.342 0.000 0.152 003290 CC 13 6 19 CT 8 10 18 TT 2 3 5 0.221 0.120 0.054 003338 CC 0 1 1 CT 1 7 8 TT 22 11 33 0.011 0.007 0.355 003863 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 20 21 41 0.000 0.012 0.006 003930 GG 16 22 38 GT 4 0 4 TT 0 0 0 0.247 0.000 0.105 004100 -- 16 22 38 +- 4 0 4 ++ 0 0 0 0.247 0.000 0.105 004844 AA 20 10 30 AT 3 10 13 TT 1 3 4 2.617 0.040 1.934 004871 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 004921 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 19 23 42 0.324 0.000 0.148 005000 GG 24 22 46 GT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 005337 AA 1 10 11 AT 11 9 20 TT 11 1 12 0.741 0.330 0.206 006157 CC 5 14 19 CT 12 6 18 TT 4 1 5 0.444 0.114 0.054 006587 GG 4 3 7 GT 13 11 24 TT 6 9 15 0.445 0.016 0.266 006630 CC 14 10 24 CT 6 11 17 TT 3 2 5 2.407 0.179 0.545 006812 CC 19 10 29 CT 2 11 13 TT 1 2 3 4.455 0.179 0.792 007132 CC 0 0 0 CT 1 6 7 TT 22 17 39 0.011 0.517 0.312 007196 AA 1 2 3 AG 3 11 14 GG 19 10 29 2.457 0.179 0.513 007751 AA 1 3 4 AG 8 9 17 GG 12 8 20 0.053 0.032 0.019 008543 GG 8 1 9 GT 14 9 23 TT 2 10 12 1.434 0.330 0.111 008566 CC 23 20 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 008607 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 20 43 0.011 0.000 0.006 008623 -- 1 3 4 +- 3 8 11 ++ 20 9 29 2.617 0.292 3.012 008772 CC 24 20 44 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 008840 AA 4 1 5 AG 8 5 13 GG 12 15 27 1.500 0.429 2.608 008854 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 21 42 0.107 0.000 0.054 008976 AA 1 5 6 AG 8 9 17 GG 15 7 22 0.003 0.383 0.821 009060 CC 20 9 29 CG 3 9 12 GG 1 3 4 2.617 0.093 2.351 009189 AA 0 0 0 AG 1 5 6 GG 23 16 39 0.011 0.383 0.230 009395 AA 6 6 12 AG 8 9 17 GG 6 3 9 0.800 0.015 0.377 009598 -- 0 0 0 +- 1 6 7 ++ 22 17 39 0.011 0.517 0.312 009734 -- 0 3 3 +- 7 9 16 ++ 15 5 20 0.787 0.092 0.007 009801 CC 21 18 39 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 009923 CC 0 0 0 CG 3 0 3 GG 19 18 37 0.118 0.000 0.061 010050 AA 22 17 39 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.015 0.006 010397 CC 15 16 31 CT 5 1 6 TT 0 0 0 0.408 0.016 0.288 010398 AA 0 3 3 AG 4 8 12 GG 12 6 18 0.327 0.014 0.229 010699 GG 0 0 0 GT 0 2 2 TT 23 19 42 0.000 0.053 0.024 011146 CC 0 0 0 CG 0 2 2 GG 24 20 44 0.000 0.050 0.023 011492 CC 24 19 43 CG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.053 0.023 011765 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 22 23 45 0.011 0.000 0.006 011880 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 012025 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 22 23 45 0.045 0.000 0.022 012647 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 21 42 0.012 0.000 0.006 012712 CC 18 22 40 CT 3 0 3 TT 1 0 1 2.296 0.000 5.825 012814 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 22 43 0.012 0.000 0.006 012884 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 21 22 43 0.012 0.000 0.006 012960 GG 5 1 6 GT 12 6 18 TT 5 15 20 0.182 0.153 0.354 013109 CC 21 22 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 013405 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 19 21 40 0.000 0.012 0.006 013535 CC 13 1 14 CT 8 12 20 TT 1 9 10 0.027 1.455 0.306 013536 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 20 22 42 0.012 0.000 0.006 013724 