Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000164 - 0.13 0.23 0.18 + 0.87 0.77 0.82 0.23 0.35 0.29 000322 A 0.15 0.23 0.18 G 0.85 0.77 0.82 0.25 0.35 0.30 000450 A 0.02 0.11 0.07 G 0.98 0.89 0.93 0.04 0.20 0.12 000497 A 0.39 0.16 0.28 G 0.61 0.84 0.72 0.48 0.27 0.40 000690 A 0.12 0.23 0.17 G 0.88 0.77 0.83 0.21 0.35 0.29 000974 G 0.12 0.18 0.15 C 0.88 0.82 0.85 0.21 0.30 0.26 001035 T 0.54 0.32 0.44 C 0.46 0.68 0.56 0.50 0.43 0.49 001244 G 0.10 0.11 0.10 A 0.90 0.89 0.90 0.17 0.20 0.19 001435 - 0.08 0.03 0.05 + 0.92 0.97 0.95 0.15 0.05 0.10 001605 T 0.14 0.21 0.18 G 0.86 0.79 0.82 0.24 0.34 0.29 001852 T 0.15 0.21 0.18 C 0.85 0.79 0.82 0.25 0.34 0.30 002054 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.07 002494 A 0.03 0.05 0.04 G 0.97 0.95 0.96 0.05 0.09 0.07 002566 T 0.40 0.43 0.41 C 0.60 0.57 0.59 0.48 0.49 0.49 002584 G 0.40 0.43 0.41 A 0.60 0.57 0.59 0.48 0.49 0.49 002647 T 0.17 0.19 0.18 C 0.82 0.81 0.82 0.29 0.31 0.30 002671 T 0.00 0.12 0.06 C 1.00 0.88 0.94 0.00 0.21 0.11 002733 C 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 003168 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 003220 T 0.11 0.15 0.13 C 0.89 0.85 0.87 0.20 0.26 0.23 003248 C 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 003328 T 0.39 0.50 0.44 C 0.61 0.50 0.56 0.48 0.50 0.49 003338 + 0.07 0.16 0.11 - 0.93 0.84 0.89 0.13 0.27 0.20 003340 - 0.05 0.15 0.10 + 0.95 0.85 0.90 0.09 0.26 0.18 003470 T 0.39 0.48 0.43 C 0.61 0.52 0.57 0.47 0.50 0.49 003551 G 0.50 0.30 0.40 A 0.50 0.70 0.60 0.50 0.42 0.48 003652 T 0.11 0.16 0.13 C 0.89 0.84 0.87 0.19 0.27 0.23 003822 G 0.47 0.26 0.37 A 0.53 0.74 0.63 0.50 0.39 0.47 003899 G 0.00 0.03 0.01 A 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.03 003901 A 0.20 0.00 0.10 G 0.80 1.00 0.90 0.32 0.00 0.18 003953 T 0.45 0.25 0.36 A 0.55 0.75 0.64 0.50 0.38 0.46 003955 - 0.48 0.33 0.40 + 0.52 0.67 0.60 0.50 0.44 0.48 004403 C 0.37 0.45 0.41 G 0.63 0.55 0.59 0.47 0.50 0.48 004404 A 0.37 0.45 0.41 G 0.63 0.55 0.59 0.47 0.50 0.48 004642 T 0.33 0.38 0.35 C 0.68 0.62 0.65 0.44 0.47 0.46 004683 C 0.33 0.38 0.35 G 0.68 0.62 0.65 0.44 0.47 0.46 004820 G 0.33 0.42 0.37 A 0.68 0.58 0.63 0.44 0.49 0.47 005016 A 0.41 0.48 0.44 G 0.59 0.52 0.56 0.48 0.50 0.49 005051 T 0.43 0.48 0.46 C 0.57 0.52 0.54 0.49 0.50 0.50 005228 A 0.40 0.48 0.44 C 0.60 0.52 0.56 0.48 0.50 0.49 005296 G 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 005349 G 0.36 0.46 0.41 A 0.64 0.54 0.59 0.46 0.50 0.48 005417 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005499 T 0.37 0.46 0.41 C 0.63 0.54 0.59 0.47 0.50 0.48 005757 T 0.15 0.46 0.30 C 0.85 0.54 0.70 0.25 0.50 0.42 005892 A 0.56 0.30 0.44 G 0.44 0.70 0.56 0.49 0.42 0.49 006040 A 0.17 