Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000127 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000198 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000221 T 0.17 0.07 0.12 C 0.83 0.93 0.88 0.28 0.12 0.21 000223 A 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 000614 G 0.15 0.39 0.27 A 0.85 0.61 0.73 0.25 0.48 0.39 000731 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000860 C 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 001365 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001514 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001691 C 0.06 0.02 0.04 T 0.94 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 001880 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002066 T 0.04 0.09 0.06 C 0.96 0.91 0.94 0.08 0.16 0.12 002418 G 0.11 0.00 0.05 C 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 002631 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003185 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003280 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003413 T 0.02 0.37 0.19 C 0.98 0.63 0.81 0.04 0.47 0.31 003455 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003714 G 0.02 0.07 0.04 C 0.98 0.93 0.96 0.04 0.13 0.08 003776 G 0.20 0.00 0.10 A 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 003795 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003807 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003856 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003858 T 0.17 0.39 0.28 C 0.83 0.61 0.72 0.29 0.47 0.40 003877 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003907 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004464 T 0.31 0.07 0.19 C 0.69 0.93 0.81 0.43 0.12 0.31 004586 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004913 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 005091 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 005156 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005278 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 005547 T 0.40 0.50 0.44 C 0.60 0.50 0.56 0.48 0.50 0.49 005770 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005845 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005953 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006023 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006078 A 0.02 0.37 0.20 G 0.98 0.63 0.80 0.04 0.47 0.31 006105 T 0.02 0.35 0.18 A 0.98 0.65 0.82 0.04 0.45 0.30 006413 - 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0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 021505 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 021576 G 0.25 0.07 0.16 A 0.75 0.93 0.84 0.38 0.12 0.27 021663 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021834 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 021895 G 0.25 0.07 0.16 A 0.75 0.93 0.84 0.38 0.13 0.27 022335 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 022821 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 023029 T 0.25 0.50 0.37 C 0.75 0.50 0.63 0.38 0.50 0.47 023220 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 023227 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 023283 G 0.24 0.25 0.24 C 0.76 0.75 0.76 0.36 0.38 0.37 023528 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 023636 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 023951 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 024254 C 0.02 0.07 0.04 A 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 024328 T 0.04 0.09 0.06 A 0.96 0.91 0.94 0.08 0.16 0.12 024558 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 024836 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025038 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025045 A 0.15 0.00 0.07 T 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 025159 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 025160 A 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 025165 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 025395 T 0.28 0.07 0.17 C 0.72 0.93 0.83 0.41 0.12 0.29 025504 G 0.40 0.33 0.36 A 0.60 0.67 0.64 0.48 0.44 0.46 025646 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 025659 T 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 025878 G 0.02 0.37 0.19 A 0.98 0.63 0.81 0.04 0.47 0.31 025891 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 026166 T 0.29 0.41 0.35 G 0.71 0.59 0.65 0.41 0.48 0.45 026259 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 027609 C 0.15 0.07 0.11 T 0.85 0.93 0.89 0.25 0.12 0.19 028391 T 0.13 0.07 0.10 C 0.87 0.93 0.90 0.23 0.12 0.18 028411 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 028979 T 0.15 0.07 0.11 C 0.85 0.93 0.89 0.26 0.12 0.19 029119 C 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 029130 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 029164 G 0.02 0.37 0.20 C 0.98 0.63 0.80 0.04 0.47 0.31 029439 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 029473 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 030344 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 030392 T 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 030459 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 030461 C 0.00 0.13 0.07 G 1.00 0.87 0.93 0.00 0.23 0.12 030527 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 032011 G 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 032201 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 032251 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 033510 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033555 C 0.35 0.35 0.35 T 0.65 0.65 0.65 0.45 0.45 0.45 033775 C 0.02 0.28 0.15 G 0.98 0.72 0.85 0.04 0.41 0.25 034001 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034076 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 034129 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 034150 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 034616 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 034875 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 035430 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 035786 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035861 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 035967 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 036073 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036088 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 036282 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 036371 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036487 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036954 T 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 037016 T 0.31 0.07 0.19 C 0.69 0.93 0.81 0.43 0.12 0.31 037130 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 037735 C 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 038119 A 0.00 0.13 0.06 C 1.00 0.87 0.94 0.00 0.23 0.12 038241 A 0.38 0.15 0.27 G 0.62 0.85 0.73 0.47 0.26 0.39 038313 A 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 038332 C 0.29 0.43 0.36 G 0.71 0.57 0.64 0.41 0.49 0.46 038365 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 038726 A 0.02 0.27 0.14 C 0.98 0.73 0.86 0.04 0.40 0.25 038926 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 039121 C 0.00 0.05 0.02 T 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 006413: t 007412: A 008166: C 012588: g 015978: tcagtgtgg 021248: a 021505: t Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 009775 G 0.02 0.00 0.01 A 0.17 0.00 0.09 C 0.81 1.00 0.90