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 21 21 42 0.000 0.012 0.006 013805 CC 18 22 40 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.124 0.000 0.056 013868 CC 20 22 42 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.024 014079 AA 20 16 36 AG 1 6 7 GG 0 0 0 0.012 0.548 0.338 014345 AA 19 22 41 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.152 014348 CC 0 0 0 CG 3 0 3 GG 21 22 43 0.107 0.000 0.052 014539 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 014792 CC 23 21 44 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 014815 GG 2 3 5 GT 15 10 25 TT 7 9 16 2.258 0.007 1.075 015270 CC 18 15 33 CT 6 6 12 TT 0 0 0 0.490 0.583 1.065 015511 GG 5 3 8 GT 13 10 23 TT 6 9 15 0.174 0.007 0.026 015524 CC 24 20 44 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.023 015635 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 21 45 0.000 0.012 0.006 015676 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 22 22 44 0.045 0.000 0.023 015802 CC 21 22 43 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.052 015833 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 21 44 0.011 0.000 0.006 015844 AA 13 7 20 AT 9 9 18 TT 2 6 8 0.061 0.714 1.181 015909 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 19 23 42 0.118 0.000 0.054 015954 CC 15 11 26 CG 6 9 15 GG 2 2 4 1.252 0.007 0.691 016306 CC 22 21 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 016463 AA 1 0 1 AG 6 0 6 GG 15 21 36 0.153 0.000 1.288 016614 CC 20 14 34 CT 2 6 8 TT 0 1 1 0.050 0.114 0.386 016783 AA 1 2 3 AG 3 9 12 GG 18 10 28 2.296 0.000 1.058 016800 CC 18 10 28 CT 3 9 12 TT 1 2 3 2.296 0.000 1.058 016874 AA 19 23 42 AT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 016953 AA 15 10 25 AG 7 10 17 GG 1 2 3 0.025 0.050 0.002 017082 AA 1 3 4 AG 7 10 17 GG 14 9 23 0.011 0.007 0.111 017139 -- 1 2 3 +- 3 10 13 ++ 19 10 29 2.457 0.050 0.792 017343 AA 18 9 27 AG 1 9 10 GG 1 2 3 8.183 0.013 1.914 017382 GG 0 0 0 GT 1 6 7 TT 19 15 34 0.013 0.583 0.357 017392 AA 18 10 28 AG 1 9 10 GG 1 2 3 8.183 0.000 2.048 017893 AA 0 1 1 AG 2 6 8 GG 15 12 27 0.066 0.048 0.181 017983 -- 0 0 0 +- 2 5 7 ++ 15 14 29 0.066 0.436 0.418 017995 CC 14 19 33 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.159 0.000 0.068 018143 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 19 18 37 0.000 0.014 0.007 018144 CC 15 9 24 CT 2 9 11 TT 1 2 3 3.445 0.013 1.053 018236 AA 1 1 2 AG 8 9 17 GG 10 9 19 0.140 0.436 0.535 018420 AA 17 19 36 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.059 0.000 0.028 018440 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 17 19 36 0.059 0.000 0.028 018763 CC 20 22 42 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.095 018804 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 24 20 44 0.000 0.050 0.023 018948 AA 21 22 43 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.052 018950 CC 20 22 42 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.095 019103 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 21 45 0.000 0.012 0.006 019199 AA 0 0 0 AG 5 4 9 GG 14 15 29 0.436 0.263 0.686 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002287: GGGGC 003040: ctgggt 004100: AGGTC 008623: CTTCCTTC 009598: GA 009734: CC 012025: T 012884: TCCT 017139: ga 017983: GAAGCCACAGTCCATTCATTGTAGGGAGTATGGACCAG 018143: C