0.45 0.30 G 0.83 0.55 0.70 0.28 0.50 0.42 006132 A 0.25 0.25 0.25 C 0.75 0.75 0.75 0.38 0.38 0.38 006312 A 0.26 0.25 0.26 G 0.74 0.75 0.74 0.39 0.38 0.38 007565 A 0.56 0.28 0.43 T 0.44 0.72 0.57 0.49 0.41 0.49 007578 C 0.56 0.28 0.43 T 0.44 0.72 0.57 0.49 0.41 0.49 007809 A 0.57 0.28 0.42 G 0.43 0.72 0.58 0.49 0.41 0.49 007931 A 0.55 0.30 0.42 G 0.45 0.70 0.58 0.50 0.42 0.49 007994 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.07 008055 T 0.61 0.30 0.44 C 0.39 0.70 0.56 0.48 0.42 0.49 008080 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008089 T 0.61 0.30 0.44 C 0.39 0.70 0.56 0.48 0.42 0.49 008176 A 0.61 0.30 0.44 G 0.39 0.70 0.56 0.48 0.42 0.49 008360 A 0.16 0.24 0.20 C 0.84 0.76 0.80 0.27 0.36 0.32 008409 C 0.18 0.00 0.08 T 0.82 1.00 0.92 0.30 0.00 0.15 008423 T 0.16 0.46 0.32 C 0.84 0.54 0.68 0.27 0.50 0.44 008515 C 0.24 0.24 0.24 T 0.76 0.76 0.76 0.36 0.36 0.36 008595 C 0.15 0.00 0.07 T 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 008622 G 0.56 0.30 0.44 A 0.44 0.70 0.56 0.49 0.42 0.49 008740 T 0.56 0.30 0.44 C 0.44 0.70 0.56 0.49 0.42 0.49 008741 G 0.56 0.30 0.44 A 0.44 0.70 0.56 0.49 0.42 0.49 008752 C 0.56 0.30 0.44 T 0.44 0.70 0.56 0.49 0.42 0.49 008765 T 0.56 0.30 0.44 A 0.44 0.70 0.56 0.49 0.42 0.49 008939 C 0.27 0.24 0.26 T 0.73 0.76 0.74 0.39 0.36 0.38 008990 A 0.17 0.46 0.31 T 0.83 0.54 0.69 0.28 0.50 0.43 009607 C 0.56 0.26 0.42 T 0.44 0.74 0.58 0.49 0.39 0.49 009677 A 0.56 0.26 0.42 G 0.44 0.74 0.58 0.49 0.39 0.49 009837 T 0.57 0.29 0.43 C 0.43 0.71 0.57 0.49 0.41 0.49 010049 A 0.56 0.30 0.44 T 0.44 0.70 0.56 0.49 0.42 0.49 010585 G 0.12 0.18 0.15 T 0.88 0.82 0.85 0.21 0.30 0.26 010693 T 0.52 0.33 0.43 C 0.48 0.68 0.57 0.50 0.44 0.49 010735 G 0.11 0.00 0.06 T 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 010831 C 0.52 0.33 0.43 A 0.48 0.68 0.57 0.50 0.44 0.49 010845 G 0.55 0.33 0.44 T 0.45 0.68 0.56 0.50 0.44 0.49 010863 A 0.20 0.00 0.10 G 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.19 011048 C 0.27 0.24 0.26 G 0.73 0.76 0.74 0.39 0.36 0.38 011178 A 0.10 0.15 0.13 G 0.90 0.85 0.87 0.19 0.26 0.22 011356 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011863 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011912 G 0.27 0.25 0.26 A 0.73 0.75 0.74 0.39 0.38 0.39 012470 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012534 A 0.23 0.26 0.24 G 0.77 0.74 0.76 0.35 0.39 0.37 012585 G 0.30 0.26 0.28 A 0.70 0.74 0.72 0.42 0.39 0.40 012879 + 0.00 0.02 0.01 - 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 013096 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 013136 - 0.11 0.30 0.21 + 0.89 0.70 0.79 0.19 0.42 0.33 013297 G 0.15 0.46 0.30 A 0.85 0.54 0.70 0.26 0.50 0.42 013357 