Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000023 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000316 G 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.07 000356 A 0.09 0.00 0.05 T 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 000466 A 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 000497 A 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.10 0.05 000529 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000674 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002420 C 0.25 0.00 0.12 A 0.75 1.00 0.88 0.38 0.00 0.22 009839 A 0.40 0.00 0.23 G 0.60 1.00 0.77 0.48 0.00 0.35 010104 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.17 0.00 0.08 010213 C 0.52 0.00 0.26 T 0.48 1.00 0.74 0.50 0.00 0.39 010991 A 0.23 0.00 0.12 G 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 011251 T 0.24 0.00 0.12 C 0.76 1.00 0.88 0.36 0.00 0.21 011739 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012171 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 012304 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012381 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012399 G 0.21 0.00 0.11 C 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 012466 A 0.25 0.00 0.13 G 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 012606 G 0.18 0.00 0.07 C 0.82 1.00 0.93 0.29 0.00 0.13 012618 A 0.18 0.00 0.07 T 0.82 1.00 0.93 0.29 0.00 0.13 012766 A 0.15 0.00 0.06 G 0.85 1.00 0.94 0.25 0.00 0.12 012930 + 0.18 0.00 0.09 - 0.82 1.00 0.91 0.30 0.00 0.16 013011 G 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 013519 C 0.23 0.00 0.11 T 0.78 1.00 0.89 0.35 0.00 0.20 013555 A 0.23 0.00 0.11 G 0.78 1.00 0.89 0.35 0.00 0.20 013714 A 0.23 0.00 0.11 G 0.78 1.00 0.89 0.35 0.00 0.20 013849 A 0.20 0.00 0.10 G 0.80 1.00 0.90 0.32 0.00 0.18 014076 G 0.25 0.00 0.13 A 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 014082 T 0.54 0.00 0.28 C 0.46 1.00 0.72 0.50 0.00 0.40 014138 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 014319 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014357 A 0.25 0.02 0.14 G 0.75 0.98 0.86 0.38 0.04 0.24 014700 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015102 G 0.54 0.00 0.28 A 0.46 1.00 0.72 0.50 0.00 0.40 015539 C 0.29 0.03 0.17 A 0.71 0.97 0.83 0.41 0.06 0.28 015957 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 016032 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 016166 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 016167 G 0.23 0.00 0.12 C 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 016209 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 016301 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 016451 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016514 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016629 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016700 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 016777 A 0.25 0.00 0.12 G 0.75 1.00 0.88 0.38 0.00 0.22 016858 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 017136 T 0.15 0.00 0.08 A 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 017277 G 0.57 0.00 0.28 T 0.43 1.00 0.72 0.49 0.00 0.41 017579 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018737 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018880 G 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 018909 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 019035 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 019108 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019559 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021112 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021213 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021289 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 021445 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022269 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 022476 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 023185 A 0.25 0.17 0.21 G 0.75 0.83 0.79 0.38 0.29 0.33 023554 A 0.21 0.15 0.18 C 0.79 0.85 0.82 0.33 0.26 0.30 023618 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 023639 T 0.08 0.07 0.07 C 0.92 0.93 0.93 0.15 0.12 0.14 023727 T 0.07 0.07 0.07 C 0.93 0.93 0.93 0.12 0.12 0.12 023837 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 023849 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 023873 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 024314 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 024320 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 024322 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 031176 G 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 031295 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 031836 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031903 A 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 032303 T 0.35 0.28 0.32 C 0.65 0.72 0.68 0.46 0.41 0.43 032750 A 0.00 0.25 0.12 G 1.00 0.75 0.88 0.00 0.38 0.21 033844 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 037251 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 040404 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 040470 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 040537 A 0.17 0.22 0.20 G 0.83 0.78 0.80 0.29 0.34 0.31 041303 A 0.02 0.35 0.18 C 0.98 0.65 0.82 0.04 0.45 0.30 041357 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 041420 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 041692 G 0.23 0.61 0.41 A 0.77 0.39 0.59 0.35 0.48 0.49 041796 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 041862 - 0.33 0.67 0.50 + 0.67 0.33 0.50 0.44 0.44 0.50 042535 G 0.06 0.22 0.14 C 0.94 0.78 0.86 0.12 0.34 0.24 042746 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042834 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042855 C 0.35 0.41 0.38 G 0.65 0.59 0.62 0.46 0.48 0.47 042871 - 0.04 0.39 0.21 + 0.96 0.61 0.79 0.08 0.48 0.33 043124 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 044024 C 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.05 045354 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 045398 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 045586 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 045675 G 0.04 0.39 0.21 A 0.96 0.61 0.79 0.08 0.48 0.33 046524 + 0.00 0.02 0.01 - 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 048297 G 0.04 0.39 0.22 A 0.96 0.61 0.78 0.08 0.48 0.34 048330 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 048750 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 049374 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 050080 T 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 051350 G 0.06 0.22 0.14 A 0.94 0.78 0.86 0.12 0.34 0.24 051435 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 051669 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 053071 T 0.41 0.36 0.39 C 0.59 0.64 0.61 0.48 0.46 0.48 054006 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 054040 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 054670 G 0.00 0.43 0.20 A 1.00 0.57 0.80 0.00 0.49 0.33 054771 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 055162 G 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 055338 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 055927 - 0.08 0.00 0.04 + 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 056040 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 056355 A 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 056510 T 0.60 0.24 0.43 A 0.40 0.76 0.57 0.48 0.36 0.49 056901 T 0.00 0.39 0.19 G 1.00 0.61 0.81 0.00 0.48 0.31 058237 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 059634 T 0.41 0.02 0.22 C 0.59 0.98 0.78 0.48 0.04 0.35 062175 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 062274 C 0.45 0.18 0.32 T 0.55 0.82 0.68 0.49 0.29 0.43 063723 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 063788 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 063843 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 063945 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 064097 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 064397 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 065145 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 065204 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 065893 T 0.29 0.00 0.16 G 0.71 1.00 0.84 0.42 0.00 0.27 065954 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.11 0.00 0.06 066022 C 0.00 0.29 0.13 T 1.00 0.71 0.87 0.00 0.41 0.22 066761 T 0.59 0.36 0.48 C 0.41 0.64 0.52 0.48 0.46 0.50 066773 T 0.25 0.00 0.12 C 0.75 1.00 0.88 0.38 0.00 0.21 066881 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 066913 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 012930: T 015957: ccttgct 041862: ACCCCCAGGGACCCCTGCCCTCCTCACCGCCTCTGTCCGTGAATGCAGGGGG 042871: TGCATCTCCCCAGCTACGTCAAGGAGAGGTTCCTCTTACCAGAAACTCGCTGGCCGTGGTCGGCCTCCCGCCAGGAGCCCTGCATCTCCCCAGCTACGTCAAGGAGAGGTTCCTCTCACCAGAACCTTGCTGGCCGTGGTCGGCCTCCCGCCAGGAGCCCTGCATCTCCCCAGCTACGTCAAGGAGAGGTTCCTCTCACCAGAACCTCGCTGGCCAGGGTCGGCCTCCCGCCAGGAGCCCTGCATCTCCC 046524: t 055927: tgg