Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000218 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000375 T 0.22 0.00 0.11 C 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.19 000945 A 0.07 0.29 0.16 C 0.93 0.71 0.84 0.12 0.42 0.27 000946 A 0.07 0.26 0.15 C 0.93 0.74 0.85 0.12 0.39 0.26 000956 A 0.07 0.29 0.16 C 0.93 0.71 0.84 0.12 0.42 0.27 000980 - 0.11 0.22 0.16 + 0.89 0.78 0.84 0.19 0.35 0.27 001123 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001193 G 0.21 0.00 0.11 C 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 001228 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001704 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001745 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001908 A 0.44 0.43 0.44 C 0.56 0.57 0.56 0.49 0.49 0.49 002195 T 0.06 0.24 0.15 C 0.94 0.76 0.85 0.12 0.36 0.25 002365 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002499 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 002531 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 002547 T 0.06 0.24 0.15 C 0.94 0.76 0.85 0.12 0.36 0.25 003011 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003028 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003074 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003339 T 0.21 0.52 0.36 C 0.79 0.48 0.64 0.33 0.50 0.46 003407 + 0.04 0.00 0.02 - 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003415 C 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 003496 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 003551 A 0.19 0.00 0.10 C 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.18 003586 A 0.12 0.40 0.26 G 0.88 0.60 0.74 0.22 0.48 0.38 003610 A 0.15 0.40 0.27 G 0.85 0.60 0.73 0.25 0.48 0.39 003742 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004157 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 004459 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004863 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004929 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005088 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005113 A 0.02 0.05 0.03 C 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.07 005145 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005395 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005833 T 0.26 0.04 0.15 C 0.74 0.96 0.85 0.39 0.08 0.26 006055 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006214 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006271 A 0.35 0.43 0.39 G 0.65 0.57 0.61 0.45 0.49 0.48 006591 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006672 G 0.00 0.04 0.02 A 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 006793 A 0.14 0.00 0.07 G 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.12 007252 G 0.13 0.39 0.27 C 0.87 0.61 0.73 0.23 0.47 0.39 007272 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007503 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 007740 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008162 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008189 A 0.25 0.04 0.15 C 0.75 0.96 0.85 0.38 0.08 0.25 008390 G 0.19 0.04 0.12 A 0.81 0.96 0.88 0.30 0.08 0.21 008593 A 0.18 0.00 0.09 C 0.82 1.00 0.91 0.30 0.00 0.16 008609 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009156 G 0.07 0.20 0.13 C 0.93 0.80 0.87 0.13 0.32 0.23 009254 A 0.31 0.42 0.37 C 0.69 0.57 0.63 0.43 0.49 0.46 009800 A 0.26 0.04 0.15 G 0.74 0.96 0.85 0.39 0.08 0.26 009822 * 009875 T 0.11 0.41 0.26 G 0.89 0.59 0.74 0.19 0.48 0.39 009894 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000980: gc 001745: a 003407: T 006055: ag Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 009822 C 0.00 0.02 0.01 A 0.20 0.52 0.36 G 0.80 0.46 0.63