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 013434 A 0.28 0.24 0.26 G 0.72 0.76 0.74 0.41 0.36 0.39 013754 A 0.15 0.46 0.30 G 0.85 0.54 0.70 0.25 0.50 0.42 013786 T 0.56 0.32 0.45 G 0.44 0.68 0.55 0.49 0.43 0.49 014041 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014177 T 0.22 0.00 0.11 C 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.20 014274 - 0.09 0.17 0.12 + 0.91 0.83 0.88 0.16 0.28 0.22 014275 G 0.13 0.41 0.26 A 0.87 0.59 0.74 0.23 0.48 0.38 014393 T 0.07 0.00 0.04 C 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.08 014468 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 014567 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 014700 + 0.17 0.46 0.33 - 0.82 0.54 0.67 0.29 0.50 0.44 014735 C 0.19 0.48 0.33 T 0.81 0.52 0.67 0.30 0.50 0.44 014823 A 0.19 0.48 0.33 G 0.81 0.52 0.67 0.30 0.50 0.44 014927 C 0.27 0.24 0.26 A 0.73 0.76 0.74 0.39 0.36 0.38 015115 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 015195 C 0.38 0.19 0.28 A 0.62 0.81 0.72 0.47 0.31 0.40 015395 A 0.23 0.00 0.11 G 0.78 1.00 0.89 0.35 0.00 0.19 015406 G 0.05 0.23 0.14 A 0.95 0.77 0.86 0.10 0.35 0.24 015628 + 0.12 0.00 0.06 - 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.11 015913 T 0.17 0.43 0.30 C 0.83 0.57 0.70 0.29 0.49 0.42 015920 G 0.17 0.43 0.30 C 0.83 0.57 0.70 0.29 0.49 0.42 015947 T 0.57 0.31 0.44 C 0.43 0.69 0.56 0.49 0.43 0.49 015988 C 0.59 0.32 0.46 T 0.41 0.68 0.54 0.48 0.43 0.50 016090 A 0.15 0.43 0.29 C 0.85 0.57 0.71 0.26 0.49 0.41 016280 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 016283 T 0.26 0.25 0.26 G 0.74 0.75 0.74 0.39 0.38 0.38 016373 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016460 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 016531 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016537 T 0.19 0.24 0.21 C 0.81 0.76 0.79 0.30 0.36 0.33 016709 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016731 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016811 T 0.25 0.24 0.24 C 0.75 0.76 0.76 0.38 0.36 0.37 016857 T 0.25 0.24 0.24 A 0.75 0.76 0.76 0.38 0.36 0.37 016907 T 0.17 0.46 0.31 C 0.83 0.54 0.69 0.28 0.50 0.43 017190 A 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 017301 C 0.27 0.24 0.26 T 0.73 0.76 0.74 0.40 0.36 0.38 017395 G 0.26 0.24 0.25 A 0.74 0.76 0.75 0.39 0.36 0.38 017502 T 0.05 0.16 0.10 C 0.95 0.84 0.90 0.09 0.27 0.18 017548 T 0.07 0.00 0.04 C 0.93 1.00 0.96 0.14 0.00 0.07 017576 T 0.26 0.21 0.24 C 0.74 0.79 0.76 0.39 0.34 0.36 017610 C 0.26 0.25 0.26 T 0.74 0.75 0.74 0.39 0.38 0.38 017689 T 0.27 0.24 0.26 C 0.73 0.76 0.74 0.39 0.36 0.38 017816 A 0.25 0.24 0.24 G 0.75 0.76 0.76 0.38 0.36 0.37 017817 T 0.19 0.24 0.21 C 0.81 0.76 0.79 0.30 0.36 0.33 017833 