Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000203 C 0.10 0.00 0.05 T 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 000375 T 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.21 0.00 0.11 000759 A 0.29 0.00 0.14 G 0.71 1.00 0.86 0.41 0.00 0.24 001215 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001361 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 002578 G 0.31 0.00 0.16 C 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 002783 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.07 003121 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 003147 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.05 003243 A 0.03 0.04 0.04 G 0.97 0.96 0.96 0.05 0.08 0.07 003268 A 0.03 0.04 0.04 G 0.97 0.96 0.96 0.05 0.08 0.07 003520 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003994 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004206 G 0.67 0.07 0.37 A 0.33 0.93 0.63 0.44 0.12 0.47 004460 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008873 - 0.28 0.02 0.15 + 0.72 0.98 0.85 0.41 0.04 0.26 009045 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009056 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009480 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009624 C 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 010017 T 0.42 0.00 0.21 G 0.58 1.00 0.79 0.49 0.00 0.33 010894 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010989 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011204 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011781 A 0.02 0.04 0.03 G 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 011834 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012714 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 013119 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 013679 T 0.00 0.12 0.06 C 1.00 0.88 0.94 0.00 0.21 0.11 013832 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014160 T 0.65 0.04 0.35 G 0.35 0.96 0.65 0.45 0.07 0.45 014219 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.07 0.00 0.04 014482 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015073 G 0.25 0.02 0.14 T 0.75 0.98 0.86 0.38 0.04 0.24 015127 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015166 G 0.83 0.07 0.46 C 0.17 0.93 0.54 0.28 0.12 0.50 015272 G 0.73 0.02 0.37 A 0.27 0.98 0.63 0.40 0.04 0.46 015286 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016066 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016101 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016341 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016403 + 0.50 0.00 0.26 - 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0.06 0.00 0.03 + 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 032757 T 0.39 0.00 0.20 C 0.61 1.00 0.80 0.48 0.00 0.31 032846 + 0.12 0.00 0.06 - 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 032929 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 033164 A 0.50 0.00 0.26 G 0.50 1.00 0.74 0.50 0.00 0.38 033416 T 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 033436 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033985 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 034546 - 0.50 0.05 0.28 + 0.50 0.95 0.72 0.50 0.09 0.40 035015 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.05 0.04 0.04 035190 T 0.55 0.00 0.26 C 0.45 1.00 0.74 0.50 0.00 0.38 035191 G 0.84 0.07 0.42 A 0.16 0.93 0.58 0.27 0.12 0.49 036248 G 0.50 0.00 0.27 A 0.50 1.00 0.73 0.50 0.00 0.40 036267 T 0.50 0.00 0.27 C 0.50 1.00 0.73 0.50 0.00 0.40 036411 G 0.17 0.03 0.10 A 0.83 0.97 0.90 0.29 0.05 0.19 036454 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 047070 T 0.50 0.00 0.26 C 0.50 1.00 0.74 0.50 0.00 0.39 047645 A 0.29 0.02 0.16 G 0.71 0.98 0.84 0.41 0.04 0.27 047769 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 047780 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 048219 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 048536 A 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 048748 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 049512 C 0.80 0.07 0.44 T 0.20 0.93 0.56 0.31 0.13 0.49 049650 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 049981 G 0.09 0.00 0.04 A 0.91 1.00 0.96 0.17 0.00 0.08 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 003520: t 008873: CAA 016403: t 030551: t 032127: CA 032846: AGGA 034546: caaa