Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 chi2 000126 ++ 0 0 0 +- 3 0 3 -- 21 22 43 0.107 0.000 0.052 000137 CC 21 14 35 CT 2 7 9 TT 0 1 1 0.048 0.011 0.207 000160 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 000162 AA 21 17 38 AG 2 6 8 GG 0 0 0 0.048 0.517 0.417 000320 AA 21 14 35 AG 2 8 10 GG 0 1 1 0.048 0.011 0.080 000774 AA 0 1 1 AG 2 7 9 GG 22 14 36 0.045 0.011 0.230 000861 CC 22 14 36 CT 2 7 9 TT 0 1 1 0.045 0.011 0.230 001299 ++ 19 16 35 +- 4 5 9 -- 0 0 0 0.209 0.383 0.571 001691 AA 22 13 35 AG 2 8 10 GG 0 1 1 0.045 0.027 0.080 001916 GG 21 22 43 GT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.052 001917 AA 21 17 38 AG 3 5 8 GG 0 0 0 0.107 0.362 0.417 002045 AA 21 22 43 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.052 002094 ++ 21 16 37 +- 2 5 7 -- 0 0 0 0.048 0.383 0.329 002697 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 22 43 0.107 0.000 0.052 002720 AA 6 1 7 AG 9 11 20 GG 9 10 19 1.361 0.889 0.206 003160 CC 19 12 31 CT 2 8 10 TT 0 1 1 0.053 0.053 0.032 003296 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 19 20 39 0.053 0.000 0.026 003302 CC 0 3 3 CT 8 8 16 TT 12 9 21 1.250 0.292 0.000 003452 ++ 0 0 0 +- 3 0 3 -- 21 23 44 0.107 0.000 0.051 003631 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 003711 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 004077 CC 22 14 36 CT 2 8 10 TT 0 1 1 0.045 0.011 0.094 004120 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 004463 AA 22 13 35 AC 2 7 9 CC 0 1 1 0.045 0.002 0.207 004803 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 004865 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 004891 AA 0 0 0 AC 0 3 3 CC 23 20 43 0.000 0.112 0.052 005079 CC 1 2 3 CT 12 13 25 TT 9 7 16 1.455 1.333 2.642 005111 AA 21 22 43 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.012 0.000 0.006 005238 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 005421 GG 1 1 2 GT 8 8 16 TT 15 13 28 0.003 0.027 0.023 005576 CC 0 1 1 CT 2 8 10 TT 19 13 32 0.053 0.027 0.043 005913 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 20 22 42 0.050 0.000 0.024 006424 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 20 18 38 0.000 0.014 0.007 006597 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 18 20 38 0.055 0.000 0.026 007070 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 21 44 0.000 0.012 0.006 007201 CC 1 0 1 CT 4 7 11 TT 16 12 28 1.037 0.969 0.004 007439 CC 19 22 41 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.053 0.000 0.024 007442 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 20 22 42 0.012 0.000 0.006 007862 AA 17 14 31 AG 5 8 13 GG 1 1 2 0.571 0.011 0.177 008032 GG 17 23 40 GT 5 0 5 TT 1 0 1 0.571 0.000 2.368 008882 CC 4 11 15 CG 6 11 17 GG 5 1 6 0.579 0.741 0.103 008883 GG 13 23 36 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.077 0.000 0.028 009559 CC 23 21 44 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 010067 ++ 0 1 1 +- 4 6 10 -- 19 12 31 0.209 0.048 0.032 010325 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 19 13 32 0.013 0.000 0.008 010659 AA 24 21 45 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.012 0.006 010709 CC 22 13 35 CT 2 8 10 TT 0 1 1 0.045 0.027 0.080 010825 CC 20 19 39 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.012 0.013 0.026 010843 CC 4 2 6 CT 12 9 21 TT 5 9 14 0.444 0.013 0.173 010987 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 20 20 40 0.012 0.000 0.006 011884 CC 19 18 37 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.118 0.000 0.061 012091 AA 14 13 27 AC 8 9 17 CC 1 1 2 0.011 0.130 0.110 012114 AA 21 23 44 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 012129 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 012361 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 012562 CC 19 23 42 CG 4 0 4 GG 0 0 0 0.209 0.000 0.095 012815 AA 0 1 1 AG 2 8 10 GG 20 11 31 0.050 0.089 0.032 012841 AA 0 1 1 AG 3 8 11 GG 19 11 30 0.118 0.089 0.000 012998 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 23 20 43 0.000 0.050 0.023 013291 AA 22 22 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 013408 CC 15 12 27 CT 8 8 16 TT 0 1 1 1.019 0.053 0.607 013805 CC 15 12 27 CT 9 9 18 TT 0 1 1 1.278 0.182 1.035 013836 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 014238 CC 14 13 27 CG 6 8 14 GG 0 1 1 0.623 0.027 0.275 014495 AA 14 12 26 AC 8 4 12 CC 1 1 2 0.011 0.617 0.156 014572 CC 23 20 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 014968 AA 14 13 27 AG 10 9 19 GG 0 1 1 1.662 0.130 1.280 015149 CC 24 21 45 CG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.048 0.022 015151 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 015243 CC 20 22 42 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.112 0.000 0.054 015304 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 18 23 41 0.342 0.000 0.152 015321 AA 23 22 45 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 015809 AA 19 22 41 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.152 015959 ++ 21 12 33 +- 3 9 12 -- 0 1 1 0.107 0.182 0.006 016158 CC 24 21 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 016259 CC 22 21 43 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 016417 AA 21 21 42 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.024 Note: ED : European Descent AD : African Descent pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000126: A 001299: G 002094: aa 003452: T 010067: A 015959: T