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017859 C 0.27 0.24 0.26 G 0.73 0.76 0.74 0.39 0.36 0.38 017904 + 0.25 0.23 0.24 - 0.75 0.77 0.76 0.38 0.35 0.36 017946 A 0.02 0.05 0.03 C 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.06 017958 T 0.25 0.23 0.24 C 0.75 0.77 0.76 0.38 0.35 0.36 018007 A 0.25 0.23 0.24 G 0.75 0.77 0.76 0.38 0.35 0.36 018059 G 0.27 0.23 0.25 A 0.73 0.77 0.75 0.39 0.35 0.38 018060 C 0.27 0.23 0.25 A 0.73 0.77 0.75 0.39 0.35 0.38 018071 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018190 G 0.25 0.23 0.24 T 0.75 0.77 0.76 0.38 0.35 0.36 018517 T 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 018582 G 0.27 0.26 0.27 T 0.73 0.74 0.73 0.39 0.39 0.39 019020 T 0.19 0.24 0.21 C 0.81 0.76 0.79 0.30 0.36 0.33 019311 A 0.26 0.24 0.25 G 0.74 0.76 0.75 0.39 0.36 0.38 019340 C 0.26 0.24 0.25 T 0.74 0.76 0.75 0.39 0.36 0.38 019355 G 0.26 0.24 0.25 T 0.74 0.76 0.75 0.39 0.36 0.38 019467 + 0.26 0.24 0.25 - 0.74 0.76 0.75 0.39 0.36 0.38 019523 C 0.17 0.44 0.31 T 0.83 0.56 0.69 0.28 0.49 0.42 019548 T 0.12 0.14 0.13 C 0.88 0.86 0.87 0.22 0.24 0.23 019670 + 0.20 0.30 0.25 - 0.80 0.70 0.75 0.31 0.42 0.38 019876 T 0.24 0.30 0.27 C 0.76 0.70 0.73 0.36 0.42 0.39 019906 A 0.10 0.42 0.26 G 0.90 0.57 0.74 0.17 0.49 0.38 019989 A 0.28 0.00 0.14 C 0.72 1.00 0.86 0.40 0.00 0.24 020020 A 0.24 0.26 0.25 C 0.76 0.74 0.75 0.36 0.39 0.38 020097 A 0.25 0.28 0.26 G 0.75 0.72 0.74 0.38 0.40 0.39 020146 + 0.30 0.32 0.31 - 0.70 0.68 0.69 0.42 0.43 0.43 020182 G 0.48 0.25 0.36 A 0.52 0.75 0.64 0.50 0.38 0.46 020203 T 0.25 0.00 0.12 C 0.75 1.00 0.88 0.38 0.00 0.22 020301 T 0.21 0.00 0.11 G 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 020348 A 0.17 0.24 0.20 T 0.83 0.76 0.80 0.28 0.36 0.32 020419 - 0.08 0.00 0.04 + 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 020422 C 0.48 0.24 0.36 T 0.52 0.76 0.64 0.50 0.36 0.46 020424 + 0.04 0.00 0.02 - 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 020438 T 0.23 0.00 0.12 C 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 020447 A 0.21 0.24 0.22 G 0.79 0.76 0.78 0.33 0.36 0.35 020485 T 0.17 0.24 0.20 C 0.83 0.76 0.80 0.28 0.36 0.32 020494 G 0.25 0.24 0.24 C 0.75 0.76 0.76 0.38 0.36 0.37 020527 G 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 020530 G 0.23 0.00 0.12 A 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 020539 T 0.23 0.00 0.12 C 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 020705 G 0.48 0.24 0.36 A 0.52 0.76 0.64 0.50 0.36 0.46 020752 C 0.17 0.24 0.20 T 0.83 0.76 0.80 0.28 0.36 0.32 020852 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 020887 G 0.23 0.00 0.12 A 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 020976 A 0.14 0.26 0.20 G 0.86 0.74 0.80 0.24 0.39 0.32 021043 A 0.17 0.42 0.30 G 0.83 0.58 0.70 0.28 0.49 0.42 021045 G 0.50 0.26 0.38 A 0.50 0.74 0.62 0.50 0.39 0.47 021047 A 0.11 0.00 0.05 G 0.89 1.00 0.95 0.20 0.00 0.10 021150 G 0.53 0.26 0.39 A 0.47 0.74 0.61 0.50 0.39 0.48 021160 A 0.24 0.00 0.12 G 0.76 1.00 0.88 0.36 0.00 0.21 021209 G 0.53 0.26 0.39 A 0.47 0.74 0.61 0.50 0.39 0.48 021270 G 0.29 0.26 0.28 A 0.71 0.74 0.72 0.41 0.39 0.40 021272 A 0.29 0.26 0.28 G 0.71 0.74 0.72 0.41 0.39 0.40 021404 T 0.23 0.15 0.19 C 0.78 0.85 0.81 0.35 0.26 0.30 021419 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021463 G 0.23 0.00 0.12 C 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 021532 T 0.02 0.07 0.04 C 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 021583 A 0.17 0.24 0.21 T 0.83 0.76 0.79 0.29 0.36 0.33 021594 T 0.22 0.00 0.11 C 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.19 021618 A 0.13 0.24 0.18 G 0.87 0.76 0.82 0.23 0.36 0.30 021640 A 0.22 0.00 0.11 G 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.19 021705 A 0.02 0.09 0.05 C 0.98 0.91 0.95 0.04 0.16 0.10 021708 T 0.17 0.24 0.21 C 0.83 0.76 0.79 0.29 0.36 0.33 021733 A 0.22 0.00 0.11 C 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.19 021740 C 0.22 0.00 0.11 G 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.19 021766 A 0.17 0.24 0.21 G 0.83 0.76 0.79 0.29 0.36 0.33 021867 A 0.22 0.00 0.11 G 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.19 021996 - 0.04 0.15 0.10 + 0.96 0.85 0.90 0.08 0.26 0.18 022033 A 0.25 0.00 0.13 G 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 022053 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 022162 G 0.52 0.24 0.39 A 0.48 0.76 0.61 0.50 0.36 0.48 022204 - 0.34 0.24 0.29 + 0.66 0.76 0.71 0.45 0.36 0.41 022490 - 0.46 0.46 0.46 + 0.54 0.54 0.54 0.50 0.50 0.50 022518 C 0.20 0.10 0.15 T 0.80 0.90 0.85 0.32 0.18 0.26 022962 - 0.09 0.00 0.05 + 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 023043 G 0.45 0.26 0.36 T 0.55 0.74 0.64 0.50 0.39 0.46 023339 T 0.25 0.24 0.24 C 0.75 0.76 0.76 0.38 0.36 0.37 023340 A 0.23 0.00 0.12 G 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 023408 T 0.23 0.00 0.12 C 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 023413 C 0.25 0.24 0.24 A 0.75 0.76 0.76 0.38 0.36 0.37 023444 T 0.25 0.22 0.23 C 0.75 0.78 0.77 0.38 0.34 0.36 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000164: CCCTTCCT 001435: TGAGGAATTGCCACAATTTTTTCCTGCGCCTGCACC 003338: a 003340: tg 003955: T 005417: T 012879: TAAA 013136: GGCAGTTT 014274: TAGTGGTGGGCG 014700: GG 015628: t 017833: T 017904: GTGTGGACAGAAG 019467: C 019670: CCC 020146: G 020419: T 020424: TGGGCTCG 021996: C 022204: CACA 022490: CACA 022962: ACACACAGACACATAGA